More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2227 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2227  50S ribosomal protein L27  100 
 
 		 91 aa  177  2.9999999999999997e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00813215  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0750  ribosomal protein L27  82.14 
 
 		 90 aa  138  3e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000003902  hitchhiker  0.00471075 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2217  50S ribosomal protein L27  63.74 
 
 		 91 aa  116  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.856627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3242  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 		 95 aa  116  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3465  50S ribosomal protein L27  65.17 
 
 		 94 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.360708 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0269  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 		 85 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.876975  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0424  50S ribosomal protein L27  64.04 
 
 		 92 aa  112  3e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.85685  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1515  50S ribosomal protein L27  69.88 
 
 		 93 aa  110  7.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0090282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1611  50S ribosomal protein L27  67.06 
 
 		 97 aa  110  7.000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000833239  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3345  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 		 87 aa  110  9e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2772  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 		 87 aa  110  9e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.436114  normal  0.118024 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0238  ribosomal protein L27  60.67 
 
 		 87 aa  108  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0647  50S ribosomal protein L27  61.8 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.908873 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3235  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 		 85 aa  108  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000158281  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2247  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 		 85 aa  108  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000000479005  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2237  ribosomal protein L27  58.62 
 
 		 91 aa  108  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1220  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 		 88 aa  108  3e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60450  50S ribosomal protein L27  72.73 
 
 		 85 aa  108  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0112062 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5207  50S ribosomal protein L27  72.73 
 
 		 85 aa  108  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.121929  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0497  50S ribosomal protein L27  61.11 
 
 		 90 aa  108  3e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000367607  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1682  50S ribosomal protein L27  61.11 
 
 		 90 aa  107  5e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00000249957  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0475  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 		 85 aa  107  6e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0828621  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2703  50S ribosomal protein L27  58.89 
 
 		 92 aa  107  7.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2575  50S ribosomal protein L27  58.89 
 
 		 92 aa  107  7.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1583  50S ribosomal protein L27  66.23 
 
 		 85 aa  107  7.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1120  50S ribosomal protein L27  67.53 
 
 		 87 aa  107  7.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.645406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1526  50S ribosomal protein L27  66.23 
 
 		 85 aa  107  7.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4859  50S ribosomal protein L27  68.83 
 
 		 85 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3196  50S ribosomal protein L27  62.65 
 
 		 85 aa  106  9.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000840306  unclonable  7.875010000000001e-24 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05534  50S ribosomal protein L27  68.83 
 
 		 86 aa  106  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000340822  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2115  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 95 aa  105  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000381623  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1572  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 		 85 aa  105  3e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.355414  normal  0.759943 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1754  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 		 85 aa  105  3e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.163114  normal  0.0575884 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0764  50S ribosomal protein L27  65.52 
 
 		 85 aa  105  3e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000191049  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3073  50S ribosomal protein L27  59.52 
 
 		 91 aa  105  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000209952  unclonable  0.0000000174741 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4883  ribosomal protein L27  57.14 
 
 		 92 aa  104  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.113157  normal  0.111687 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0870  50S ribosomal protein L27  70.13 
 
 		 84 aa  104  4e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000545576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0892  50S ribosomal protein L27  70.13 
 
 		 85 aa  104  4e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0670599 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4511  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 		 85 aa  104  5e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0955  50S ribosomal protein L27  70.13 
 
 		 84 aa  104  5e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.455715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4496  50S ribosomal protein L27  66.23 
 
 		 85 aa  103  6e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.191975  normal  0.508112 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3681  50S ribosomal protein L27  67.53 
 
 		 85 aa  103  7e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0689  50S ribosomal protein L27  67.12 
 
 		 85 aa  103  8e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0721  50S ribosomal protein L27  67.12 
 
 		 85 aa  103  8e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.980566  normal  0.0233999 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2854  50S ribosomal protein L27  64.04 
 
 		 86 aa  103  8e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000234792  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2002  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 85 aa  103  8e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.245442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0721  50S ribosomal protein L27  67.12 
 
 		 85 aa  103  8e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.71975 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0794  50S ribosomal protein L27  68.83 
 
 		 85 aa  103  8e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000203934  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0559  50S ribosomal protein L27  68.83 
 
