More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1220 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1220  50S ribosomal protein L27  100 
 
 
88 aa  173  7e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0647  50S ribosomal protein L27  81.82 
 
 
89 aa  147  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.908873 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0424  50S ribosomal protein L27  82.14 
 
 
92 aa  145  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.85685  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1515  50S ribosomal protein L27  83.13 
 
 
93 aa  137  3.9999999999999997e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0090282  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3345  50S ribosomal protein L27  78.31 
 
 
87 aa  135  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2772  50S ribosomal protein L27  78.31 
 
 
87 aa  135  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.436114  normal  0.118024 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3242  50S ribosomal protein L27  73.86 
 
 
95 aa  135  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3465  50S ribosomal protein L27  74.42 
 
 
94 aa  135  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.360708 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3235  50S ribosomal protein L27  75 
 
 
85 aa  126  8.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000158281  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3196  50S ribosomal protein L27  73.81 
 
 
85 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000840306  unclonable  7.875010000000001e-24 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2115  50S ribosomal protein L27  69.32 
 
 
95 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000381623  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0163  50S ribosomal protein L27  75 
 
 
85 aa  124  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000390958  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4336  50S ribosomal protein L27  69.32 
 
 
98 aa  124  6e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000256783  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3589  50S ribosomal protein L27  72.62 
 
 
84 aa  123  7e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000197888  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0146  50S ribosomal protein L27  73.81 
 
 
85 aa  123  8.000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0305  50S ribosomal protein L27  75 
 
 
85 aa  123  9e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000393871  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1548  ribosomal protein L27  72.09 
 
 
85 aa  122  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104993  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2237  ribosomal protein L27  69.05 
 
 
91 aa  122  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140821  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14110  ribosomal protein L27  71.95 
 
 
92 aa  121  3e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000254683  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2549  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 
95 aa  121  4e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000275731  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0348  50S ribosomal protein L27  72.29 
 
 
84 aa  121  4e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000453633  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1725  50S ribosomal protein L27  72.62 
 
 
85 aa  118  1.9999999999999998e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0180  ribosomal protein L27  72.62 
 
 
87 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00344183  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1611  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 
97 aa  119  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000833239  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1537  50S ribosomal protein L27  72.62 
 
 
85 aa  119  1.9999999999999998e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0184  50S ribosomal protein L27  72.62 
 
 
84 aa  118  3e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0090  50S ribosomal protein L27  72.62 
 
 
84 aa  117  3.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0327893  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0130  50S ribosomal protein L27  72.62 
 
 
84 aa  117  3.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0099  50S ribosomal protein L27  72.62 
 
 
84 aa  117  3.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2060  ribosomal protein L27  71.59 
 
 
87 aa  117  4.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7270  50S ribosomal protein L27  70.93 
 
 
85 aa  117  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410235  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2383  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 
100 aa  117  6e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000271812  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2095  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 
100 aa  117  6e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000243754  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0910  50S ribosomal protein L27  65.91 
 
 
96 aa  117  7e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2582  50S ribosomal protein L27  70.73 
 
 
84 aa  117  7e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.6027199999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2002  50S ribosomal protein L27  69.05 
 
 
85 aa  116  9e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.245442  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0559  50S ribosomal protein L27  70.73 
 
 
90 aa  116  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05401  50S ribosomal protein L27  67.82 
 
 
88 aa  116  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1451  50S ribosomal protein L27  71.43 
 
 
87 aa  116  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000000109711  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3456  50S ribosomal protein L27  68.6 
 
 
85 aa  115  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225888  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0530  50S ribosomal protein L27  67.05 
 
 
98 aa  115  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163692  normal  0.125881 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0019  50S ribosomal protein L27  70.24 
 
 
86 aa  115  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0750  ribosomal protein L27  64.77 
 
 
90 aa  115  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000003902  hitchhiker  0.00471075 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1188  50S ribosomal protein L27  67.05 
 
 
87 aa  115  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1589  ribosomal protein L27  72.84 
 
 
85 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00579219  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0162  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 
92 aa  115  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000470304  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3157  50S ribosomal protein L27  63.64 
 
 
96 aa  114  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00125079  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0996  50S ribosomal protein L27  70.24 
 
 
85 aa  114  3e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1651  ribosomal protein L27  77.33 
 
 
84 aa  115  3e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000313884 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13991  50S ribosomal protein L27  70.24 
 
 
88 aa  115  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.228123 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3640  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 
88 aa  115  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.320466  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4340  50S ribosomal protein L27  63.64 
 
