More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3892 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3892  50S ribosomal protein L27  100 
 
 		 89 aa  176  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.624543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0930  50S ribosomal protein L27  86.52 
 
 		 89 aa  157  4e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2042  50S ribosomal protein L27  87.64 
 
 		 89 aa  156  8e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.20995 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1461  50S ribosomal protein L27  76.4 
 
 		 89 aa  134  3.0000000000000003e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0317862 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2785  50S ribosomal protein L27  75.28 
 
 		 89 aa  134  4e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0242571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1051  50S ribosomal protein L27  73.03 
 
 		 89 aa  134  4e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212456  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0417  50S ribosomal protein L27  76.92 
 
 		 91 aa  132  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.302693 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1482  50S ribosomal protein L27  79.07 
 
 		 93 aa  132  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4921  50S ribosomal protein L27  74.16 
 
 		 88 aa  130  5e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0271507  normal  0.71556 
 
 
-
 
NC_004310  BR1849  50S ribosomal protein L27  70.79 
 
 		 89 aa  130  6e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1781  50S ribosomal protein L27  70.79 
 
 		 89 aa  130  6e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.810643  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0232  50S ribosomal protein L27  75.28 
 
 		 89 aa  130  6.999999999999999e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4876  50S ribosomal protein L27  74.16 
 
 		 88 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.387156 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3460  50S ribosomal protein L27  73.03 
 
 		 89 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159862  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4413  50S ribosomal protein L27  74.16 
 
 		 88 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3282  50S ribosomal protein L27  74.73 
 
 		 91 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0455195 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1201  50S ribosomal protein L27  70.79 
 
 		 89 aa  127  4.0000000000000003e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.862516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3188  50S ribosomal protein L27  73.03 
 
 		 89 aa  127  4.0000000000000003e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.263255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4102  50S ribosomal protein L27  71.11 
 
 		 90 aa  127  4.0000000000000003e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.500877 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4211  50S ribosomal protein L27  74.47 
 
 		 93 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.121619 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3006  50S ribosomal protein L27  74.16 
 
 		 89 aa  127  7.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.549132 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2143  50S ribosomal protein L27  73.33 
 
 		 90 aa  126  8.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.672881 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1241  50S ribosomal protein L27  74.71 
 
 		 85 aa  126  8.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.572861  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3870  50S ribosomal protein L27  71.91 
 
 		 89 aa  126  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.403314  normal  0.0137956 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4194  50S ribosomal protein L27  71.91 
 
 		 89 aa  126  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0193  50S ribosomal protein L27  72.22 
 
 		 90 aa  125  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.451706 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0107  50S ribosomal protein L27  73.03 
 
 		 88 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.176189 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2281  50S ribosomal protein L27  69.66 
 
 		 89 aa  124  4.0000000000000003e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.350544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4724  50S ribosomal protein L27  73.03 
 
 		 88 aa  124  5e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0668122  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4287  50S ribosomal protein L27  70 
 
 		 90 aa  123  7e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.835773  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0310  50S ribosomal protein L27  69.66 
 
 		 89 aa  122  2e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3820  50S ribosomal protein L27  67.42 
 
 		 89 aa  120  4e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360985  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3512  50S ribosomal protein L27  67.42 
 
 		 89 aa  120  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0247  50S ribosomal protein L27  68.54 
 
 		 89 aa  120  4e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3351  50S ribosomal protein L27  71.76 
 
 		 86 aa  121  4e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00061388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0152  50S ribosomal protein L27  71.11 
 
 		 90 aa  120  5e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.670785  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3800  50S ribosomal protein L27  67.42 
 
 		 89 aa  120  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0515  50S ribosomal protein L27  70.45 
 
 		 90 aa  120  7e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2854  50S ribosomal protein L27  70.24 
 
 		 86 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000234792  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0588  50S ribosomal protein L27  68.89 
 
 		 90 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001672  LSU ribosomal protein L27p  69.88 
 
 		 85 aa  117  4.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000226464  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00801  50S ribosomal protein L27  69.88 
 
