21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7650 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7650  hypothetical protein  100 
 
 
126 aa  244  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0312  hypothetical protein  58.12 
 
 
135 aa  126  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.784032  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3125  hypothetical protein  39.06 
 
 
134 aa  65.5  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.104466  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2015  amino acid-binding ACT domain-containing protein  32 
 
 
128 aa  57.4  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1001  hypothetical protein  33.94 
 
 
129 aa  52.4  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00321285 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25270  hypothetical protein  40.5 
 
 
130 aa  52  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.37988  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2508  hypothetical protein  34.4 
 
 
127 aa  49.7  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000270172  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4520  hypothetical protein  34.71 
 
 
134 aa  46.6  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2883  hypothetical protein  41 
 
 
134 aa  47  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0829751  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1266  hypothetical protein  34.43 
 
 
125 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.307695  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2687  amino acid-binding ACT domain protein  37.74 
 
 
130 aa  44.7  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2117  hypothetical protein  33.33 
 
 
131 aa  43.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1867  hypothetical protein  31.48 
 
 
130 aa  42.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000167229 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26520  hypothetical protein  29.06 
 
 
128 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0892158  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1844  hypothetical protein  31.48 
 
 
131 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2255  hypothetical protein  33.33 
 
 
131 aa  42  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.289641 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1766  hypothetical protein  31.48 
 
 
131 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.645552  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5030  hypothetical protein  33.88 
 
 
127 aa  41.6  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0496601 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2239  hypothetical protein  31.48 
 
 
128 aa  42  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0107  hypothetical protein  31.93 
 
 
131 aa  41.6  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2742  hypothetical protein  42.86 
 
 
126 aa  41.6  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>