More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0647 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_0647  50S ribosomal protein L27  100 
 
 		 89 aa  179  9.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.908873 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0424  50S ribosomal protein L27  83.15 
 
 		 92 aa  154  3e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.85685  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1220  50S ribosomal protein L27  81.82 
 
 		 88 aa  147  4e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3345  50S ribosomal protein L27  81.4 
 
 		 87 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2772  50S ribosomal protein L27  81.4 
 
 		 87 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.436114  normal  0.118024 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3242  50S ribosomal protein L27  77.53 
 
 		 95 aa  145  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3465  50S ribosomal protein L27  83.33 
 
 		 94 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.360708 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1515  50S ribosomal protein L27  84.34 
 
 		 93 aa  144  4.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0090282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3589  50S ribosomal protein L27  72.29 
 
 		 84 aa  130  3.9999999999999996e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000197888  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0163  50S ribosomal protein L27  73.49 
 
 		 85 aa  131  3.9999999999999996e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000390958  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3196  50S ribosomal protein L27  71.76 
 
 		 85 aa  130  7.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000840306  unclonable  7.875010000000001e-24 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3235  50S ribosomal protein L27  72.29 
 
 		 85 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000158281  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0530  50S ribosomal protein L27  69.66 
 
 		 98 aa  129  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163692  normal  0.125881 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0146  50S ribosomal protein L27  72.29 
 
 		 85 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4336  50S ribosomal protein L27  70.79 
 
 		 98 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000256783  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2237  ribosomal protein L27  68.97 
 
 		 91 aa  129  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0305  50S ribosomal protein L27  73.49 
 
 		 85 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000393871  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0348  50S ribosomal protein L27  71.08 
 
 		 84 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000453633  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2115  50S ribosomal protein L27  73.49 
 
 		 95 aa  128  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000381623  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1611  50S ribosomal protein L27  67.05 
 
 		 97 aa  125  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000833239  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3640  50S ribosomal protein L27  73.26 
 
 		 88 aa  126  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.320466  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2383  50S ribosomal protein L27  71.43 
 
 		 100 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000271812  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2095  50S ribosomal protein L27  71.43 
 
 		 100 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000243754  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2549  50S ribosomal protein L27  69.77 
 
 		 95 aa  124  3e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000275731  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0162  50S ribosomal protein L27  71.08 
 
 		 92 aa  124  6e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000470304  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1815  ribosomal protein L27  68.54 
 
 		 102 aa  123  8.000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1537  50S ribosomal protein L27  69.41 
 
 		 85 aa  123  1e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0910  50S ribosomal protein L27  68.18 
 
 		 96 aa  122  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1341  50S ribosomal protein L27  68.24 
 
 		 85 aa  122  2e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00883743  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1548  ribosomal protein L27  71.76 
 
 		 85 aa  122  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104993  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2540  50S ribosomal protein L27  68.18 
 
 		 96 aa  121  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000133026  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0090  50S ribosomal protein L27  69.88 
 
 		 84 aa  120  7e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0327893  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0099  50S ribosomal protein L27  69.88 
 
 		 84 aa  120  7e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0130  50S ribosomal protein L27  69.88 
 
 		 84 aa  120  7e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3157  50S ribosomal protein L27  65.91 
 
 		 96 aa  120  8e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00125079  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0996  50S ribosomal protein L27  67.06 
 
 		 85 aa  120  9e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0674  50S ribosomal protein L27  65.91 
 
 		 96 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000611432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4288  50S ribosomal protein L27  65.91 
 
 		 96 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000779074  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14110  ribosomal protein L27  69.51 
 
 		 92 aa  119  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000254683  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4534  50S ribosomal protein L27  65.91 
 
 		 96 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000009897  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4340  50S ribosomal protein L27  65.91 
 
 		 96 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000839795  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4176  50S ribosomal protein L27  65.91 
 
 		 96 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000152453  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4187  50S ribosomal protein L27  65.91 
 
 		 96 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0200239  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4674  50S ribosomal protein L27  65.91 
 
 		 96 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000903634  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4575  50S ribosomal protein L27  65.91 
 
 		 96 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000185796  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1112  ribosomal protein L27  70.93 
 
 		 86 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.55245  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1451  50S ribosomal protein L27  69.41 
 
 		 87 aa  119  9.999999999999999e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000000109711  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4522  50S ribosomal protein L27  65.91 
 
 		 96 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.230769 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4560  50S ribosomal protein L27  65.91 
 
