33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_56750 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_56750  hypothetical protein  100 
 
 
133 aa  266  5e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4935  hypothetical protein  93.23 
 
 
133 aa  251  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.70091  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4484  hypothetical protein  67.42 
 
 
133 aa  189  8e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.104569 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3028  hypothetical protein  58.91 
 
 
135 aa  170  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.398731 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2800  hypothetical protein  55.47 
 
 
132 aa  156  7e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1115  hypothetical protein  58.33 
 
 
137 aa  153  9e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.410877 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0329  hypothetical protein  57.25 
 
 
132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0877  hypothetical protein  52.71 
 
 
141 aa  137  3e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4867  hypothetical protein  45.74 
 
 
130 aa  135  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.327119  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4678  hypothetical protein  50.38 
 
 
135 aa  127  6e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00453066  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1226  GCN5-related N-acetyltransferase  52.27 
 
 
314 aa  125  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000639538 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3135  hypothetical protein  49.62 
 
 
131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6119  hypothetical protein  57.48 
 
 
136 aa  123  7e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1959  hypothetical protein  57.48 
 
 
136 aa  123  7e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1983  hypothetical protein  55.81 
 
 
136 aa  121  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.12182 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5270  hypothetical protein  55.81 
 
 
136 aa  120  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1153  GCN5-related N-acetyltransferase  51.91 
 
 
331 aa  120  5e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0563526  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1683  hypothetical protein  47.33 
 
 
135 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.727373 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1603  hypothetical protein  48.85 
 
 
133 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000462235  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1874  hypothetical protein  55.04 
 
 
136 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.636885  normal  0.0948364 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0767  transporter  50 
 
 
131 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0100171  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1947  hypothetical protein  54.26 
 
 
158 aa  116  9e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2155  hypothetical protein  45.8 
 
 
133 aa  115  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1913  hypothetical protein  44.12 
 
 
131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.307304  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1749  hypothetical protein  47.62 
 
 
136 aa  114  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.153777  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6513  hypothetical protein  46.88 
 
 
132 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1461  hypothetical protein  44.62 
 
 
132 aa  110  5e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2664  hypothetical protein  45.97 
 
 
143 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618681  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2811  Dihydrofolate reductase  52.42 
 
 
292 aa  103  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000627481  hitchhiker  0.0000305943 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00684  hypothetical protein  45.04 
 
 
132 aa  98.6  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1423  hypothetical protein  46.15 
 
 
138 aa  87.4  7e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.969669  hitchhiker  0.000000364034 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2290  Protein of unknown function DUF2241  46.51 
 
 
134 aa  84.3  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.257133  normal  0.718354 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2975  conserved hypothetical protein-like protein  32.97 
 
 
127 aa  43.9  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>