More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3242 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_3242  50S ribosomal protein L27  100 
 
 		 95 aa  191  3e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1515  50S ribosomal protein L27  89.16 
 
 		 93 aa  152  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0090282  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0424  50S ribosomal protein L27  79.78 
 
 		 92 aa  150  8e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.85685  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0647  50S ribosomal protein L27  77.53 
 
 		 89 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.908873 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3465  50S ribosomal protein L27  75 
 
 		 94 aa  144  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.360708 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3345  50S ribosomal protein L27  79.31 
 
 		 87 aa  140  6e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2772  50S ribosomal protein L27  79.31 
 
 		 87 aa  140  6e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.436114  normal  0.118024 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1220  50S ribosomal protein L27  73.86 
 
 		 88 aa  135  2e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0163  50S ribosomal protein L27  74.7 
 
 		 85 aa  134  6.0000000000000005e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000390958  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3589  50S ribosomal protein L27  73.49 
 
 		 84 aa  133  6.0000000000000005e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000197888  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0146  50S ribosomal protein L27  73.49 
 
 		 85 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0348  50S ribosomal protein L27  73.49 
 
 		 84 aa  132  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000453633  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0305  50S ribosomal protein L27  73.49 
 
 		 85 aa  131  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000393871  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3196  50S ribosomal protein L27  71.76 
 
 		 85 aa  130  3.9999999999999996e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000840306  unclonable  7.875010000000001e-24 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3235  50S ribosomal protein L27  72.29 
 
 		 85 aa  130  5e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000158281  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2237  ribosomal protein L27  69.88 
 
 		 91 aa  129  9e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3640  50S ribosomal protein L27  68.18 
 
 		 88 aa  127  7.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.320466  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4336  50S ribosomal protein L27  69.32 
 
 		 98 aa  126  8.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000256783  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2143  50S ribosomal protein L27  69.32 
 
 		 90 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.672881 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0090  50S ribosomal protein L27  69.88 
 
 		 84 aa  125  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0327893  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0184  50S ribosomal protein L27  69.88 
 
 		 84 aa  125  2.0000000000000002e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0130  50S ribosomal protein L27  69.88 
 
 		 84 aa  125  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0099  50S ribosomal protein L27  69.88 
 
 		 84 aa  125  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1725  50S ribosomal protein L27  68.24 
 
 		 85 aa  124  3e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1537  50S ribosomal protein L27  68.24 
 
 		 85 aa  125  3e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0996  50S ribosomal protein L27  69.41 
 
 		 85 aa  124  5e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1611  50S ribosomal protein L27  69.05 
 
 		 97 aa  124  5e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000833239  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0269  50S ribosomal protein L27  70.59 
 
 		 85 aa  124  6e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.876975  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2115  50S ribosomal protein L27  73.49 
 
 		 95 aa  123  7e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000381623  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1341  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 		 85 aa  123  9e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00883743  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00801  50S ribosomal protein L27  75.61 
 
 		 85 aa  122  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2582  50S ribosomal protein L27  71.95 
 
 		 84 aa  122  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.6027199999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0499  ribosomal protein L27  71.08 
 
 		 93 aa  122  2e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001672  LSU ribosomal protein L27p  75.61 
 
 		 85 aa  122  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000226464  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0856  50S ribosomal protein L27  69.77 
 
 		 86 aa  122  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.701213  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0865  50S ribosomal protein L27  69.77 
 
 		 87 aa  121  3e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.437144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0530  50S ribosomal protein L27  69.88 
 
 		 98 aa  121  3e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163692  normal  0.125881 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1815  ribosomal protein L27  67.78 
 
 		 102 aa  121  4e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2247  50S ribosomal protein L27  71.43 
 
 		 85 aa  120  6e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000000479005  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0559  50S ribosomal protein L27  73.17 
 
 		 85 aa  120  9e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00191418  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0794  50S ribosomal protein L27  73.17 
 
 		 85 aa  119  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000203934  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1415  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 		 85 aa  119  9.999999999999999e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0162  50S ribosomal protein L27  73.49 
 
 		 92 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000470304  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0362  50S ribosomal protein L27  74.39 
 
 		 85 aa  119  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000249852  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0559  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 		 90 aa  117  3.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2651  ribosomal protein L27  68.29 
 
 		 95 aa  117  3.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000469897  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3471  50S ribosomal protein L27  65.52 
 
 		 87 aa  117  4.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00282639  normal  0.386116 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0489  ribosomal protein L27  65.12 
 
 		 86 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0750  ribosomal protein L27  67.86 
 
