More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1611 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1611  50S ribosomal protein L27  100 
 
 
97 aa  197  3.9999999999999996e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000833239  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2549  50S ribosomal protein L27  76.6 
 
 
95 aa  149  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000275731  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2115  50S ribosomal protein L27  86.05 
 
 
95 aa  147  6e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000381623  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0559  50S ribosomal protein L27  78.02 
 
 
90 aa  145  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2383  50S ribosomal protein L27  76.6 
 
 
100 aa  145  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000271812  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2095  50S ribosomal protein L27  76.6 
 
 
100 aa  145  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000243754  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4336  50S ribosomal protein L27  74.73 
 
 
98 aa  142  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000256783  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0162  50S ribosomal protein L27  75.82 
 
 
92 aa  140  5e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000470304  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1322  50S ribosomal protein L27  75.27 
 
 
93 aa  139  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202247  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1735  50S ribosomal protein L27  75 
 
 
94 aa  138  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000015343  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1702  50S ribosomal protein L27  75 
 
 
94 aa  138  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000326176  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3157  50S ribosomal protein L27  73.91 
 
 
96 aa  138  3e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00125079  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4534  50S ribosomal protein L27  73.91 
 
 
96 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000009897  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4575  50S ribosomal protein L27  73.91 
 
 
96 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000185796  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4560  50S ribosomal protein L27  73.91 
 
 
96 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1209  50S ribosomal protein L27  73.91 
 
 
94 aa  137  6e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000000066933  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4340  50S ribosomal protein L27  72.83 
 
 
96 aa  136  8.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000839795  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4176  50S ribosomal protein L27  72.83 
 
 
96 aa  136  8.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000152453  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4187  50S ribosomal protein L27  72.83 
 
 
96 aa  136  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0200239  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4674  50S ribosomal protein L27  72.83 
 
 
96 aa  136  8.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000903634  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4522  50S ribosomal protein L27  72.83 
 
 
96 aa  136  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.230769 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0674  50S ribosomal protein L27  72.83 
 
 
96 aa  136  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000611432  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4288  50S ribosomal protein L27  72.83 
 
 
96 aa  136  8.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000779074  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0910  50S ribosomal protein L27  70.97 
 
 
96 aa  134  5e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2540  50S ribosomal protein L27  72.04 
 
 
96 aa  134  5e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000133026  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1368  50S ribosomal protein L27  70.65 
 
 
94 aa  132  1.9999999999999998e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000272527  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1815  ribosomal protein L27  69.15 
 
 
102 aa  131  3e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1120  50S ribosomal protein L27  70.53 
 
 
99 aa  131  3.9999999999999996e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000194791  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0456  50S ribosomal protein L27  72.73 
 
 
96 aa  130  5e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.031206  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0746  50S ribosomal protein L27  70.45 
 
 
103 aa  130  9e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000122269  hitchhiker  0.000403944 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3465  50S ribosomal protein L27  73.81 
 
 
94 aa  128  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.360708 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0424  50S ribosomal protein L27  71.08 
 
 
92 aa  128  2.0000000000000002e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.85685  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1451  50S ribosomal protein L27  70.11 
 
 
87 aa  128  2.0000000000000002e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000000109711  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0530  50S ribosomal protein L27  68.42 
 
 
98 aa  128  3e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163692  normal  0.125881 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2534  50S ribosomal protein L27  73.86 
 
 
89 aa  127  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00269432  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0647  50S ribosomal protein L27  67.05 
 
 
89 aa  125  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.908873 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3314  50S ribosomal protein L27  74.42 
 
 
88 aa  124  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000201837  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1182  50S ribosomal protein L27  68.48 
 
 
94 aa  125  3e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0143034  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3196  50S ribosomal protein L27  72.29 
 
 
85 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000840306  unclonable  7.875010000000001e-24 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3242  50S ribosomal protein L27  69.05 
 
 
95 aa  124  5e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14110  ribosomal protein L27  75 
 
 
92 aa  123  7e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000254683  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3235  50S ribosomal protein L27  71.08 
 
 
85 aa  123  8.000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000158281  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3345  50S ribosomal protein L27  70.24 
 
 
87 aa  123  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2772  50S ribosomal protein L27  70.24 
 
