More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3188 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_3188  50S ribosomal protein L27  100 
 
 		 89 aa  176  1e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.263255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0232  50S ribosomal protein L27  85.39 
 
 		 89 aa  152  1e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3006  50S ribosomal protein L27  71.91 
 
 		 89 aa  128  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.549132 
 
 
-
 
NC_004310  BR1849  50S ribosomal protein L27  70.79 
 
 		 89 aa  128  3e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1781  50S ribosomal protein L27  70.79 
 
 		 89 aa  128  3e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.810643  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1051  50S ribosomal protein L27  69.66 
 
 		 89 aa  127  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212456  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2143  50S ribosomal protein L27  69.66 
 
 		 90 aa  127  4.0000000000000003e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.672881 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1461  50S ribosomal protein L27  73.56 
 
 		 89 aa  127  4.0000000000000003e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0317862 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3892  50S ribosomal protein L27  73.03 
 
 		 89 aa  127  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.624543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3870  50S ribosomal protein L27  70.79 
 
 		 89 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.403314  normal  0.0137956 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4194  50S ribosomal protein L27  70.79 
 
 		 89 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3460  50S ribosomal protein L27  69.66 
 
 		 89 aa  125  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159862  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0107  50S ribosomal protein L27  73.03 
 
 		 88 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.176189 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2785  50S ribosomal protein L27  67.42 
 
 		 89 aa  125  2.0000000000000002e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0242571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4102  50S ribosomal protein L27  68.54 
 
 		 90 aa  125  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.500877 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0417  50S ribosomal protein L27  70.79 
 
 		 91 aa  124  3e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.302693 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0930  50S ribosomal protein L27  69.66 
 
 		 89 aa  124  4.0000000000000003e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3282  50S ribosomal protein L27  72.53 
 
 		 91 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0455195 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4921  50S ribosomal protein L27  71.91 
 
 		 88 aa  123  8.000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0271507  normal  0.71556 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4876  50S ribosomal protein L27  71.91 
 
 		 88 aa  123  9e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.387156 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4413  50S ribosomal protein L27  71.91 
 
 		 88 aa  123  9e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2042  50S ribosomal protein L27  68.54 
 
 		 89 aa  123  9e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.20995 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1241  50S ribosomal protein L27  74.7 
 
 		 85 aa  121  3e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.572861  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4287  50S ribosomal protein L27  66.29 
 
 		 90 aa  120  5e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.835773  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0193  50S ribosomal protein L27  68.97 
 
 		 90 aa  120  6e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.451706 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2281  50S ribosomal protein L27  66.29 
 
 		 89 aa  120  7e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.350544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4211  50S ribosomal protein L27  71.6 
 
 		 93 aa  120  8e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.121619 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0154  50S ribosomal protein L27  67.05 
 
 		 90 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0588  50S ribosomal protein L27  67.42 
 
 		 90 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4724  50S ribosomal protein L27  67.42 
 
 		 88 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0668122  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0152  50S ribosomal protein L27  67.42 
 
 		 90 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.670785  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0310  50S ribosomal protein L27  65.17 
 
 		 89 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1482  50S ribosomal protein L27  74.07 
 
 		 93 aa  116  9e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1201  50S ribosomal protein L27  64.04 
 
 		 89 aa  115  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.862516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1537  50S ribosomal protein L27  71.26 
 
 		 85 aa  116  9.999999999999999e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3418  50S ribosomal protein L27  66.28 
 
 		 88 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3322  50S ribosomal protein L27  69.05 
 
 		 84 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000182867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0968  50S ribosomal protein L27  69.05 
 
 		 84 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000160226  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0247  50S ribosomal protein L27  65.17 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1070  50S ribosomal protein L27  69.05 
 
 		 84 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000153229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0108  50S ribosomal protein L27  64.63 
 
 		 87 aa  115  1.9999999999999998e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1037  50S ribosomal protein L27  69.05 
 
 		 84 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000911721  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2651  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 		 86 aa  114  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0231869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2582  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 84 aa  114  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.6027199999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3800  50S ribosomal protein L27  64.04 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1725  50S ribosomal protein L27  70.11 
 
