More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2217 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_2217  50S ribosomal protein L27  100 
 
 		 91 aa  181  3e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.856627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1120  50S ribosomal protein L27  74.71 
 
 		 87 aa  129  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.645406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05534  50S ribosomal protein L27  75.58 
 
 		 86 aa  127  7.000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000340822  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0497  50S ribosomal protein L27  69.88 
 
 		 90 aa  124  6e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000367607  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1682  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 		 90 aa  121  3e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00000249957  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1617  50S ribosomal protein L27  82.61 
 
 		 82 aa  120  9e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000121175  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3322  50S ribosomal protein L27  71.43 
 
 		 84 aa  118  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000182867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1037  50S ribosomal protein L27  71.43 
 
 		 84 aa  118  3e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000911721  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0968  50S ribosomal protein L27  71.43 
 
 		 84 aa  118  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000160226  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1070  50S ribosomal protein L27  71.43 
 
 		 84 aa  118  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000153229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2002  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 		 85 aa  117  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.245442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0870  50S ribosomal protein L27  71.43 
 
 		 84 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000545576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1526  50S ribosomal protein L27  72.73 
 
 		 85 aa  116  9.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1583  50S ribosomal protein L27  72.73 
 
 		 85 aa  116  9.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1269  50S ribosomal protein L27  75.68 
 
 		 85 aa  115  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000774064  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4883  ribosomal protein L27  64.84 
 
 		 92 aa  115  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.113157  normal  0.111687 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2227  50S ribosomal protein L27  63.74 
 
 		 91 aa  116  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00813215  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3651  50S ribosomal protein L27  70.24 
 
 		 84 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0980  50S ribosomal protein L27  70.24 
 
 		 84 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000110997  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0955  50S ribosomal protein L27  71.08 
 
 		 84 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.455715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3073  50S ribosomal protein L27  64.84 
 
 		 91 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000209952  unclonable  0.0000000174741 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0896  50S ribosomal protein L27  70.24 
 
 		 84 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000837185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3124  50S ribosomal protein L27  70.24 
 
 		 84 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000107863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3088  50S ribosomal protein L27  70.24 
 
 		 84 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3218  50S ribosomal protein L27  70.24 
 
 		 84 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270517  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0750  ribosomal protein L27  68.29 
 
 		 90 aa  115  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000003902  hitchhiker  0.00471075 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0853  50S ribosomal protein L27  69.88 
 
 		 84 aa  115  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152445  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2926  50S ribosomal protein L27  70.24 
 
 		 84 aa  115  3e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000309766  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0424  50S ribosomal protein L27  65.93 
 
 		 92 aa  115  3e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.85685  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3756  50S ribosomal protein L27  70.24 
 
 		 85 aa  114  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000137777  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3975  50S ribosomal protein L27  70.24 
 
 		 85 aa  114  3.9999999999999997e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000219143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3611  50S ribosomal protein L27  70.24 
 
 		 85 aa  114  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000711047  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03050  50S ribosomal protein L27  70.24 
 
 		 85 aa  114  6e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00726587  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0522  ribosomal protein L27  70.24 
 
 		 85 aa  114  6e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000023922  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0794  50S ribosomal protein L27  69.05 
 
 		 85 aa  114  6e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000203934  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2703  50S ribosomal protein L27  60.87 
 
 		 92 aa  114  6e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2575  50S ribosomal protein L27  60.87 
 
 		 92 aa  114  6e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3585  50S ribosomal protein L27  70.24 
 
 		 85 aa  114  6e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000250774  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3378  50S ribosomal protein L27  70.24 
 
 		 85 aa  114  6e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.4045e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4507  50S ribosomal protein L27  70.24 
 
 		 85 aa  114  6e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000060246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0515  50S ribosomal protein L27  70.24 
 
 		 85 aa  114  6e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000794781  normal  0.0169565 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3670  50S ribosomal protein L27  70.24 
 
 		 85 aa  114  6e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000967389  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03001  hypothetical protein  70.24 
 