 		 96 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05401  50S ribosomal protein L27  73.81 
 
 		 88 aa  119  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13991  50S ribosomal protein L27  73.81 
 
 		 88 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.228123 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0184  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 		 84 aa  118  1.9999999999999998e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3073  50S ribosomal protein L27  64.04 
 
 		 91 aa  118  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000209952  unclonable  0.0000000174741 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2582  50S ribosomal protein L27  68.29 
 
 		 84 aa  118  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.6027199999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2534  50S ribosomal protein L27  67.9 
 
 		 89 aa  118  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00269432  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1725  50S ribosomal protein L27  67.06 
 
 		 85 aa  118  3e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0180  ribosomal protein L27  67.82 
 
 		 87 aa  118  3e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00344183  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0499  ribosomal protein L27  68.67 
 
 		 93 aa  117  3.9999999999999996e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0559  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 		 90 aa  117  3.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3379  ribosomal protein L27  66.28 
 
 		 86 aa  116  9e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3314  50S ribosomal protein L27  65.52 
 
 		 88 aa  115  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000201837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1188  50S ribosomal protein L27  67.05 
 
 		 87 aa  116  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2128  50S ribosomal protein L27  68.18 
 
 		 88 aa  116  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.861173  normal  0.607727 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1415  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 		 85 aa  116  9.999999999999999e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2002  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 		 85 aa  116  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.245442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2143  50S ribosomal protein L27  62.92 
 
 		 90 aa  116  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.672881 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2181  50S ribosomal protein L27  65.17 
 
 		 88 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.188028  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2696  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 		 85 aa  115  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000136289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15461  50S ribosomal protein L27  70.24 
 
 		 86 aa  115  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.120914  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1209  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 		 94 aa  115  3e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000000066933  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1849  50S ribosomal protein L27  62.5 
 
 		 89 aa  115  3e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0794  50S ribosomal protein L27  74.39 
 
 		 85 aa  114  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000203934  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0559  50S ribosomal protein L27  74.39 
 
 		 85 aa  114  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00191418  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0087  50S ribosomal protein L27  73.17 
 
 		 83 aa  114  3e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000279495  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1735  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 		 94 aa  115  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000015343  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0454  50S ribosomal protein L27  64.37 
 
 		 89 aa  115  3e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1702  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 		 94 aa  115  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000326176  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1781  50S ribosomal protein L27  62.5 
 
 		 89 aa  115  3e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.810643  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1368  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 		 94 aa  114  3.9999999999999997e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000272527  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3471  50S ribosomal protein L27  66.28 
 
 		 87 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00282639  normal  0.386116 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0865  50S ribosomal protein L27  65.52 
 
 		 87 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.437144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13010  LSU ribosomal protein L27P  79.71 
 
 		 95 aa  114  3.9999999999999997e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000839598  normal  0.102019 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3207  ribosomal protein L27  71.95 
 
 		 85 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7270  50S ribosomal protein L27  68.24 
 
 		 85 aa  114  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410235  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0456  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 		 96 aa  114  3.9999999999999997e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.031206  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0269  50S ribosomal protein L27  67.06 
 
 		 85 aa  114  3.9999999999999997e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.876975  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3549  50S ribosomal protein L27  69.77 
 
 		 88 aa  114  5e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2651  ribosomal protein L27  65.12 
 
 		 95 aa  114  5e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000469897  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3554  50S ribosomal protein L27  69.77 
 
 		 88 aa  114  5e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3622  50S ribosomal protein L27  69.77 
 
 		 88 aa  114  5e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2006  ribosomal protein L27  67.86 
 
 		 86 aa  113  6.9999999999999995e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.962508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2636  50S ribosomal protein L27  79.71 
 
 		 88 aa  113  7.999999999999999e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.288729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05970  LSU ribosomal protein L27P  65.12 
 
 		 84 aa  112  1.0000000000000001e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000567704  hitchhiker  0.000000000000675699 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2691  50S ribosomal protein L27  66.28 
 
 		 89 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0303281  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1443  50S ribosomal protein L27  69.05 
 
 		 86 aa  112  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1051  50S ribosomal protein L27  62.5 
 
 		 89 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212456  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12468  50S ribosomal protein L27  79.71 
 
 		 86 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.141175  normal  0.856367 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2060  ribosomal protein L27  68.6 
 
 		 87 aa  113  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1651  ribosomal protein L27  78.26 
 
 		 84 aa  112  1.0000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000313884 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0916  50S ribosomal protein L27  67.42 
 
 		 90 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>