 
87 aa  123  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.436114  normal  0.118024 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1515  50S ribosomal protein L27  71.08 
 
 
93 aa  123  9e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0090282  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1325  50S ribosomal protein L27  68.54 
 
 
105 aa  122  2e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00638387  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0414  50S ribosomal protein L27  65.56 
 
 
93 aa  120  8e-27  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0656018  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2582  50S ribosomal protein L27  72.29 
 
 
84 aa  119  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.6027199999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3589  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 
84 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000197888  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl439  50S ribosomal protein L27  63.44 
 
 
95 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000583794  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1220  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 
88 aa  119  1.9999999999999998e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0146  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 
85 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0180  ribosomal protein L27  69.41 
 
 
87 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00344183  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0764  50S ribosomal protein L27  70.93 
 
 
85 aa  117  3.9999999999999996e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000191049  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2651  ribosomal protein L27  63.74 
 
 
95 aa  117  4.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000469897  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0163  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 
85 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000390958  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0499  ribosomal protein L27  64.84 
 
 
93 aa  117  6e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1190  50S ribosomal protein L27  62.92 
 
 
93 aa  116  7.999999999999999e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000026143  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0305  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 
85 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000393871  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2237  ribosomal protein L27  62.5 
 
 
91 aa  116  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140821  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0928  ribosomal protein L27  71.43 
 
 
97 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000470923  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0348  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 
84 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000453633  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1537  50S ribosomal protein L27  64.63 
 
 
85 aa  112  2.0000000000000002e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2227  50S ribosomal protein L27  67.06 
 
 
91 aa  110  7.000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00813215  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0269  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 
85 aa  109  1.0000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.876975  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0865  50S ribosomal protein L27  65.52 
 
 
87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.437144  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1548  ribosomal protein L27  66.27 
 
 
85 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104993  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1466  50S ribosomal protein L27  66.28 
 
 
86 aa  109  1.0000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.55318  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0099  50S ribosomal protein L27  63.41 
 
 
84 aa  108  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0090  50S ribosomal protein L27  63.41 
 
 
84 aa  108  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0327893  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0130  50S ribosomal protein L27  63.41 
 
 
84 aa  108  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3640  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 
88 aa  108  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.320466  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1341  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 
85 aa  108  3e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00883743  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0896  ribosomal protein L27  64.77 
 
 
92 aa  108  3e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000144427  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02725  50S ribosomal protein L27  62.79 
 
 
86 aa  107  4.0000000000000004e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0750  ribosomal protein L27  65.48 
 
 
90 aa  107  4.0000000000000004e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000003902  hitchhiker  0.00471075 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0958  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 
106 aa  107  5e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000205292  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1725  50S ribosomal protein L27  62.2 
 
 
85 aa  107  5e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2181  50S ribosomal protein L27  62.5 
 
 
88 aa  107  6e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.188028  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2651  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 
86 aa  107  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0231869  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2143  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 
90 aa  107  6e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.672881 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0184  50S ribosomal protein L27  62.2 
 
 
84 aa  107  7.000000000000001e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2459  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 
85 aa  107  7.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.177847 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1112  ribosomal protein L27  64.71 
 
 
86 aa  106  8.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.55245  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3448  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 
87 aa  106  8.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0232252  hitchhiker  0.00744788 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1524  50S ribosomal protein L27  69.14 
 
 
86 aa  106  8.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.846788  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4883  ribosomal protein L27  61.9 
 
 
92 aa  106  9.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.113157  normal  0.111687 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3667  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 
87 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000345306  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0100  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 
87 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00352754  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0510  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 
87 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0309377  normal  0.755964 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2801  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 
87 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000884705  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0485  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 
87 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0162621  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0582  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 
87 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00040366  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0552  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 
87 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000367957  normal  0.045539 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1009  50S ribosomal protein L27  63.41 
 
 
85 aa  106  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000911893  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4237  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 
85 aa  106  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000765087  hitchhiker  0.00000018706 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0454  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 
89 aa  106  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3379  ribosomal protein L27  64.63 
 
 
86 aa  106  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0232  50S ribosomal protein L27  59.52 
 
 
89 aa  105  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0508  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 
87 aa  105  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.868007  normal  0.531544 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>