More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0485 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0485  50S ribosomal protein L27  100 
 
 		 87 aa  175  2e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.229022  normal  0.0825407 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0238  ribosomal protein L27  78.75 
 
 		 87 aa  135  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2143  50S ribosomal protein L27  61.8 
 
 		 90 aa  112  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.672881 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3242  50S ribosomal protein L27  60.23 
 
 		 95 aa  110  6e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2480  ribosomal protein L27  67.05 
 
 		 100 aa  110  9e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.782187  normal  0.22295 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0310  50S ribosomal protein L27  63.64 
 
 		 89 aa  110  9e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3006  50S ribosomal protein L27  62.5 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.549132 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4287  50S ribosomal protein L27  64.04 
 
 		 90 aa  109  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.835773  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3235  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 		 85 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000158281  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1849  50S ribosomal protein L27  72.46 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0424  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 		 92 aa  108  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.85685  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1515  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 		 93 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0090282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4211  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 		 93 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.121619 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2046  ribosomal protein L27  71.62 
 
 		 90 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1781  50S ribosomal protein L27  72.46 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.810643  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1625  ribosomal protein L27  69.44 
 
 		 143 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.388698 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2237  ribosomal protein L27  60.44 
 
 		 91 aa  108  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140821  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0750  ribosomal protein L27  64.44 
 
 		 90 aa  108  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000003902  hitchhiker  0.00471075 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3196  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 85 aa  108  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000840306  unclonable  7.875010000000001e-24 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3460  50S ribosomal protein L27  70.83 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159862  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1415  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 85 aa  107  4.0000000000000004e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2217  50S ribosomal protein L27  68 
 
 		 91 aa  107  4.0000000000000004e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.856627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4883  ribosomal protein L27  65.17 
 
 		 92 aa  107  6e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.113157  normal  0.111687 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3870  50S ribosomal protein L27  60.23 
 
 		 89 aa  107  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.403314  normal  0.0137956 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4724  50S ribosomal protein L27  61.63 
 
 		 88 aa  107  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0668122  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1051  50S ribosomal protein L27  71.01 
 
 		 89 aa  107  6e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212456  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4194  50S ribosomal protein L27  60.23 
 
 		 89 aa  107  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0417  50S ribosomal protein L27  60 
 
 		 91 aa  106  9.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.302693 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4921  50S ribosomal protein L27  63.22 
 
 		 88 aa  106  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0271507  normal  0.71556 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0892  50S ribosomal protein L27  67.57 
 
 		 85 aa  106  1e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0670599 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0232  50S ribosomal protein L27  68.29 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0107  50S ribosomal protein L27  64.37 
 
 		 88 aa  105  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.176189 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4876  50S ribosomal protein L27  63.22 
 
 		 88 aa  105  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.387156 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3140  50S ribosomal protein L27  62.96 
 
 		 81 aa  105  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122142  normal  0.711179 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4413  50S ribosomal protein L27  63.22 
 
 		 88 aa  105  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05534  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 		 86 aa  105  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000340822  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1120  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 87 aa  105  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.645406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3322  50S ribosomal protein L27  67.12 
 
 		 84 aa  104  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000182867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1037  50S ribosomal protein L27  67.12 
 
 		 84 aa  104  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000911721  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2582  50S ribosomal protein L27  66.22 
 
 		 84 aa  105  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.6027199999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0269  50S ribosomal protein L27  60.71 
 
 		 85 aa  105  3e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.876975  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0968  50S ribosomal protein L27  67.12 
 
 		 84 aa  104  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000160226  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1070  50S ribosomal protein L27  67.12 
 
 		 84 aa  104  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000153229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0846  50S ribosomal protein L27  64 
 
 		 86 aa  104  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0193  50S ribosomal protein L27  62.92 
 
 		 90 aa  104  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.451706 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1537  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 		 85 aa  104  3e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0305  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 		 85 aa  104  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000393871  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3651  50S ribosomal protein L27  67.12 
 
 		 84 aa  104  5e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0870  50S ribosomal protein L27  67.12 
 
 		 84 aa  104  5e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000545576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2115  50S ribosomal protein L27  61.11 
 
