More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0152 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0152  50S ribosomal protein L27  100 
 
 		 90 aa  184  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.670785  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0588  50S ribosomal protein L27  92.22 
 
 		 90 aa  173  8e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0247  50S ribosomal protein L27  94.44 
 
 		 89 aa  171  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0154  50S ribosomal protein L27  91.11 
 
 		 90 aa  169  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0515  50S ribosomal protein L27  92.22 
 
 		 90 aa  169  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0440  50S ribosomal protein L27  85.56 
 
 		 90 aa  159  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.944777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0426  50S ribosomal protein L27  84.44 
 
 		 89 aa  155  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2143  50S ribosomal protein L27  80 
 
 		 90 aa  151  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.672881 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4287  50S ribosomal protein L27  74.44 
 
 		 90 aa  140  4e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.835773  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1781  50S ribosomal protein L27  77.78 
 
 		 89 aa  140  6e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.810643  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1849  50S ribosomal protein L27  77.78 
 
 		 89 aa  140  6e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1461  50S ribosomal protein L27  77.78 
 
 		 89 aa  138  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0317862 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1051  50S ribosomal protein L27  76.67 
 
 		 89 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212456  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3006  50S ribosomal protein L27  75.56 
 
 		 89 aa  137  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.549132 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1482  50S ribosomal protein L27  76.4 
 
 		 93 aa  136  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3870  50S ribosomal protein L27  74.44 
 
 		 89 aa  135  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.403314  normal  0.0137956 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4194  50S ribosomal protein L27  74.44 
 
 		 89 aa  135  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3820  50S ribosomal protein L27  74.44 
 
 		 89 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360985  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3460  50S ribosomal protein L27  76.67 
 
 		 89 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159862  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3512  50S ribosomal protein L27  74.44 
 
 		 89 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0310  50S ribosomal protein L27  72.73 
 
 		 89 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4876  50S ribosomal protein L27  74.44 
 
 		 88 aa  133  7.000000000000001e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.387156 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4921  50S ribosomal protein L27  74.44 
 
 		 88 aa  133  7.000000000000001e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0271507  normal  0.71556 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4413  50S ribosomal protein L27  74.44 
 
 		 88 aa  133  7.000000000000001e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0417  50S ribosomal protein L27  73.63 
 
 		 91 aa  133  8e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.302693 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3800  50S ribosomal protein L27  72.22 
 
 		 89 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2785  50S ribosomal protein L27  73.33 
 
 		 89 aa  130  6e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0242571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3282  50S ribosomal protein L27  74.39 
 
 		 91 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0455195 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4102  50S ribosomal protein L27  68.89 
 
 		 90 aa  129  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.500877 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4724  50S ribosomal protein L27  74.44 
 
 		 88 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0668122  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4211  50S ribosomal protein L27  69.15 
 
 		 93 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.121619 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0193  50S ribosomal protein L27  68.89 
 
 		 90 aa  124  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.451706 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0107  50S ribosomal protein L27  71.11 
 
 		 88 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.176189 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0798  ribosomal protein L27  71.43 
 
 		 91 aa  124  5e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0702  50S ribosomal protein L27  71.43 
 
 		 91 aa  124  5e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.616074 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0232  50S ribosomal protein L27  69.32 
 
 		 89 aa  123  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0930  50S ribosomal protein L27  72.22 
 
 		 89 aa  122  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2042  50S ribosomal protein L27  71.11 
 
 		 89 aa  122  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.20995 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3892  50S ribosomal protein L27  71.11 
 
 		 89 aa  120  5e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.624543  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40780  50S ribosomal protein L27  72.62 
 
 		 85 aa  120  6e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2281  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 89 aa  120  6e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.350544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0108  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 		 87 aa  119  9.999999999999999e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3188  50S ribosomal protein L27  67.42 
 
 		 89 aa  119  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.263255  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2247  50S ribosomal protein L27  72.62 
 
 		 85 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000000479005  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0487  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 		 88 aa  116  9e-26  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3681  50S ribosomal protein L27  69.88 
 
 		 85 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1009  50S ribosomal protein L27  71.08 
 
 		 85 aa  116  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000911893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1241  50S ribosomal protein L27  67.06 
 
 		 85 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.572861  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1201  50S ribosomal protein L27  65.56 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.862516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3351  50S ribosomal protein L27  68.97 
 
 		 86 aa  115  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00061388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1070  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 		 84 aa  114  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000153229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0968  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 		 84 aa  114  3e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000160226  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1037  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 		 84 aa  114  3e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000911721  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2218  50S ribosomal protein L27  69.05 
 
 		 85 aa  114  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000800329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3322  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 		 84 aa  114  3e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000182867  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0135  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4859  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 		 85 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0865  50S ribosomal protein L27  67.44 
 
 		 87 aa  114  5e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.437144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2006  ribosomal protein L27  69.05 
 
 		 86 aa  114  5e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.962508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3207  ribosomal protein L27  68.67 
 
 		 85 aa  114  5e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0454  50S ribosomal protein L27  67.06 
 
 		 89 aa  113  6.9999999999999995e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0546  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 		 88 aa  113  8.999999999999998e-25  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4237  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 		 85 aa  112  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000765087  hitchhiker  0.00000018706 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1816  50S ribosomal protein L27  70.24 
 
 		 85 aa  112  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3088  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 		 84 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2828  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 		 84 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000113295  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5207  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 85 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.121929  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3651  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 		 84 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1005  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 		 84 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000876711  decreased coverage  0.00000356458 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1415  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 		 85 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2854  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 		 86 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000234792  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2926  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 		 84 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000309766  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0980  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 		 84 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000110997  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3621  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 		 85 aa  112  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000351057  normal  0.260967 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0896  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 		 84 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000837185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3124  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 		 84 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000107863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60450  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 85 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0112062 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3218  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 		 84 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1625  ribosomal protein L27  60.67 
 
 		 143 aa  111  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.388698 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0721  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 85 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.71975 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0689  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 85 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0721  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 85 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.980566  normal  0.0233999 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0897  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 		 82 aa  111  4.0000000000000004e-24  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00000108191  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0362  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 		 85 aa  110  4.0000000000000004e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000249852  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3640  50S ribosomal protein L27  63.22 
 
 		 88 aa  110  4.0000000000000004e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.320466  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3495  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 85 aa  110  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000222447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00801  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 		 85 aa  110  5e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3662  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 85 aa  110  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.0000324123  normal  0.0701159 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3600  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 85 aa  110  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00592088  normal  0.834432 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3564  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 85 aa  110  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00211833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0856  50S ribosomal protein L27  63.95 
 
 		 86 aa  110  5e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.701213  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001672  LSU ribosomal protein L27p  67.07 
 
 		 85 aa  110  5e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000226464  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3493  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 85 aa  110  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000310399  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0246  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 		 85 aa  110  6e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000945082  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3478  ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 85 aa  110  6e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000653762  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0348  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 		 84 aa  110  6e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000453633  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0559  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 		 85 aa  110  8.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00191418  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0870  50S ribosomal protein L27  64.63 
 
 		 84 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000545576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0853  50S ribosomal protein L27  64.63 
 
 		 84 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152445  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0955  50S ribosomal protein L27  64.63 
 
 		 84 aa  110  9e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.455715  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>