More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0503 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0503  ribosomal protein L27  100 
 
 		 85 aa  170  6.999999999999999e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1725  50S ribosomal protein L27  85.71 
 
 		 85 aa  147  5e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0090  50S ribosomal protein L27  84.52 
 
 		 84 aa  145  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0327893  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0130  50S ribosomal protein L27  84.52 
 
 		 84 aa  145  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0099  50S ribosomal protein L27  84.52 
 
 		 84 aa  145  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0184  50S ribosomal protein L27  84.52 
 
 		 84 aa  145  2.0000000000000003e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1537  50S ribosomal protein L27  84.52 
 
 		 85 aa  144  4.0000000000000006e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0996  50S ribosomal protein L27  82.14 
 
 		 85 aa  142  1e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1341  50S ribosomal protein L27  83.13 
 
 		 85 aa  140  5e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00883743  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1415  50S ribosomal protein L27  76.19 
 
 		 85 aa  132  9.999999999999999e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0424  50S ribosomal protein L27  69.05 
 
 		 92 aa  120  6e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.85685  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3235  50S ribosomal protein L27  67.06 
 
 		 85 aa  118  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000158281  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3282  50S ribosomal protein L27  71.95 
 
 		 91 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0455195 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0163  50S ribosomal protein L27  67.06 
 
 		 85 aa  117  6e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000390958  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3640  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 88 aa  117  6e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.320466  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0305  50S ribosomal protein L27  67.06 
 
 		 85 aa  117  7e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000393871  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0146  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 		 85 aa  115  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3196  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 		 85 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000840306  unclonable  7.875010000000001e-24 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3242  50S ribosomal protein L27  62.65 
 
 		 95 aa  115  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2237  ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 91 aa  114  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1515  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 		 93 aa  114  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0090282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3589  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 84 aa  114  6e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000197888  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3465  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 		 94 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.360708 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1220  50S ribosomal protein L27  69.05 
 
 		 88 aa  112  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3188  50S ribosomal protein L27  70.37 
 
 		 89 aa  111  4.0000000000000004e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.263255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2582  50S ribosomal protein L27  64.2 
 
 		 84 aa  110  5e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.6027199999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0232  50S ribosomal protein L27  69.88 
 
 		 89 aa  110  6e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0348  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 		 84 aa  110  6e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000453633  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0417  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 		 91 aa  110  8.000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.302693 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2772  50S ribosomal protein L27  62.65 
 
 		 87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.436114  normal  0.118024 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3345  50S ribosomal protein L27  62.65 
 
 		 87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3418  50S ribosomal protein L27  62.07 
 
 		 88 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3073  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 		 91 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000209952  unclonable  0.0000000174741 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0310  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0108  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 87 aa  108  2.0000000000000002e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2143  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 		 90 aa  108  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.672881 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0647  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.908873 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4211  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 93 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.121619 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4336  50S ribosomal protein L27  60.24 
 
 		 98 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000256783  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1451  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 		 87 aa  107  4.0000000000000004e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000000109711  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4102  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 90 aa  107  5e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.500877 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4511  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 		 85 aa  107  6e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4876  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 		 88 aa  106  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.387156 
 
 
-
 
NC_004310  BR1849  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4921  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 		 88 aa  105  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0271507  normal  0.71556 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1781  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.810643  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4413  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 		 88 aa  106  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0162  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 92 aa  105  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000470304  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0193  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.451706 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0213  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 86 aa  105  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.280528 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1461  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0317862 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3105  50S ribosomal protein L27  62.35 
 
 		 86 aa  105  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3460  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159862  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3006  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.549132 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3892  50S ribosomal protein L27  69.14 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.624543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1051  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 		 89 aa  105  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212456  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2115  50S ribosomal protein L27  60.24 
 
 		 95 aa  104  4e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000381623  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2957  50S ribosomal protein L27  62.35 
 
 		 86 aa  104  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668202  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1482  50S ribosomal protein L27  67.06 
 
 		 93 aa  104  4e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0152  50S ribosomal protein L27  61.45 
 
 		 90 aa  104  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.670785  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3870  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 		 89 aa  104  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.403314  normal  0.0137956 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4194  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 		 89 aa  104  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0559  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 		 85 aa  104  5e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00191418  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2703  50S ribosomal protein L27  59.52 
 
 		 92 aa  103  6e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2575  50S ribosomal protein L27  59.52 
 
 		 92 aa  103  6e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0489  ribosomal protein L27  59.04 
 
 		 86 aa  103  6e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0588  50S ribosomal protein L27  59.04 
 
 		 90 aa  103  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4724  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 88 aa  103  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0668122  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2281  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 89 aa  103  7e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.350544  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3359  ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 85 aa  103  8e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000421163  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0856  50S ribosomal protein L27  60 
 
 		 86 aa  103  8e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.701213  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0794  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 85 aa  103  9e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000203934  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0195  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 86 aa  103  9e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000826463  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0110  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 		 87 aa  103  9e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000081142  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0269  50S ribosomal protein L27  58.33 
 
 		 85 aa  103  9e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.876975  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3471  50S ribosomal protein L27  60 
 
 		 87 aa  103  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00282639  normal  0.386116 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0559  50S ribosomal protein L27  62.96 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0515  50S ribosomal protein L27  61.45 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3088  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 84 aa  102  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2785  50S ribosomal protein L27  62.65 
 
 		 89 aa  102  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0242571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2669  50S ribosomal protein L27  56.47 
 
 		 88 aa  102  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000924332  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1037  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000911721  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00801  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1632  50S ribosomal protein L27  59.76 
 
 		 87 aa  102  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.848306  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3322  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000182867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1816  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2854  50S ribosomal protein L27  69.44 
 
 		 86 aa  102  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000234792  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1070  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000153229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3674  50S ribosomal protein L27  60 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.99139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0968  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000160226  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001672  LSU ribosomal protein L27p  61.9 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000226464  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3651  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 84 aa  102  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0870  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 84 aa  101  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000545576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0362  50S ribosomal protein L27  64.63 
 
 		 85 aa  101  3e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000249852  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0980  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 84 aa  102  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000110997  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1241  50S ribosomal protein L27  63.41 
 
 		 85 aa  101  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.572861  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0247  50S ribosomal protein L27  59.04 
 
 		 89 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0154  50S ribosomal protein L27  59.04 
 
 		 90 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03730  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 		 85 aa  101  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00000322672  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0246  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 85 aa  101  3e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000945082  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>