 		 85 aa  114  3.9999999999999997e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3640  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 		 88 aa  114  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.320466  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0348  50S ribosomal protein L27  70.37 
 
 		 84 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000453633  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3820  50S ribosomal protein L27  64.04 
 
 		 89 aa  114  5e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360985  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0515  50S ribosomal protein L27  67.05 
 
 		 90 aa  114  5e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3512  50S ribosomal protein L27  64.04 
 
 		 89 aa  114  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0870  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 		 84 aa  113  6.9999999999999995e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000545576  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3651  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 		 84 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0980  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 		 84 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000110997  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2217  50S ribosomal protein L27  71.43 
 
 		 91 aa  113  7.999999999999999e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.856627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3218  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 		 84 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2926  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 		 84 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000309766  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0246  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 		 85 aa  112  1.0000000000000001e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000945082  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0896  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 		 84 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000837185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3124  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 		 84 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000107863  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2522  50S ribosomal protein L27  62.5 
 
 		 87 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.587643  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0445  50S ribosomal protein L27  62.5 
 
 		 87 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2854  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 86 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000234792  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1304  50S ribosomal protein L27  62.5 
 
 		 87 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0440  50S ribosomal protein L27  64.77 
 
 		 90 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.944777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3523  50S ribosomal protein L27  62.5 
 
 		 87 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.122565  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3525  50S ribosomal protein L27  62.5 
 
 		 87 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.986116  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00801  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 85 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1415  50S ribosomal protein L27  65.52 
 
 		 85 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1141  50S ribosomal protein L27  62.5 
 
 		 87 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3489  50S ribosomal protein L27  62.5 
 
 		 87 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.562103  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001672  LSU ribosomal protein L27p  66.67 
 
 		 85 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000226464  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0996  50S ribosomal protein L27  70.11 
 
 		 85 aa  112  2.0000000000000002e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0955  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 		 84 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.455715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0853  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 		 84 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152445  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3088  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 84 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3259  50S ribosomal protein L27  62.5 
 
 		 87 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2828  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 		 84 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000113295  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0184  50S ribosomal protein L27  70.37 
 
 		 84 aa  112  2.0000000000000002e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0090  50S ribosomal protein L27  70.37 
 
 		 84 aa  111  3e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0327893  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0130  50S ribosomal protein L27  70.37 
 
 		 84 aa  111  3e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0508  50S ribosomal protein L27  60.92 
 
 		 87 aa  111  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.868007  normal  0.531544 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0099  50S ribosomal protein L27  70.37 
 
 		 84 aa  111  3e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3448  50S ribosomal protein L27  60.92 
 
 		 87 aa  111  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0232252  hitchhiker  0.00744788 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3351  50S ribosomal protein L27  68.29 
 
 		 86 aa  111  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00061388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1005  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 		 84 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000876711  decreased coverage  0.00000356458 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0510  50S ribosomal protein L27  62.5 
 
 		 87 aa  110  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0309377  normal  0.755964 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0503  ribosomal protein L27  70.37 
 
 		 85 aa  111  4.0000000000000004e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3667  50S ribosomal protein L27  62.5 
 
 		 87 aa  110  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000345306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0497  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 		 90 aa  111  4.0000000000000004e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000367607  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2801  50S ribosomal protein L27  62.5 
 
 		 87 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000884705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0100  50S ribosomal protein L27  62.5 
 
 		 87 aa  110  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00352754  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0552  50S ribosomal protein L27  62.5 
 
 		 87 aa  110  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000367957  normal  0.045539 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0485  50S ribosomal protein L27  62.5 
 
 		 87 aa  110  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0162621  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0582  50S ribosomal protein L27  62.5 
 
 		 87 aa  110  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00040366  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3235  50S ribosomal protein L27  67.9 
 
 		 85 aa  110  5e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000158281  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3359  ribosomal protein L27  67.86 
 
 		 85 aa  110  5e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000421163  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0362  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 		 85 aa  110  5e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000249852  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1009  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 85 aa  110  5e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000911893  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2821  50S ribosomal protein L27  63.22 
 
 		 86 aa  110  6e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000571878  normal  0.308516 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>