More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1415 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1415  50S ribosomal protein L27  100 
 
 		 85 aa  170  5e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1537  50S ribosomal protein L27  77.65 
 
 		 85 aa  135  3.0000000000000003e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1725  50S ribosomal protein L27  76.47 
 
 		 85 aa  134  5e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0090  50S ribosomal protein L27  77.38 
 
 		 84 aa  133  8e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0327893  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0184  50S ribosomal protein L27  77.38 
 
 		 84 aa  133  8e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0130  50S ribosomal protein L27  77.38 
 
 		 84 aa  133  8e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0099  50S ribosomal protein L27  77.38 
 
 		 84 aa  133  8e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0503  ribosomal protein L27  76.19 
 
 		 85 aa  132  9.999999999999999e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0996  50S ribosomal protein L27  76.47 
 
 		 85 aa  132  1.9999999999999998e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1341  50S ribosomal protein L27  74.12 
 
 		 85 aa  128  2.0000000000000002e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00883743  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2143  50S ribosomal protein L27  69.41 
 
 		 90 aa  122  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.672881 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1461  50S ribosomal protein L27  69.41 
 
 		 89 aa  121  4e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0317862 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0424  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 		 92 aa  120  5e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.85685  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4921  50S ribosomal protein L27  69.41 
 
 		 88 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0271507  normal  0.71556 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3242  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 		 95 aa  119  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2785  50S ribosomal protein L27  68.24 
 
 		 89 aa  119  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0242571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4287  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 		 90 aa  119  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.835773  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3640  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 		 88 aa  118  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.320466  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4876  50S ribosomal protein L27  69.41 
 
 		 88 aa  118  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.387156 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1515  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 		 93 aa  118  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0090282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4413  50S ribosomal protein L27  69.41 
 
 		 88 aa  118  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0310  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 		 89 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0417  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 		 91 aa  117  4.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.302693 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3460  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 		 89 aa  117  4.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159862  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1482  50S ribosomal protein L27  70.59 
 
 		 93 aa  117  6e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3282  50S ribosomal protein L27  69.51 
 
 		 91 aa  116  7.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0455195 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0163  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 85 aa  116  7.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000390958  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3196  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 		 85 aa  116  9e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000840306  unclonable  7.875010000000001e-24 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3892  50S ribosomal protein L27  69.14 
 
 		 89 aa  115  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.624543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2237  ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 91 aa  116  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0647  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 		 89 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.908873 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3006  50S ribosomal protein L27  67.06 
 
 		 89 aa  115  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.549132 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3235  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 		 85 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000158281  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3589  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 84 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000197888  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1241  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 		 85 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.572861  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0146  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 		 85 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1201  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 		 89 aa  114  3e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.862516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0348  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 		 84 aa  114  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000453633  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1220  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 		 88 aa  114  5e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4194  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 		 89 aa  114  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3870  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 		 89 aa  114  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.403314  normal  0.0137956 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0305  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 		 85 aa  114  5e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000393871  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0588  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 		 90 aa  114  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3465  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 		 94 aa  114  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.360708 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0107  50S ribosomal protein L27  68.24 
 
 		 88 aa  114  6e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.176189 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3345  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 87 aa  114  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2772  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 87 aa  114  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.436114  normal  0.118024 
 
 
-
 
NC_004310  BR1849  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 		 89 aa  113  7.999999999999999e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1781  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 		 89 aa  113  7.999999999999999e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.810643  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4102  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 90 aa  113  7.999999999999999e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.500877 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4724  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 88 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0668122  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1051  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212456  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0152  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 		 90 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.670785  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0247  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0930  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0154  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 		 90 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0232  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3188  50S ribosomal protein L27  65.52 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.263255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3800  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3820  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360985  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2582  50S ribosomal protein L27  62.96 
 
 		 84 aa  111  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.6027199999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0193  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 		 90 aa  111  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.451706 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3512  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0108  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 87 aa  111  3e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3418  50S ribosomal protein L27  63.22 
 
 		 88 aa  111  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3471  50S ribosomal protein L27  65.12 
 
 		 87 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00282639  normal  0.386116 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4336  50S ribosomal protein L27  62.65 
 
 		 98 aa  110  6e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000256783  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0515  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 		 90 aa  110  8.000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2281  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.350544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2480  ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 100 aa  109  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.782187  normal  0.22295 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0454  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0238  ribosomal protein L27  62.65 
 
 		 87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3351  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 		 86 aa  109  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00061388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4211  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 93 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.121619 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2042  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.20995 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0269  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 85 aa  108  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.876975  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2115  50S ribosomal protein L27  61.45 
 
 		 95 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000381623  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0485  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 87 aa  107  4.0000000000000004e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.229022  normal  0.0825407 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0162  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 		 92 aa  107  5e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000470304  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0426  50S ribosomal protein L27  62.35 
 
 		 89 aa  107  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0489  ribosomal protein L27  62.35 
 
 		 86 aa  107  7.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0798  ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 91 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0702  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 91 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.616074 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4312  50S ribosomal protein L27  58.82 
 
 		 85 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0689  50S ribosomal protein L27  62.35 
 
 		 85 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0284  50S ribosomal protein L27  61.63 
 
 		 86 aa  106  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.349085  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0440  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 		 90 aa  106  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.944777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1632  50S ribosomal protein L27  62.79 
 
 		 87 aa  106  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.848306  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0721  50S ribosomal protein L27  62.35 
 
 		 85 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.980566  normal  0.0233999 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4181  50S ribosomal protein L27  58.82 
 
 		 85 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.186505  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1009  50S ribosomal protein L27  62.35 
 
 		 85 aa  106  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000911893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0461  50S ribosomal protein L27  61.63 
 
 		 86 aa  106  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00297252 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4334  50S ribosomal protein L27  58.82 
 
 		 85 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4237  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 		 85 aa  106  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000765087  hitchhiker  0.00000018706 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0721  50S ribosomal protein L27  62.35 
 
 		 85 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.71975 
 
 
-
 
NC_002950  PG0315  50S ribosomal protein L27  62.96 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.385897 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1451  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 87 aa  105  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000000109711  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1816  50S ribosomal protein L27  62.35 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0546  50S ribosomal protein L27  62.35 
 
 		 88 aa  105  2e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0856  50S ribosomal protein L27  62.79 
 
 		 86 aa  105  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.701213  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>