More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0454 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0454  50S ribosomal protein L27  100 
 
 		 89 aa  178  2e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2480  ribosomal protein L27  74.71 
 
 		 100 aa  139  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.782187  normal  0.22295 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1625  ribosomal protein L27  74.16 
 
 		 143 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.388698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4883  ribosomal protein L27  76.47 
 
 		 92 aa  137  6e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.113157  normal  0.111687 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1466  50S ribosomal protein L27  78.57 
 
 		 86 aa  135  1e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.55318  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0315  50S ribosomal protein L27  75.31 
 
 		 85 aa  130  5e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.385897 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0310  50S ribosomal protein L27  73.03 
 
 		 89 aa  130  5e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1546  50S ribosomal protein L27  73.49 
 
 		 86 aa  129  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.653067  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02725  50S ribosomal protein L27  75.9 
 
 		 86 aa  129  2.0000000000000002e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1201  50S ribosomal protein L27  72.41 
 
 		 89 aa  128  3e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.862516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2046  ribosomal protein L27  71.43 
 
 		 90 aa  127  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4102  50S ribosomal protein L27  72.29 
 
 		 90 aa  127  4.0000000000000003e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.500877 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1051  50S ribosomal protein L27  70.11 
 
 		 89 aa  126  9.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212456  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3870  50S ribosomal protein L27  71.26 
 
 		 89 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.403314  normal  0.0137956 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4194  50S ribosomal protein L27  71.26 
 
 		 89 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3006  50S ribosomal protein L27  72.41 
 
 		 89 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.549132 
 
 
-
 
NC_004310  BR1849  50S ribosomal protein L27  68.97 
 
 		 89 aa  124  3e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1781  50S ribosomal protein L27  68.97 
 
 		 89 aa  124  3e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.810643  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1461  50S ribosomal protein L27  68.97 
 
 		 89 aa  123  6e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0317862 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2143  50S ribosomal protein L27  68.54 
 
 		 90 aa  123  7e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.672881 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3460  50S ribosomal protein L27  68.97 
 
 		 89 aa  123  7e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159862  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3512  50S ribosomal protein L27  68.97 
 
 		 89 aa  123  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3820  50S ribosomal protein L27  68.97 
 
 		 89 aa  123  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360985  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4287  50S ribosomal protein L27  71.59 
 
 		 90 aa  123  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.835773  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0475  50S ribosomal protein L27  75.9 
 
 		 85 aa  122  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0828621  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0108  50S ribosomal protein L27  66.28 
 
 		 87 aa  123  1e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1482  50S ribosomal protein L27  67.42 
 
 		 93 aa  121  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0424  50S ribosomal protein L27  65.17 
 
 		 92 aa  119  9.999999999999999e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.85685  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3800  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 89 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0417  50S ribosomal protein L27  67.42 
 
 		 91 aa  119  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.302693 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3235  50S ribosomal protein L27  71.08 
 
 		 85 aa  118  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000158281  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1515  50S ribosomal protein L27  71.08 
 
 		 93 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0090282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4211  50S ribosomal protein L27  67.42 
 
 		 93 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.121619 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0269  50S ribosomal protein L27  69.41 
 
 		 85 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.876975  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3448  50S ribosomal protein L27  72.09 
 
 		 87 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0232252  hitchhiker  0.00744788 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3471  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 87 aa  117  3.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00282639  normal  0.386116 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0865  50S ribosomal protein L27  70.93 
 
 		 87 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.437144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3196  50S ribosomal protein L27  68.24 
 
 		 85 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000840306  unclonable  7.875010000000001e-24 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2281  50S ribosomal protein L27  63.22 
 
 		 89 aa  117  6e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.350544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0508  50S ribosomal protein L27  70.93 
 
 		 87 aa  117  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.868007  normal  0.531544 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3892  50S ribosomal protein L27  67.82 
 
 		 89 aa  117  7e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.624543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2651  50S ribosomal protein L27  72.62 
 
 		 86 aa  117  7e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0231869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0440  50S ribosomal protein L27  66.29 
 
 		 90 aa  116  9.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.944777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2006  ribosomal protein L27  71.43 
 
 		 86 aa  115  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.962508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3207  ribosomal protein L27  69.88 
 
 		 85 aa  115  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1632  50S ribosomal protein L27  69.77 
 
 		 87 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.848306  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3242  50S ribosomal protein L27  62.79 
 