 
96 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000839795  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4176  50S ribosomal protein L27  63.64 
 
 
96 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000152453  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0674  50S ribosomal protein L27  63.64 
 
 
96 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000611432  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4187  50S ribosomal protein L27  63.64 
 
 
96 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0200239  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4674  50S ribosomal protein L27  63.64 
 
 
96 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000903634  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4522  50S ribosomal protein L27  63.64 
 
 
96 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.230769 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1112  ribosomal protein L27  71.76 
 
 
86 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.55245  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4288  50S ribosomal protein L27  63.64 
 
 
96 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000779074  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3460  50S ribosomal protein L27  65.91 
 
 
89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159862  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4534  50S ribosomal protein L27  63.64 
 
 
96 aa  114  5e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000009897  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1415  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 
85 aa  114  5e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4560  50S ribosomal protein L27  63.64 
 
 
96 aa  114  5e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0838  50S ribosomal protein L27  71.76 
 
 
85 aa  114  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.34705  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2540  50S ribosomal protein L27  64.77 
 
 
96 aa  114  5e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000133026  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4575  50S ribosomal protein L27  63.64 
 
 
96 aa  114  5e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000185796  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3379  ribosomal protein L27  67.86 
 
 
86 aa  114  5e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2259  ribosomal protein L27  68.6 
 
 
86 aa  114  6e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.583782  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2282  ribosomal protein L27  76 
 
 
84 aa  114  6e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.277784  hitchhiker  0.000388636 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1781  50S ribosomal protein L27  64.77 
 
 
89 aa  113  6.9999999999999995e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.810643  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1849  50S ribosomal protein L27  64.77 
 
 
89 aa  113  6.9999999999999995e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2534  50S ribosomal protein L27  69.14 
 
 
89 aa  113  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00269432  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2181  50S ribosomal protein L27  67.05 
 
 
88 aa  113  6.9999999999999995e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.188028  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2636  50S ribosomal protein L27  71.6 
 
 
88 aa  113  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.288729  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3554  50S ribosomal protein L27  69.88 
 
 
88 aa  113  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3549  50S ribosomal protein L27  69.88 
 
 
88 aa  113  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3622  50S ribosomal protein L27  69.88 
 
 
88 aa  113  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2128  50S ribosomal protein L27  77.14 
 
 
88 aa  113  7.999999999999999e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.861173  normal  0.607727 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05970  LSU ribosomal protein L27P  70.24 
 
 
84 aa  113  7.999999999999999e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000567704  hitchhiker  0.000000000000675699 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0456  50S ribosomal protein L27  66.28 
 
 
96 aa  113  7.999999999999999e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.031206  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1341  50S ribosomal protein L27  71.08 
 
 
85 aa  113  8.999999999999998e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00883743  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2459  50S ribosomal protein L27  67.44 
 
 
85 aa  113  8.999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.177847 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1815  ribosomal protein L27  68.18 
 
 
102 aa  113  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11410  LSU ribosomal protein L27P  68.24 
 
 
85 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.624774  hitchhiker  0.0010423 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1368  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 
94 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000272527  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1051  50S ribosomal protein L27  64.77 
 
 
89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212456  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12468  50S ribosomal protein L27  71.6 
 
 
86 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.141175  normal  0.856367 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0503  ribosomal protein L27  69.05 
 
 
85 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0269  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 
85 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.876975  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11550  LSU ribosomal protein L27P  69.32 
 
 
88 aa  112  2.0000000000000002e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.66488  normal  0.230054 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0679  ribosomal protein L27  66.67 
 
 
84 aa  112  2.0000000000000002e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000246581  normal  0.202248 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1120  50S ribosomal protein L27  68.6 
 
 
99 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000194791  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1209  50S ribosomal protein L27  65.12 
 
 
94 aa  111  3e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000000066933  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3314  50S ribosomal protein L27  69.51 
 
 
88 aa  111  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000201837  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3480  50S ribosomal protein L27  69.88 
 
 
84 aa  111  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.219876  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15061  50S ribosomal protein L27  75.71 
 
 
86 aa  111  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.610968  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13010  LSU ribosomal protein L27P  78.26 
 
 
95 aa  111  4.0000000000000004e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000839598  normal  0.102019 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1702  50S ribosomal protein L27  65.12 
 
 
94 aa  111  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000326176  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2696  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 
85 aa  111  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000136289  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1735  50S ribosomal protein L27  65.12 
 
 
94 aa  111  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000015343  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>