12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0890 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0890  amino acid-binding ACT domain-containing protein  100 
 
 		 148 aa  285  2e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0186832 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0227  amino acid-binding ACT domain-containing protein  87.07 
 
 		 151 aa  255  1e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2975  conserved hypothetical protein-like protein  35.71 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1001  hypothetical protein  34.48 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321285 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2664  hypothetical protein  37.29 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2155  hypothetical protein  32.06 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2687  amino acid-binding ACT domain protein  33.85 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3125  hypothetical protein  35.82 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.104466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4678  hypothetical protein  34.92 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00453066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1511  hypothetical protein  33.33 
 
 		 123 aa  40.8  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128946  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1749  hypothetical protein  33.9 
 
 		 136 aa  40.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.153777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25270  hypothetical protein  33.83 
 
 		 130 aa  40.4  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.37988  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>