More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2046 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2046  ribosomal protein L27  100 
 
 		 90 aa  178  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0454  50S ribosomal protein L27  71.43 
 
 		 89 aa  127  4.0000000000000003e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4883  ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 92 aa  121  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.113157  normal  0.111687 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2480  ribosomal protein L27  67.9 
 
 		 100 aa  121  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.782187  normal  0.22295 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1051  50S ribosomal protein L27  64.04 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212456  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1849  50S ribosomal protein L27  64.04 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3820  50S ribosomal protein L27  62.92 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360985  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1781  50S ribosomal protein L27  64.04 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.810643  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3512  50S ribosomal protein L27  62.92 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0315  50S ribosomal protein L27  62.65 
 
 		 85 aa  113  6.9999999999999995e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.385897 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4102  50S ribosomal protein L27  61.36 
 
 		 90 aa  113  7.999999999999999e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.500877 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0475  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 		 85 aa  113  8.999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0828621  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0310  50S ribosomal protein L27  65.43 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3460  50S ribosomal protein L27  61.8 
 
 		 89 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159862  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1625  ribosomal protein L27  64.2 
 
 		 143 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.388698 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1482  50S ribosomal protein L27  65.43 
 
 		 93 aa  111  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3800  50S ribosomal protein L27  59.55 
 
 		 89 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02725  50S ribosomal protein L27  69.14 
 
 		 86 aa  110  7.000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3006  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 89 aa  110  8.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.549132 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1120  50S ribosomal protein L27  66.28 
 
 		 87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.645406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1466  50S ribosomal protein L27  62.79 
 
 		 86 aa  109  1.0000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.55318  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3207  ribosomal protein L27  65.85 
 
 		 85 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4194  50S ribosomal protein L27  65.43 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3870  50S ribosomal protein L27  65.43 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.403314  normal  0.0137956 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0269  50S ribosomal protein L27  64.63 
 
 		 85 aa  108  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.876975  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0485  50S ribosomal protein L27  71.62 
 
 		 87 aa  108  2.0000000000000002e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.229022  normal  0.0825407 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2854  50S ribosomal protein L27  61.63 
 
 		 86 aa  108  3e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000234792  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1241  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 85 aa  108  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.572861  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0841  ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 84 aa  108  3e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.82493e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2926  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 84 aa  108  3e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000309766  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0870  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 84 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000545576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0968  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 84 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000160226  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0853  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 		 84 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152445  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1546  50S ribosomal protein L27  64.2 
 
 		 86 aa  107  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.653067  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1201  50S ribosomal protein L27  59.55 
 
 		 89 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.862516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0846  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 		 86 aa  107  4.0000000000000004e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3088  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 84 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1070  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 84 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000153229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3322  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 84 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000182867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1037  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 84 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000911721  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4287  50S ribosomal protein L27  61.11 
 
 		 90 aa  107  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.835773  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3651  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 84 aa  107  5e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0955  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 		 84 aa  107  5e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.455715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0426  50S ribosomal protein L27  59.09 
 
 		 89 aa  107  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3218  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 84 aa  107  5e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0980  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 84 aa  107  5e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000110997  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2828  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 84 aa  107  5e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000113295  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0892  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 		 85 aa  107  6e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0670599 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05534  50S ribosomal protein L27  69.51 
 
 		 86 aa  107  6e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000340822  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2247  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 		 85 aa  106  8.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000000479005  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3282  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 91 aa  106  8.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0455195 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0896  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 84 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000837185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3124  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 84 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000107863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0461  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 		 86 aa  106  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00297252 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3611  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 85 aa  105  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000711047  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1572  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 85 aa  106  1e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.355414  normal  0.759943 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3756  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 85 aa  105  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000137777  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1005  50S ribosomal protein L27  62.65 
 
 		 84 aa  106  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000876711  decreased coverage  0.00000356458 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3975  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 85 aa  105  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000219143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1754  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 85 aa  106  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.163114  normal  0.0575884 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0284  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 		 86 aa  106  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.349085  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03050  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00726587  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0522  ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000023922  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00801  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3235  50S ribosomal protein L27  62.96 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000158281  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3585  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000250774  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0515  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000794781  normal  0.0169565 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0865  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 87 aa  105  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.437144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03730  50S ribosomal protein L27  64.63 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00000322672  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1515  50S ribosomal protein L27  64.2 
 
 		 93 aa  105  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0090282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0863  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0966779  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001672  LSU ribosomal protein L27p  61.9 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000226464  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3378  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.4045e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3465  50S ribosomal protein L27  58.89 
 
 		 94 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.360708 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0424  50S ribosomal protein L27  59.34 
 
 		 92 aa  105  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.85685  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03001  hypothetical protein  61.9 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0066535  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0108  50S ribosomal protein L27  58.54 
 
 		 87 aa  105  2e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0362  50S ribosomal protein L27  63.41 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000249852  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4507  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000060246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3481  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000491459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3670  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000967389  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3359  ribosomal protein L27  62.2 
 
 		 85 aa  105  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000421163  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4511  50S ribosomal protein L27  60.98 
 
 		 85 aa  104  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2582  50S ribosomal protein L27  63.29 
 
 		 84 aa  104  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.6027199999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0643  50S ribosomal protein L27  60.49 
 
 		 84 aa  105  3e-22  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.301948  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4211  50S ribosomal protein L27  60.71 
 
 		 93 aa  104  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.121619 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2237  ribosomal protein L27  53.33 
 
 		 91 aa  104  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0247  50S ribosomal protein L27  57.3 
 
 		 89 aa  104  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3737  50S ribosomal protein L27  62.2 
 
 		 85 aa  104  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000346028  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3564  50S ribosomal protein L27  63.41 
 
 		 85 aa  104  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00211833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2143  50S ribosomal protein L27  57.95 
 
 		 90 aa  104  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.672881 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3471  50S ribosomal protein L27  60.98 
 
 		 87 aa  104  5e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00282639  normal  0.386116 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3600  50S ribosomal protein L27  63.41 
 
 		 85 aa  104  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00592088  normal  0.834432 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4327  50S ribosomal protein L27  56.79 
 
 		 85 aa  104  5e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.520915 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3493  50S ribosomal protein L27  63.41 
 
 		 85 aa  104  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000310399  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40780  50S ribosomal protein L27  68.29 
 
 		 85 aa  103  5e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0152  50S ribosomal protein L27  60.23 
 
 		 90 aa  104  5e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.670785  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3662  50S ribosomal protein L27  63.41 
 
 		 85 aa  104  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.0000324123  normal  0.0701159 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3495  50S ribosomal protein L27  63.41 
 
 		 85 aa  104  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000222447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0588  50S ribosomal protein L27  57.95 
 
 		 90 aa  103  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>