More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3418 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_3418  50S ribosomal protein L27  100 
 
 		 88 aa  174  4e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1379  50S ribosomal protein L27  78.16 
 
 		 89 aa  143  7.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2181  50S ribosomal protein L27  78.16 
 
 		 88 aa  138  3e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.128983  normal  0.935252 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2249  50S ribosomal protein L27  78.16 
 
 		 89 aa  135  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0281332  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2691  50S ribosomal protein L27  75.86 
 
 		 89 aa  135  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0303281  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2057  50S ribosomal protein L27  77.38 
 
 		 87 aa  134  5e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.976216  normal  0.840982 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2582  50S ribosomal protein L27  71.43 
 
 		 84 aa  122  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.6027199999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0146  50S ribosomal protein L27  70.11 
 
 		 85 aa  122  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0163  50S ribosomal protein L27  70.11 
 
 		 85 aa  121  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000390958  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0348  50S ribosomal protein L27  68.6 
 
 		 84 aa  121  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000453633  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3640  50S ribosomal protein L27  68.97 
 
 		 88 aa  120  6e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.320466  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0305  50S ribosomal protein L27  67.82 
 
 		 85 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000393871  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3235  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 85 aa  118  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000158281  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0424  50S ribosomal protein L27  67.05 
 
 		 92 aa  118  3e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.85685  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2237  ribosomal protein L27  67.82 
 
 		 91 aa  118  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3589  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 84 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000197888  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3471  50S ribosomal protein L27  70.45 
 
 		 87 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00282639  normal  0.386116 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3282  50S ribosomal protein L27  69.41 
 
 		 91 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0455195 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3196  50S ribosomal protein L27  64.37 
 
 		 85 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000840306  unclonable  7.875010000000001e-24 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3188  50S ribosomal protein L27  66.28 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.263255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3207  ribosomal protein L27  74.03 
 
 		 85 aa  114  3e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1515  50S ribosomal protein L27  68.6 
 
 		 93 aa  114  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0090282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2143  50S ribosomal protein L27  67.44 
 
 		 90 aa  114  3.9999999999999997e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.672881 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2651  50S ribosomal protein L27  68.18 
 
 		 86 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0231869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0865  50S ribosomal protein L27  80 
 
 		 87 aa  114  5e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.437144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0232  50S ribosomal protein L27  66.28 
 
 		 89 aa  113  6.9999999999999995e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2042  50S ribosomal protein L27  81.16 
 
 		 89 aa  113  6.9999999999999995e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.20995 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0193  50S ribosomal protein L27  67.05 
 
 		 90 aa  113  7.999999999999999e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.451706 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0870  50S ribosomal protein L27  72.73 
 
 		 84 aa  113  8.999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000545576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0968  50S ribosomal protein L27  77.14 
 
 		 84 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000160226  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3322  50S ribosomal protein L27  77.14 
 
 		 84 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000182867  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3651  50S ribosomal protein L27  77.14 
 
 		 84 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0980  50S ribosomal protein L27  77.14 
 
 		 84 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000110997  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1070  50S ribosomal protein L27  77.14 
 
 		 84 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000153229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4413  50S ribosomal protein L27  68.6 
 
 		 88 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0955  50S ribosomal protein L27  72.73 
 
 		 84 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.455715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1037  50S ribosomal protein L27  77.14 
 
 		 84 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000911721  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4921  50S ribosomal protein L27  68.6 
 
 		 88 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0271507  normal  0.71556 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0896  50S ribosomal protein L27  78.57 
 
 		 84 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000837185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3124  50S ribosomal protein L27  78.57 
 
 		 84 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000107863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4876  50S ribosomal protein L27  68.6 
 
 		 88 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.387156 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4211  50S ribosomal protein L27  64.37 
 
 		 93 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.121619 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3218  50S ribosomal protein L27  77.14 
 
 		 84 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0269  50S ribosomal protein L27  62.79 
 
 		 85 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.876975  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0559  50S ribosomal protein L27  72.73 
 
 		 85 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00191418  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0794  50S ribosomal protein L27  72.73 
 
 		 85 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000203934  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2854  50S ribosomal protein L27  77.14 
 
 		 86 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000234792  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2772  50S ribosomal protein L27  67.44 
 
 		 87 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.436114  normal  0.118024 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0853  50S ribosomal protein L27  77.14 
 
 		 84 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152445  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2926  50S ribosomal protein L27  77.14 
 
