More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0019 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0019  50S ribosomal protein L27  100 
 
 		 86 aa  169  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2665  ribosomal protein L27  75.58 
 
 		 90 aa  123  7e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.344366 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2218  50S ribosomal protein L27  71.76 
 
 		 85 aa  117  7e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000800329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1220  50S ribosomal protein L27  70.24 
 
 		 88 aa  115  1.9999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0679  ribosomal protein L27  67.44 
 
 		 84 aa  114  5e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000246581  normal  0.202248 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0750  ribosomal protein L27  63.86 
 
 		 90 aa  112  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000003902  hitchhiker  0.00471075 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2217  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 		 91 aa  112  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.856627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0856  50S ribosomal protein L27  67.06 
 
 		 86 aa  111  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.701213  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7271  50S ribosomal protein L27  70.59 
 
 		 85 aa  111  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.956462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0180  ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 87 aa  110  5e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00344183  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2128  50S ribosomal protein L27  74.29 
 
 		 88 aa  110  6e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.861173  normal  0.607727 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1816  50S ribosomal protein L27  68.24 
 
 		 85 aa  110  9e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05401  50S ribosomal protein L27  72.86 
 
 		 88 aa  109  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0152  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 		 90 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.670785  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0916  50S ribosomal protein L27  72.86 
 
 		 90 aa  109  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1112  ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 86 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.55245  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1009  50S ribosomal protein L27  68.24 
 
 		 85 aa  110  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000911893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17721  50S ribosomal protein L27  72.86 
 
 		 90 aa  109  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.106255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2012  ribosomal protein L27  76.81 
 
 		 83 aa  108  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000441981  unclonable  3.43128e-16 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0545  50S ribosomal protein L27  72.86 
 
 		 88 aa  108  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0588  50S ribosomal protein L27  63.95 
 
 		 90 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05970  LSU ribosomal protein L27P  66.28 
 
 		 84 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000567704  hitchhiker  0.000000000000675699 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0247  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0647  50S ribosomal protein L27  63.95 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.908873 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13010  LSU ribosomal protein L27P  78.26 
 
 		 95 aa  107  4.0000000000000004e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000839598  normal  0.102019 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0424  50S ribosomal protein L27  62.79 
 
 		 92 aa  107  5e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.85685  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2042  50S ribosomal protein L27  70.73 
 
 		 89 aa  107  6e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.20995 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13991  50S ribosomal protein L27  71.43 
 
 		 88 aa  107  6e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.228123 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0515  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 		 90 aa  106  9.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2247  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 		 85 aa  106  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000000479005  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1451  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 		 87 aa  106  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000000109711  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0310  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0154  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 		 90 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1524  50S ribosomal protein L27  75.36 
 
 		 86 aa  106  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.846788  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0417  50S ribosomal protein L27  62.79 
 
 		 91 aa  105  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.302693 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2669  50S ribosomal protein L27  58.14 
 
 		 88 aa  105  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000924332  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0162  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 92 aa  104  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000470304  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15061  50S ribosomal protein L27  72.46 
 
 		 86 aa  104  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.610968  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3345  50S ribosomal protein L27  61.63 
 
 		 87 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1443  50S ribosomal protein L27  69.01 
 
 		 86 aa  104  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0771  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 		 85 aa  105  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2772  50S ribosomal protein L27  61.63 
 
 		 87 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.436114  normal  0.118024 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15311  50S ribosomal protein L27  69.01 
 
 		 86 aa  104  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.854601  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0794  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 		 85 aa  104  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000203934  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0842  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 		 85 aa  105  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.987021  normal  0.6635 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40780  50S ribosomal protein L27  62.35 
 
 		 85 aa  104  4e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3235  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 85 aa  103  5e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000158281  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2636  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 		 88 aa  103  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.288729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5259  50S ribosomal protein L27  70.59 
 
 		 95 aa  104  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137345  normal  0.272276 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2181  50S ribosomal protein L27  70.59 
 
 		 88 aa  104  5e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.188028  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0342  50S ribosomal protein L27  68.29 
 
 		 85 aa  103  5e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  8.5444e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0559  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 		 85 aa  103  5e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00191418  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2060  ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 87 aa  103  5e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1188  50S ribosomal protein L27  64.37 
 
 		 87 aa  104  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3621  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 		 85 aa  103  6e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000351057  normal  0.260967 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0269  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 85 aa  103  6e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.876975  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3554  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 		 88 aa  103  6e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3549  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 		 88 aa  103  6e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3622  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 		 88 aa  103  6e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1515  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 93 aa  103  7e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0090282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7270  50S ribosomal protein L27  70.24 
 
 		 85 aa  103  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410235  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3493  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 85 aa  102  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000310399  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3379  ribosomal protein L27  64.37 
 
 		 86 aa  103  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4336  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 		 98 aa  102  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000256783  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0930  50S ribosomal protein L27  68.29 
 
 		 89 aa  103  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0213  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 86 aa  102  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.280528 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3207  ribosomal protein L27  63.53 
 
 		 85 aa  103  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1482  50S ribosomal protein L27  62.64 
 
 		 93 aa  102  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3564  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 85 aa  102  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00211833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3600  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 85 aa  102  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00592088  normal  0.834432 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3314  50S ribosomal protein L27  63.95 
 
 		 88 aa  102  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000201837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2227  50S ribosomal protein L27  61.45 
 
 		 91 aa  102  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00813215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3495  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 85 aa  102  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000222447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3662  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 85 aa  102  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.0000324123  normal  0.0701159 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03050  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00726587  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0522  ribosomal protein L27  65.85 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000023922  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3378  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.4045e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3481  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000491459  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4511  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11550  LSU ribosomal protein L27P  68.97 
 
 		 88 aa  102  2e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.66488  normal  0.230054 
 
 
-
 
NC_004310  BR1849  50S ribosomal protein L27  61.45 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1548  ribosomal protein L27  65.88 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104993  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0440  50S ribosomal protein L27  62.65 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.944777  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03001  hypothetical protein  65.85 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0066535  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3585  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000250774  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0195  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 86 aa  102  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000826463  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4507  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000060246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0515  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000794781  normal  0.0169565 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0508  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 87 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.868007  normal  0.531544 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2143  50S ribosomal protein L27  60.47 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.672881 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1051  50S ribosomal protein L27  61.45 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212456  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0426  50S ribosomal protein L27  63.95 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1781  50S ribosomal protein L27  61.45 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.810643  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2534  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00269432  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3670  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000967389  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3006  50S ribosomal protein L27  61.45 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.549132 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4724  50S ribosomal protein L27  63.22 
 
 		 88 aa  101  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0668122  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4287  50S ribosomal protein L27  60.47 
 
 		 90 aa  101  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.835773  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3892  50S ribosomal protein L27  68.29 
 
 		 89 aa  101  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.624543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60450  50S ribosomal protein L27  62.35 
 
 		 85 aa  101  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0112062 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>