33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1603 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1603  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  267  2.9999999999999997e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000462235  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3135  hypothetical protein  69.23 
 
 		 131 aa  181  4.0000000000000006e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1913  hypothetical protein  69.47 
 
 		 131 aa  179  1e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.307304  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0767  transporter  67.94 
 
 		 131 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0100171  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0329  hypothetical protein  62.88 
 
 		 132 aa  154  3e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1461  hypothetical protein  58.78 
 
 		 132 aa  148  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2800  hypothetical protein  48.85 
 
 		 132 aa  124  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4484  hypothetical protein  50.38 
 
 		 133 aa  124  5e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104569 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4935  hypothetical protein  49.24 
 
 		 133 aa  120  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.70091  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3028  hypothetical protein  48.89 
 
 		 135 aa  119  9e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.398731 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1115  hypothetical protein  48.85 
 
 		 137 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.410877 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00684  hypothetical protein  47.33 
 
 		 132 aa  117  6e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2811  Dihydrofolate reductase  53.23 
 
 		 292 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000627481  hitchhiker  0.0000305943 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4678  hypothetical protein  44.27 
 
 		 135 aa  111  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00453066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0877  hypothetical protein  44.27 
 
 		 141 aa  108  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4867  hypothetical protein  44.27 
 
 		 130 aa  108  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.327119  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1226  GCN5-related N-acetyltransferase  44.85 
 
 		 314 aa  107  6e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000639538 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56750  hypothetical protein  48.85 
 
 		 133 aa  106  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2155  hypothetical protein  45.74 
 
 		 133 aa  103  6e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1153  GCN5-related N-acetyltransferase  46.62 
 
 		 331 aa  103  8e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0563526  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1683  hypothetical protein  38.81 
 
 		 135 aa  100  6e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.727373 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6513  hypothetical protein  40.77 
 
 		 132 aa  100  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1749  hypothetical protein  42.19 
 
 		 136 aa  92  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.153777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6119  hypothetical protein  47.58 
 
 		 136 aa  89.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1959  hypothetical protein  47.58 
 
 		 136 aa  89.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5270  hypothetical protein  46.77 
 
 		 136 aa  88.6  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2664  hypothetical protein  40.94 
 
 		 143 aa  85.9  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1947  hypothetical protein  46.83 
 
 		 158 aa  85.9  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1874  hypothetical protein  46.83 
 
 		 136 aa  85.5  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.636885  normal  0.0948364 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1983  hypothetical protein  45.16 
 
 		 136 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.12182 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1423  hypothetical protein  39.68 
 
 		 138 aa  80.1  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.969669  hitchhiker  0.000000364034 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2290  Protein of unknown function DUF2241  36.36 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.257133  normal  0.718354 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2975  conserved hypothetical protein-like protein  28.83 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>