More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2237 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2237  ribosomal protein L27  100 
 
 		 91 aa  184  4e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140821  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3235  50S ribosomal protein L27  75 
 
 		 85 aa  136  8.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000158281  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3196  50S ribosomal protein L27  72.62 
 
 		 85 aa  134  5e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000840306  unclonable  7.875010000000001e-24 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0424  50S ribosomal protein L27  73.81 
 
 		 92 aa  133  9e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.85685  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0146  50S ribosomal protein L27  69.41 
 
 		 85 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3465  50S ribosomal protein L27  67.03 
 
 		 94 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.360708 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0647  50S ribosomal protein L27  68.97 
 
 		 89 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.908873 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3242  50S ribosomal protein L27  69.88 
 
 		 95 aa  129  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0305  50S ribosomal protein L27  69.41 
 
 		 85 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000393871  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0163  50S ribosomal protein L27  68.24 
 
 		 85 aa  128  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000390958  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3073  50S ribosomal protein L27  63.74 
 
 		 91 aa  128  3e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000209952  unclonable  0.0000000174741 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3640  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 		 88 aa  127  5.0000000000000004e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.320466  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0348  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 		 84 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000453633  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3589  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 84 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000197888  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1515  50S ribosomal protein L27  71.08 
 
 		 93 aa  125  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0090282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1220  50S ribosomal protein L27  69.05 
 
 		 88 aa  122  2e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2691  50S ribosomal protein L27  62.5 
 
 		 89 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0303281  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0162  50S ribosomal protein L27  70.24 
 
 		 92 aa  119  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000470304  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3418  50S ribosomal protein L27  67.82 
 
 		 88 aa  118  3e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0996  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 		 85 aa  117  6e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1537  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 		 85 aa  117  7.999999999999999e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2772  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 87 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.436114  normal  0.118024 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2181  50S ribosomal protein L27  65.52 
 
 		 88 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.128983  normal  0.935252 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2582  50S ribosomal protein L27  65.43 
 
 		 84 aa  115  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.6027199999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1415  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 85 aa  116  9.999999999999999e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3345  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 87 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1611  50S ribosomal protein L27  62.5 
 
 		 97 aa  116  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000833239  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0269  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 85 aa  115  1.9999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.876975  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2115  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 		 95 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000381623  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1341  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 85 aa  115  1.9999999999999998e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00883743  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3207  ribosomal protein L27  69.41 
 
 		 85 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0087  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 83 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000279495  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1725  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 85 aa  115  3e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0184  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 84 aa  115  3e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0503  ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 85 aa  114  3e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0090  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 84 aa  114  3.9999999999999997e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0327893  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0099  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 84 aa  114  3.9999999999999997e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1379  50S ribosomal protein L27  61.36 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0130  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 84 aa  114  3.9999999999999997e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4312  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 85 aa  114  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4334  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 85 aa  114  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4181  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 85 aa  114  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.186505  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2669  50S ribosomal protein L27  59.3 
 
 		 88 aa  114  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000924332  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2247  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 		 85 aa  114  6e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000000479005  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05401  50S ribosomal protein L27  67.05 
 
 		 88 aa  112  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60450  50S ribosomal protein L27  70.59 
 
 		 85 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0112062 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5207  50S ribosomal protein L27  70.59 
 
 		 85 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.121929  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0310  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 89 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1009  50S ribosomal protein L27  68.24 
 
 		 85 aa  112  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000911893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0530  50S ribosomal protein L27  62.65 
 
 		 98 aa  112  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163692  normal  0.125881 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2057  50S ribosomal protein L27  60.47 
 
 		 87 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.976216  normal  0.840982 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2854  50S ribosomal protein L27  69.77 
 
 		 86 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000234792  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2006  ribosomal protein L27  65.12 
 
 		 86 aa  111  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.962508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2002  50S ribosomal protein L27  60 
 
 		 85 aa  111  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.245442  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3478  ribosomal protein L27  70.24 
 
 		 85 aa  111  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000653762  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4327  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 85 aa  111  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.520915 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40780  50S ribosomal protein L27  67.06 
 
 		 85 aa  111  4.0000000000000004e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3359  ribosomal protein L27  67.86 
 
 		 85 aa  110  5e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000421163  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4336  50S ribosomal protein L27  58.89 
 
 		 98 aa  110  5e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000256783  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3460  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 89 aa  110  5e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159862  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0180  ribosomal protein L27  65.52 
 
 		 87 aa  110  5e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00344183  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0856  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 		 86 aa  110  5e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.701213  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0559  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 		 85 aa  110  6e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00191418  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0559  50S ribosomal protein L27  64.2 
 
 		 90 aa  110  7.000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2549  50S ribosomal protein L27  65.12 
 
 		 95 aa  110  7.000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000275731  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4511  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 		 85 aa  110  9e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0750  ribosomal protein L27  58.89 
 
 		 90 aa  110  9e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000003902  hitchhiker  0.00471075 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0794  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 		 85 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000203934  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1849  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0499  ribosomal protein L27  61.45 
 
 		 93 aa  109  1.0000000000000001e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1781  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.810643  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3322  50S ribosomal protein L27  70.73 
 
 		 84 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000182867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0865  50S ribosomal protein L27  67.09 
 
 		 87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.437144  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0238  ribosomal protein L27  58.89 
 
 		 87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1632  50S ribosomal protein L27  60.92 
 
 		 87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.848306  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0870  50S ribosomal protein L27  70.73 
 
 		 84 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000545576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1037  50S ribosomal protein L27  70.73 
 
 		 84 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000911721  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00801  50S ribosomal protein L27  69.51 
 
 		 85 aa  109  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1070  50S ribosomal protein L27  70.73 
 
 		 84 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000153229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001672  LSU ribosomal protein L27p  69.51 
 
 		 85 aa  109  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000226464  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0955  50S ribosomal protein L27  70.73 
 
 		 84 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.455715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0968  50S ribosomal protein L27  70.73 
 
 		 84 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000160226  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0485  50S ribosomal protein L27  60.44 
 
 		 87 aa  108  2.0000000000000002e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.229022  normal  0.0825407 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3975  50S ribosomal protein L27  70.73 
 
 		 85 aa  109  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000219143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3756  50S ribosomal protein L27  70.73 
 
 		 85 aa  109  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000137777  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3651  50S ribosomal protein L27  70.73 
 
 		 84 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0980  50S ribosomal protein L27  70.73 
 
 		 84 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000110997  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0853  50S ribosomal protein L27  70.73 
 
 		 84 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152445  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0108  50S ribosomal protein L27  62.07 
 
 		 87 aa  109  2.0000000000000002e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3471  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 87 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00282639  normal  0.386116 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1005  50S ribosomal protein L27  70.73 
 
 		 84 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000876711  decreased coverage  0.00000356458 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0838  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 		 85 aa  108  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.34705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1322  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 		 93 aa  109  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202247  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2534  50S ribosomal protein L27  65.12 
 
 		 89 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00269432  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2383  50S ribosomal protein L27  59.77 
 
 		 100 aa  108  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000271812  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2095  50S ribosomal protein L27  59.77 
 
 		 100 aa  108  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000243754  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0896  50S ribosomal protein L27  70.73 
 
 		 84 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000837185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3124  50S ribosomal protein L27  70.73 
 
 		 84 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000107863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0846  50S ribosomal protein L27  68.29 
 
 		 86 aa  109  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3218  50S ribosomal protein L27  70.73 
 
 		 84 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270517  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>