 		 85 aa  103  8e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00191418  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13010  LSU ribosomal protein L27P  56.99 
 
 		 95 aa  103  9e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000839598  normal  0.102019 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1005  50S ribosomal protein L27  68.83 
 
 		 84 aa  103  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000876711  decreased coverage  0.00000356458 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2549  50S ribosomal protein L27  62.35 
 
 		 95 aa  102  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000275731  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3651  50S ribosomal protein L27  68.83 
 
 		 84 aa  103  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0968  50S ribosomal protein L27  68.83 
 
 		 84 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000160226  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3471  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 87 aa  103  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00282639  normal  0.386116 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2046  ribosomal protein L27  62.64 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0305  50S ribosomal protein L27  62.65 
 
 		 85 aa  102  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000393871  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0853  50S ribosomal protein L27  68.83 
 
 		 84 aa  103  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152445  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0019  50S ribosomal protein L27  61.45 
 
 		 86 aa  102  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3460  50S ribosomal protein L27  58.43 
 
 		 89 aa  103  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159862  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3322  50S ribosomal protein L27  68.83 
 
 		 84 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000182867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0896  50S ribosomal protein L27  68.83 
 
 		 84 aa  103  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000837185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3124  50S ribosomal protein L27  68.83 
 
 		 84 aa  103  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000107863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3088  50S ribosomal protein L27  68.83 
 
 		 84 aa  102  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3218  50S ribosomal protein L27  68.83 
 
 		 84 aa  103  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1070  50S ribosomal protein L27  68.83 
 
 		 84 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000153229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0485  50S ribosomal protein L27  61.54 
 
 		 87 aa  103  1e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.229022  normal  0.0825407 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2828  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 		 84 aa  103  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000113295  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0980  50S ribosomal protein L27  68.83 
 
 		 84 aa  103  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000110997  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1037  50S ribosomal protein L27  68.83 
 
 		 84 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000911721  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03050  50S ribosomal protein L27  70.13 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00726587  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0522  ribosomal protein L27  70.13 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000023922  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0798  ribosomal protein L27  60.71 
 
 		 91 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0515  50S ribosomal protein L27  70.13 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000794781  normal  0.0169565 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0702  50S ribosomal protein L27  60.71 
 
 		 91 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.616074 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1466  50S ribosomal protein L27  60.47 
 
 		 86 aa  102  2e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.55318  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3670  50S ribosomal protein L27  70.13 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000967389  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4507  50S ribosomal protein L27  70.13 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000060246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0110  50S ribosomal protein L27  58.62 
 
 		 87 aa  102  2e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000081142  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2006  ribosomal protein L27  62.79 
 
 		 86 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.962508  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03001  hypothetical protein  70.13 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0066535  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3207  ribosomal protein L27  67.53 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2926  50S ribosomal protein L27  68.83 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000309766  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3378  50S ribosomal protein L27  70.13 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.4045e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3481  50S ribosomal protein L27  70.13 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000491459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3589  50S ribosomal protein L27  60.24 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000197888  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3585  50S ribosomal protein L27  70.13 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000250774  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3359  ribosomal protein L27  66.23 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000421163  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0162  50S ribosomal protein L27  62.65 
 
 		 92 aa  102  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000470304  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2582  50S ribosomal protein L27  65.43 
 
 		 84 aa  101  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.6027199999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2669  50S ribosomal protein L27  55.29 
 
 		 88 aa  101  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000924332  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00801  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 		 85 aa  101  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0512  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 		 85 aa  101  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0535164 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001672  LSU ribosomal protein L27p  65.85 
 
 		 85 aa  101  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000226464  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0454  50S ribosomal protein L27  61.11 
 
 		 89 aa  101  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0362  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 		 85 aa  101  3e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000249852  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0846  50S ribosomal protein L27  65.12 
 
 		 86 aa  101  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3975  50S ribosomal protein L27  67.53 
 
 		 85 aa  101  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000219143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0180  ribosomal protein L27  59.77 
 
 		 87 aa  101  4e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00344183  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3564  50S ribosomal protein L27  68.83 
 
 		 85 aa  101  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00211833  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>