 		 95 aa  104  5e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000381623  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3188  50S ribosomal protein L27  63.22 
 
 		 89 aa  104  5e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.263255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0980  50S ribosomal protein L27  67.12 
 
 		 84 aa  104  5e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000110997  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0896  50S ribosomal protein L27  67.12 
 
 		 84 aa  104  5e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000837185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3124  50S ribosomal protein L27  67.12 
 
 		 84 aa  104  5e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000107863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3218  50S ribosomal protein L27  67.12 
 
 		 84 aa  104  5e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2828  50S ribosomal protein L27  67.12 
 
 		 84 aa  103  5e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000113295  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0853  50S ribosomal protein L27  67.12 
 
 		 84 aa  103  6e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152445  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3418  50S ribosomal protein L27  59.3 
 
 		 88 aa  103  6e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4102  50S ribosomal protein L27  59.55 
 
 		 90 aa  103  6e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.500877 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0955  50S ribosomal protein L27  67.12 
 
 		 84 aa  103  6e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.455715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1005  50S ribosomal protein L27  67.12 
 
 		 84 aa  103  7e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000876711  decreased coverage  0.00000356458 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0110  50S ribosomal protein L27  63.95 
 
 		 87 aa  103  7e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000081142  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0454  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 89 aa  103  7e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3800  50S ribosomal protein L27  60.67 
 
 		 89 aa  103  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3207  ribosomal protein L27  64.38 
 
 		 85 aa  103  8e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2247  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 85 aa  103  8e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000000479005  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2854  50S ribosomal protein L27  65.75 
 
 		 86 aa  103  8e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000234792  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2926  50S ribosomal protein L27  67.12 
 
 		 84 aa  103  8e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000309766  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3088  50S ribosomal protein L27  67.12 
 
 		 84 aa  103  8e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1220  50S ribosomal protein L27  60.23 
 
 		 88 aa  103  9e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0108  50S ribosomal protein L27  63.38 
 
 		 87 aa  103  9e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0284  50S ribosomal protein L27  64 
 
 		 86 aa  102  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.349085  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3465  50S ribosomal protein L27  59.77 
 
 		 94 aa  102  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.360708 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1847  50S ribosomal protein L27  62.2 
 
 		 85 aa  103  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0508  50S ribosomal protein L27  60.71 
 
 		 87 aa  102  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.868007  normal  0.531544 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0461  50S ribosomal protein L27  64 
 
 		 86 aa  102  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00297252 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03730  50S ribosomal protein L27  65.75 
 
 		 85 aa  102  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00000322672  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2227  50S ribosomal protein L27  61.54 
 
 		 91 aa  103  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00813215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2785  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 89 aa  102  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0242571  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0146  50S ribosomal protein L27  62.65 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05970  LSU ribosomal protein L27P  60.49 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000567704  hitchhiker  0.000000000000675699 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1583  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2703  50S ribosomal protein L27  57.78 
 
 		 92 aa  102  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2575  50S ribosomal protein L27  57.78 
 
 		 92 aa  102  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1526  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00801  50S ribosomal protein L27  64.38 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3916  50S ribosomal protein L27  58.62 
 
 		 91 aa  102  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00853508 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001672  LSU ribosomal protein L27p  64.38 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000226464  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2772  50S ribosomal protein L27  58.62 
 
 		 87 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.436114  normal  0.118024 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2651  50S ribosomal protein L27  59.52 
 
 		 86 aa  102  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0231869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3345  50S ribosomal protein L27  58.62 
 
 		 87 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1269  50S ribosomal protein L27  62.65 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000774064  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0647  50S ribosomal protein L27  56.18 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.908873 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2006  ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 86 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.962508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1611  50S ribosomal protein L27  62.65 
 
 		 97 aa  102  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000833239  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4237  50S ribosomal protein L27  63.51 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000765087  hitchhiker  0.00000018706 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0348  50S ribosomal protein L27  61.45 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000453633  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0475  50S ribosomal protein L27  65.75 
 
 		 85 aa  101  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0828621  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0099  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 		 84 aa  101  3e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0530  50S ribosomal protein L27  61.36 
 
 		 98 aa  101  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163692  normal  0.125881 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>