 		 85 aa  114  6e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0066535  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3481  50S ribosomal protein L27  70.24 
 
 		 85 aa  114  6e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000491459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0892  50S ribosomal protein L27  68.24 
 
 		 85 aa  114  6e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0670599 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1572  50S ribosomal protein L27  68.24 
 
 		 85 aa  113  6.9999999999999995e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.355414  normal  0.759943 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1754  50S ribosomal protein L27  68.24 
 
 		 85 aa  113  6.9999999999999995e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.163114  normal  0.0575884 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00801  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 		 85 aa  113  7.999999999999999e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1005  50S ribosomal protein L27  69.88 
 
 		 84 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000876711  decreased coverage  0.00000356458 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001672  LSU ribosomal protein L27p  67.86 
 
 		 85 aa  113  7.999999999999999e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000226464  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3188  50S ribosomal protein L27  71.43 
 
 		 89 aa  113  7.999999999999999e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.263255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2854  50S ribosomal protein L27  67.06 
 
 		 86 aa  113  8.999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000234792  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0238  ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 87 aa  113  8.999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0232  50S ribosomal protein L27  71.08 
 
 		 89 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0559  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 		 85 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00191418  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2828  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 		 84 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000113295  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0362  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 85 aa  112  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000249852  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4511  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 		 85 aa  112  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1223  ribosomal protein L27  76.81 
 
 		 83 aa  112  2.0000000000000002e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000141785 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2143  50S ribosomal protein L27  60.67 
 
 		 90 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.672881 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2696  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 85 aa  112  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000136289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0019  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 		 86 aa  112  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2785  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0242571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0474  50S ribosomal protein L27  69.05 
 
 		 85 aa  112  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000537628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3207  ribosomal protein L27  65.88 
 
 		 85 aa  111  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1849  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0108  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 		 87 aa  112  3e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3460  50S ribosomal protein L27  67.9 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159862  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0489  ribosomal protein L27  64.71 
 
 		 86 aa  111  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1781  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.810643  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1515  50S ribosomal protein L27  67.9 
 
 		 93 aa  111  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0090282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0838  50S ribosomal protein L27  72.97 
 
 		 85 aa  111  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.34705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1051  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 		 89 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212456  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0193  50S ribosomal protein L27  61.8 
 
 		 90 aa  111  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.451706 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3351  50S ribosomal protein L27  64.37 
 
 		 86 aa  110  5e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00061388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0750  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 		 85 aa  110  5e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00233026 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4724  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 		 88 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0668122  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1602  50S ribosomal protein L27  74.65 
 
 		 84 aa  110  9e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0180  ribosomal protein L27  70.24 
 
 		 87 aa  110  9e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00344183  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3674  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 		 85 aa  110  9e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.99139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0863  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 		 85 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0966779  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4211  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 		 93 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.121619 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03730  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 85 aa  109  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00000322672  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3359  ribosomal protein L27  65.48 
 
 		 85 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000421163  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0310  50S ribosomal protein L27  60.92 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3916  50S ribosomal protein L27  60.44 
 
 		 91 aa  109  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00853508 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3493  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 		 85 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000310399  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3662  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 		 85 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.0000324123  normal  0.0701159 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4876  50S ribosomal protein L27  69.51 
 
 		 88 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.387156 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3495  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 		 85 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000222447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4921  50S ribosomal protein L27  69.51 
 
 		 88 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0271507  normal  0.71556 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1220  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 		 88 aa  108  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0417  50S ribosomal protein L27  65.43 
 
 		 91 aa  109  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.302693 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4413  50S ribosomal protein L27  69.51 
 
 		 88 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3564  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 		 85 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00211833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0512  50S ribosomal protein L27  68.83 
 
 		 85 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0535164 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3600  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 		 85 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00592088  normal  0.834432 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1188  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 87 aa  108  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5485  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 		 85 aa  108  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.132015  normal  0.505389 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4287  50S ribosomal protein L27  59.55 
 
 		 90 aa  108  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.835773  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>