 		 90 aa  117  4.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000003902  hitchhiker  0.00471075 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4511  50S ribosomal protein L27  70.73 
 
 		 85 aa  117  6e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2227  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 		 91 aa  116  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00813215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2696  50S ribosomal protein L27  63.41 
 
 		 85 aa  116  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000136289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3737  50S ribosomal protein L27  71.95 
 
 		 85 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000346028  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0238  ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 87 aa  116  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0846  50S ribosomal protein L27  73.17 
 
 		 86 aa  116  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1849  50S ribosomal protein L27  62.5 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3073  50S ribosomal protein L27  62.07 
 
 		 91 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000209952  unclonable  0.0000000174741 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4496  50S ribosomal protein L27  69.51 
 
 		 85 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.191975  normal  0.508112 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3359  ribosomal protein L27  70.73 
 
 		 85 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000421163  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0870  50S ribosomal protein L27  70.73 
 
 		 84 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000545576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1781  50S ribosomal protein L27  62.5 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.810643  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3207  ribosomal protein L27  73.17 
 
 		 85 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2854  50S ribosomal protein L27  66.28 
 
 		 86 aa  115  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000234792  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0503  ribosomal protein L27  62.65 
 
 		 85 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15461  50S ribosomal protein L27  70.24 
 
 		 86 aa  115  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.120914  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0955  50S ribosomal protein L27  70.73 
 
 		 84 aa  115  3e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.455715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0721  50S ribosomal protein L27  68.29 
 
 		 85 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.980566  normal  0.0233999 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0689  50S ribosomal protein L27  68.29 
 
 		 85 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0764  50S ribosomal protein L27  70.24 
 
 		 85 aa  115  3e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000191049  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1847  50S ribosomal protein L27  70.51 
 
 		 85 aa  115  3e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5207  50S ribosomal protein L27  73.17 
 
 		 85 aa  114  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.121929  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3975  50S ribosomal protein L27  70.73 
 
 		 85 aa  114  3e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000219143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3611  50S ribosomal protein L27  70.73 
 
 		 85 aa  114  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000711047  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3460  50S ribosomal protein L27  61.36 
 
 		 89 aa  114  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159862  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0454  50S ribosomal protein L27  62.79 
 
 		 89 aa  115  3e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0721  50S ribosomal protein L27  68.29 
 
 		 85 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.71975 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3756  50S ribosomal protein L27  70.73 
 
 		 85 aa  114  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000137777  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60450  50S ribosomal protein L27  73.17 
 
 		 85 aa  114  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0112062 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0310  50S ribosomal protein L27  61.36 
 
 		 89 aa  115  3e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1632  50S ribosomal protein L27  66.28 
 
 		 87 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.848306  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2002  50S ribosomal protein L27  63.41 
 
 		 85 aa  114  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.245442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1451  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 		 87 aa  114  5e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000000109711  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1051  50S ribosomal protein L27  61.36 
 
 		 89 aa  114  6e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212456  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0853  50S ribosomal protein L27  69.51 
 
 		 84 aa  114  6e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152445  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2703  50S ribosomal protein L27  63.64 
 
 		 92 aa  114  6e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2575  50S ribosomal protein L27  63.64 
 
 		 92 aa  114  6e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4859  50S ribosomal protein L27  69.51 
 
 		 85 aa  114  6e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2006  ribosomal protein L27  69.05 
 
 		 86 aa  114  6e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.962508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0475  50S ribosomal protein L27  69.51 
 
 		 85 aa  114  6e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0828621  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4883  ribosomal protein L27  61.36 
 
 		 92 aa  114  6e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.113157  normal  0.111687 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2957  50S ribosomal protein L27  66.28 
 
 		 86 aa  113  6.9999999999999995e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668202  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0896  50S ribosomal protein L27  70.73 
 
 		 84 aa  113  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000837185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3124  50S ribosomal protein L27  70.73 
 
 		 84 aa  113  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000107863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3276  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 		 85 aa  113  6.9999999999999995e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000212602 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4237  50S ribosomal protein L27  71.95 
 
 		 85 aa  113  7.999999999999999e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000765087  hitchhiker  0.00000018706 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3651  50S ribosomal protein L27  69.51 
 
 		 84 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14110  ribosomal protein L27  64.84 
 
 		 92 aa  113  7.999999999999999e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000254683  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0968  50S ribosomal protein L27  69.51 
 
 		 84 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000160226  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1037  50S ribosomal protein L27  69.51 
 
 		 84 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000911721  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3218  50S ribosomal protein L27  69.51 
 
 		 84 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270517  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>