 		 85 aa  117  4.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0362  50S ribosomal protein L27  69.88 
 
 		 85 aa  117  6e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000249852  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0454  50S ribosomal protein L27  67.82 
 
 		 89 aa  117  7e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0559  50S ribosomal protein L27  70.73 
 
 		 85 aa  116  9e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00191418  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0440  50S ribosomal protein L27  68.18 
 
 		 90 aa  116  9.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.944777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1415  50S ribosomal protein L27  69.14 
 
 		 85 aa  115  9.999999999999999e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0108  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 		 87 aa  116  9.999999999999999e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0853  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 		 84 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152445  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2828  50S ribosomal protein L27  69.88 
 
 		 84 aa  115  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000113295  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0870  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 		 84 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000545576  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2247  50S ribosomal protein L27  71.95 
 
 		 85 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000000479005  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3651  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 		 84 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1070  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 		 84 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000153229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1037  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 		 84 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000911721  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0794  50S ribosomal protein L27  69.51 
 
 		 85 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000203934  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0865  50S ribosomal protein L27  67.44 
 
 		 87 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.437144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0968  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 		 84 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000160226  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3322  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 		 84 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000182867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0955  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 		 84 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.455715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2218  50S ribosomal protein L27  71.95 
 
 		 85 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000800329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3207  ribosomal protein L27  68.29 
 
 		 85 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3088  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 		 84 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3218  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 		 84 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0980  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 		 84 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000110997  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3359  ribosomal protein L27  70.73 
 
 		 85 aa  115  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000421163  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0154  50S ribosomal protein L27  67.05 
 
 		 90 aa  114  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0896  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 		 84 aa  115  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000837185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3124  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 		 84 aa  115  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000107863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1005  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 		 84 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000876711  decreased coverage  0.00000356458 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2926  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 		 84 aa  114  5e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000309766  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1816  50S ribosomal protein L27  71.95 
 
 		 85 aa  114  6e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3478  ribosomal protein L27  68.29 
 
 		 85 aa  113  7.999999999999999e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000653762  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4511  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 		 85 aa  112  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0474  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 		 85 aa  112  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000537628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1009  50S ribosomal protein L27  68.29 
 
 		 85 aa  112  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000911893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3975  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 		 85 aa  112  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000219143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3756  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 		 85 aa  112  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000137777  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0643  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 		 84 aa  112  2.0000000000000002e-24  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.301948  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3611  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 		 85 aa  112  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000711047  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2651  50S ribosomal protein L27  67.09 
 
 		 86 aa  111  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0231869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0426  50S ribosomal protein L27  65.56 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3418  50S ribosomal protein L27  78.26 
 
 		 88 aa  111  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03730  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 		 85 aa  110  4.0000000000000004e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00000322672  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3737  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 		 85 aa  110  5e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000346028  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0246  50S ribosomal protein L27  68.29 
 
 		 85 aa  110  6e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000945082  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3471  50S ribosomal protein L27  62.92 
 
 		 87 aa  110  7.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00282639  normal  0.386116 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4237  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 		 85 aa  110  7.000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000765087  hitchhiker  0.00000018706 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0846  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 		 86 aa  110  8.000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0348  50S ribosomal protein L27  70.37 
 
 		 84 aa  110  9e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000453633  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4883  ribosomal protein L27  61.8 
 
 		 92 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.113157  normal  0.111687 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1682  50S ribosomal protein L27  60.23 
 
 		 90 aa  109  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00000249957  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3600  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 		 85 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00592088  normal  0.834432 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0497  50S ribosomal protein L27  60.23 
 
 		 90 aa  109  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000367607  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3621  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 		 85 aa  109  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000351057  normal  0.260967 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3564  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 		 85 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00211833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0897  50S ribosomal protein L27  67.9 
 
 		 82 aa  109  1.0000000000000001e-23  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00000108191  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3662  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 		 85 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.0000324123  normal  0.0701159 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1269  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 85 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000774064  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3493  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 		 85 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000310399  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>