31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_5030 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_5030  hypothetical protein  100 
 
 
127 aa  246  6e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0496601 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4520  hypothetical protein  88.98 
 
 
134 aa  223  6e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1001  hypothetical protein  42.52 
 
 
129 aa  93.2  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00321285 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3125  hypothetical protein  40 
 
 
134 aa  87  8e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.104466  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2883  hypothetical protein  36.72 
 
 
134 aa  76.6  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0829751  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2742  hypothetical protein  36.22 
 
 
126 aa  74.3  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2015  amino acid-binding ACT domain-containing protein  34.13 
 
 
128 aa  71.6  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1867  hypothetical protein  30.95 
 
 
130 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000167229 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2687  amino acid-binding ACT domain protein  31.03 
 
 
130 aa  69.7  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2413  hypothetical protein  32.17 
 
 
128 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.753128  hitchhiker  0.00000411469 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25270  hypothetical protein  42.06 
 
 
130 aa  67  0.00000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.37988  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2193  hypothetical protein  30.77 
 
 
128 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00118901 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1996  hypothetical protein  27.78 
 
 
128 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0107  hypothetical protein  39.05 
 
 
131 aa  63.5  0.0000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2359  amino acid-binding ACT domain-containing protein  26.19 
 
 
131 aa  60.5  0.000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2464  amino acid-binding ACT domain protein  26.19 
 
 
131 aa  60.5  0.000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00361411  normal  0.291294 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2348  amino acid-binding ACT domain-containing protein  26.19 
 
 
131 aa  60.5  0.000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0598087  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1999  hypothetical protein  25.4 
 
 
131 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000289141 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1266  hypothetical protein  32.58 
 
 
125 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.307695  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2239  hypothetical protein  29.79 
 
 
128 aa  56.6  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2117  hypothetical protein  26.98 
 
 
131 aa  56.6  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1844  hypothetical protein  24.6 
 
 
131 aa  55.1  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1766  hypothetical protein  24.6 
 
 
131 aa  55.1  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.645552  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1652  hypothetical protein  29.79 
 
 
132 aa  54.3  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46182  predicted protein  32.73 
 
 
379 aa  54.3  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2255  hypothetical protein  25.42 
 
 
131 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.289641 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2508  hypothetical protein  31.36 
 
 
127 aa  52.8  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000270172  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3142  hypothetical protein  39.25 
 
 
149 aa  52.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30971  normal  0.0874691 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1913  hypothetical protein  25.2 
 
 
123 aa  51.6  0.000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1511  hypothetical protein  29.21 
 
 
123 aa  50.4  0.000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128946  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0710  hypothetical protein  25.4 
 
 
136 aa  47.4  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>