More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0348 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0348  50S ribosomal protein L27  100 
 
 		 84 aa  173  8e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000453633  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3589  50S ribosomal protein L27  90.48 
 
 		 84 aa  158  3e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000197888  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3235  50S ribosomal protein L27  86.75 
 
 		 85 aa  152  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000158281  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0146  50S ribosomal protein L27  89.16 
 
 		 85 aa  152  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0163  50S ribosomal protein L27  87.95 
 
 		 85 aa  151  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000390958  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0305  50S ribosomal protein L27  86.75 
 
 		 85 aa  149  8.999999999999999e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000393871  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3196  50S ribosomal protein L27  84.34 
 
 		 85 aa  149  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000840306  unclonable  7.875010000000001e-24 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2582  50S ribosomal protein L27  72.62 
 
 		 84 aa  134  5e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.6027199999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3242  50S ribosomal protein L27  73.49 
 
 		 95 aa  132  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0647  50S ribosomal protein L27  71.08 
 
 		 89 aa  128  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.908873 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0424  50S ribosomal protein L27  69.88 
 
 		 92 aa  129  2.0000000000000002e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.85685  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1515  50S ribosomal protein L27  72.29 
 
 		 93 aa  127  7.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0090282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2237  ribosomal protein L27  67.47 
 
 		 91 aa  126  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1537  50S ribosomal protein L27  71.08 
 
 		 85 aa  124  4.0000000000000003e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2772  50S ribosomal protein L27  71.08 
 
 		 87 aa  124  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.436114  normal  0.118024 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3345  50S ribosomal protein L27  71.08 
 
 		 87 aa  124  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0090  50S ribosomal protein L27  72.29 
 
 		 84 aa  122  1e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0327893  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0130  50S ribosomal protein L27  72.29 
 
 		 84 aa  122  1e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0099  50S ribosomal protein L27  72.29 
 
 		 84 aa  122  1e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3640  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 		 88 aa  122  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.320466  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0996  50S ribosomal protein L27  69.88 
 
 		 85 aa  122  1e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2143  50S ribosomal protein L27  71.08 
 
 		 90 aa  121  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.672881 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3418  50S ribosomal protein L27  68.6 
 
 		 88 aa  121  3e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1220  50S ribosomal protein L27  72.29 
 
 		 88 aa  121  4e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0184  50S ribosomal protein L27  71.08 
 
 		 84 aa  120  5e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0087  50S ribosomal protein L27  70.24 
 
 		 83 aa  120  5e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000279495  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1341  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 		 85 aa  119  9.999999999999999e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00883743  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1725  50S ribosomal protein L27  69.88 
 
 		 85 aa  119  9.999999999999999e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2115  50S ribosomal protein L27  71.08 
 
 		 95 aa  118  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000381623  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3465  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 		 94 aa  118  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.360708 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2247  50S ribosomal protein L27  71.43 
 
 		 85 aa  118  3e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000000479005  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2696  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 		 85 aa  116  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000136289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3460  50S ribosomal protein L27  69.88 
 
 		 89 aa  116  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159862  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3207  ribosomal protein L27  70.73 
 
 		 85 aa  115  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3471  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 		 87 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00282639  normal  0.386116 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0310  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2181  50S ribosomal protein L27  68.6 
 
 		 88 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.128983  normal  0.935252 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1461  50S ribosomal protein L27  69.88 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0317862 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0746  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 103 aa  115  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000122269  hitchhiker  0.000403944 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1415  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 		 85 aa  114  3e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0559  50S ribosomal protein L27  69.88 
 
 		 90 aa  115  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1009  50S ribosomal protein L27  69.51 
 
 		 85 aa  114  3.9999999999999997e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000911893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3188  50S ribosomal protein L27  70.37 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.263255  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0559  50S ribosomal protein L27  69.51 
 
 		 85 aa  114  5e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00191418  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0417  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 		 91 aa  114  5e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.302693 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0269  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 85 aa  114  5e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.876975  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0794  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 		 85 aa  114  6e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000203934  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001672  LSU ribosomal protein L27p  70.73 
 
 		 85 aa  113  6.9999999999999995e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000226464  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1849  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 		 89 aa  113  6.9999999999999995e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2691  50S ribosomal protein L27  63.95 
 
 		 89 aa  113  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0303281  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1781  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 		 89 aa  113  6.9999999999999995e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.810643  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0232  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 		 89 aa  113  6.9999999999999995e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00801  50S ribosomal protein L27  70.73 
 
 		 85 aa  113  6.9999999999999995e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1379  50S ribosomal protein L27  65.12 
 
 		 89 aa  113  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4876  50S ribosomal protein L27  71.43 
 
 		 88 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.387156 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1368  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 94 aa  112  1.0000000000000001e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000272527  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4194  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4921  50S ribosomal protein L27  69.88 
 
 		 88 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0271507  normal  0.71556 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0865  50S ribosomal protein L27  69.62 
 
 		 87 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.437144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3870  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.403314  normal  0.0137956 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3006  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 		 89 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.549132 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2006  ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 86 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.962508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4413  50S ribosomal protein L27  71.43 
 
 		 88 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1611  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 97 aa  112  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000833239  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4287  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 		 90 aa  112  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.835773  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2549  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 		 95 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000275731  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1051  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212456  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0456  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 96 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.031206  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0162  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 92 aa  111  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000470304  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40780  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 85 aa  111  4.0000000000000004e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2057  50S ribosomal protein L27  65 
 
 		 87 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.976216  normal  0.840982 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0454  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 		 89 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2002  50S ribosomal protein L27  64.63 
 
 		 85 aa  110  6e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.245442  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3359  ribosomal protein L27  68.29 
 
 		 85 aa  110  6e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000421163  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0503  ribosomal protein L27  63.86 
 
 		 85 aa  110  6e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0362  50S ribosomal protein L27  69.51 
 
 		 85 aa  110  6e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000249852  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0152  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 		 90 aa  110  6e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.670785  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1816  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 		 85 aa  110  8.000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3892  50S ribosomal protein L27  70.37 
 
 		 89 aa  110  9e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.624543  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1326  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 84 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0019115  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0461  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 		 86 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00297252 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1137  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 84 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00024272  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1108  ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 84 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000226179  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3478  ribosomal protein L27  67.07 
 
 		 85 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000653762  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3621  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 		 85 aa  109  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000351057  normal  0.260967 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0108  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4336  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 		 98 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000256783  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3282  50S ribosomal protein L27  69.14 
 
 		 91 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0455195 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2383  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 100 aa  109  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000271812  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2095  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 100 aa  109  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000243754  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0193  50S ribosomal protein L27  67.9 
 
 		 90 aa  109  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.451706 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0284  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 		 86 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.349085  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0499  ribosomal protein L27  63.86 
 
 		 93 aa  108  2.0000000000000002e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0426  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4211  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 		 93 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.121619 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0930  50S ribosomal protein L27  70.37 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3611  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 		 85 aa  108  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000711047  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0107  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 		 88 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.176189 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2785  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 		 89 aa  109  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0242571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1482  50S ribosomal protein L27  69.14 
 
 		 93 aa  108  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>