 		 84 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000309766  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3345  50S ribosomal protein L27  67.44 
 
 		 87 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1005  50S ribosomal protein L27  78.57 
 
 		 84 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000876711  decreased coverage  0.00000356458 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3460  50S ribosomal protein L27  67.44 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159862  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3242  50S ribosomal protein L27  65.12 
 
 		 95 aa  112  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2828  50S ribosomal protein L27  77.14 
 
 		 84 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000113295  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1415  50S ribosomal protein L27  63.22 
 
 		 85 aa  111  3e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0310  50S ribosomal protein L27  62.22 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0930  50S ribosomal protein L27  76.81 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3892  50S ribosomal protein L27  78.26 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.624543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3465  50S ribosomal protein L27  68.6 
 
 		 94 aa  111  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.360708 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2785  50S ribosomal protein L27  75.34 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0242571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0545  50S ribosomal protein L27  64.77 
 
 		 88 aa  111  4.0000000000000004e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3088  50S ribosomal protein L27  75.71 
 
 		 84 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3756  50S ribosomal protein L27  71.43 
 
 		 85 aa  110  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000137777  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3611  50S ribosomal protein L27  71.43 
 
 		 85 aa  110  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000711047  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3975  50S ribosomal protein L27  71.43 
 
 		 85 aa  110  5e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000219143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0362  50S ribosomal protein L27  71.43 
 
 		 85 aa  110  5e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000249852  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0647  50S ribosomal protein L27  65.12 
 
 		 89 aa  110  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.908873 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1009  50S ribosomal protein L27  74.29 
 
 		 85 aa  110  6e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000911893  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1849  50S ribosomal protein L27  66.28 
 
 		 89 aa  110  7.000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1781  50S ribosomal protein L27  66.28 
 
 		 89 aa  110  7.000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.810643  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1482  50S ribosomal protein L27  75.36 
 
 		 93 aa  110  7.000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00801  50S ribosomal protein L27  71.43 
 
 		 85 aa  110  8.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1220  50S ribosomal protein L27  67.82 
 
 		 88 aa  110  8.000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001672  LSU ribosomal protein L27p  71.43 
 
 		 85 aa  110  8.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000226464  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0526  50S ribosomal protein L27  66.28 
 
 		 85 aa  110  8.000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2128  50S ribosomal protein L27  63.95 
 
 		 88 aa  110  9e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.861173  normal  0.607727 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2115  50S ribosomal protein L27  68.6 
 
 		 95 aa  110  9e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000381623  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0417  50S ribosomal protein L27  65.12 
 
 		 91 aa  109  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.302693 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0108  50S ribosomal protein L27  65.52 
 
 		 87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0107  50S ribosomal protein L27  69.23 
 
 		 88 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.176189 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3448  50S ribosomal protein L27  64.77 
 
 		 87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0232252  hitchhiker  0.00744788 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1461  50S ribosomal protein L27  66.28 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0317862 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1051  50S ribosomal protein L27  66.28 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212456  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0503  ribosomal protein L27  62.07 
 
 		 85 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1537  50S ribosomal protein L27  61.36 
 
 		 85 aa  109  1.0000000000000001e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3478  ribosomal protein L27  75.71 
 
 		 85 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000653762  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4724  50S ribosomal protein L27  64.37 
 
 		 88 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0668122  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05401  50S ribosomal protein L27  62.07 
 
 		 88 aa  109  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3006  50S ribosomal protein L27  65.12 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.549132 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3073  50S ribosomal protein L27  61.63 
 
 		 91 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000209952  unclonable  0.0000000174741 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0284  50S ribosomal protein L27  69.01 
 
 		 86 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.349085  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0508  50S ribosomal protein L27  64.77 
 
 		 87 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.868007  normal  0.531544 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0461  50S ribosomal protein L27  69.01 
 
 		 86 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00297252 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1632  50S ribosomal protein L27  76.81 
 
 		 87 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.848306  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1322  50S ribosomal protein L27  68.97 
 
 		 93 aa  108  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202247  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1725  50S ribosomal protein L27  62.5 
 
 		 85 aa  108  3e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3359  ribosomal protein L27  70.13 
 
 		 85 aa  108  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000421163  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0474  50S ribosomal protein L27  75.71 
 
 		 85 aa  108  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000537628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4102  50S ribosomal protein L27  64.37 
 
 		 90 aa  108  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.500877 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>