 		 95 aa  115  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2785  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0242571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1120  50S ribosomal protein L27  71.76 
 
 		 87 aa  115  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.645406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0647  50S ribosomal protein L27  64.37 
 
 		 89 aa  115  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.908873 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2247  50S ribosomal protein L27  70.24 
 
 		 85 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000000479005  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40780  50S ribosomal protein L27  72.62 
 
 		 85 aa  114  3.9999999999999997e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05534  50S ribosomal protein L27  72.73 
 
 		 86 aa  114  3.9999999999999997e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000340822  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0853  50S ribosomal protein L27  70.73 
 
 		 84 aa  114  5e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152445  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00801  50S ribosomal protein L27  70.73 
 
 		 85 aa  114  5e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001672  LSU ribosomal protein L27p  70.73 
 
 		 85 aa  114  5e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000226464  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2854  50S ribosomal protein L27  70.73 
 
 		 86 aa  114  6e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000234792  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4921  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 88 aa  114  6e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0271507  normal  0.71556 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0515  50S ribosomal protein L27  66.29 
 
 		 90 aa  114  6e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0497  50S ribosomal protein L27  61.11 
 
 		 90 aa  114  6e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000367607  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0152  50S ribosomal protein L27  67.06 
 
 		 90 aa  113  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.670785  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4511  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 		 85 aa  113  6.9999999999999995e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1682  50S ribosomal protein L27  61.11 
 
 		 90 aa  113  6.9999999999999995e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00000249957  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4876  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 88 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.387156 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4413  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 88 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3589  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 		 84 aa  113  7.999999999999999e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000197888  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0856  50S ribosomal protein L27  66.28 
 
 		 86 aa  113  7.999999999999999e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.701213  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3465  50S ribosomal protein L27  63.64 
 
 		 94 aa  113  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.360708 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1572  50S ribosomal protein L27  69.51 
 
 		 85 aa  113  8.999999999999998e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.355414  normal  0.759943 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3322  50S ribosomal protein L27  69.51 
 
 		 84 aa  113  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000182867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1037  50S ribosomal protein L27  69.51 
 
 		 84 aa  113  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000911721  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0968  50S ribosomal protein L27  69.51 
 
 		 84 aa  113  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000160226  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1754  50S ribosomal protein L27  69.51 
 
 		 85 aa  113  8.999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.163114  normal  0.0575884 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1070  50S ribosomal protein L27  69.51 
 
 		 84 aa  113  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000153229  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0798  ribosomal protein L27  63.33 
 
 		 91 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0955  50S ribosomal protein L27  69.51 
 
 		 84 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.455715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0702  50S ribosomal protein L27  63.33 
 
 		 91 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.616074 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1583  50S ribosomal protein L27  69.05 
 
 		 85 aa  112  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0163  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 		 85 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000390958  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0870  50S ribosomal protein L27  69.51 
 
 		 84 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000545576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1526  50S ribosomal protein L27  69.05 
 
 		 85 aa  112  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0247  50S ribosomal protein L27  64.37 
 
 		 89 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3088  50S ribosomal protein L27  69.51 
 
 		 84 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2828  50S ribosomal protein L27  70.73 
 
 		 84 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000113295  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3651  50S ribosomal protein L27  69.51 
 
 		 84 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4724  50S ribosomal protein L27  65.52 
 
 		 88 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0668122  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0362  50S ribosomal protein L27  69.51 
 
 		 85 aa  112  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000249852  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0980  50S ribosomal protein L27  69.51 
 
 		 84 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000110997  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0154  50S ribosomal protein L27  64.04 
 
 		 90 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0588  50S ribosomal protein L27  62.92 
 
 		 90 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0146  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 		 85 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0896  50S ribosomal protein L27  68.29 
 
 		 84 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000837185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3124  50S ribosomal protein L27  68.29 
 
 		 84 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000107863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0846  50S ribosomal protein L27  69.41 
 
 		 86 aa  112  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0107  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 88 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.176189 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3218  50S ribosomal protein L27  69.51 
 
 		 84 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1241  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 85 aa  111  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.572861  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03730  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 		 85 aa  111  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00000322672  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0930  50S ribosomal protein L27  64.37 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1005  50S ribosomal protein L27  68.29 
 
 		 84 aa  111  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000876711  decreased coverage  0.00000356458 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>