More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1515 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_1515  50S ribosomal protein L27  100 
 
 		 93 aa  184  5e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0090282  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0424  50S ribosomal protein L27  90.22 
 
 		 92 aa  165  2e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.85685  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3242  50S ribosomal protein L27  86.36 
 
 		 95 aa  155  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0647  50S ribosomal protein L27  83.15 
 
 		 89 aa  152  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.908873 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1220  50S ribosomal protein L27  81.82 
 
 		 88 aa  143  6e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3345  50S ribosomal protein L27  81.4 
 
 		 87 aa  143  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2772  50S ribosomal protein L27  81.4 
 
 		 87 aa  143  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.436114  normal  0.118024 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3465  50S ribosomal protein L27  75.53 
 
 		 94 aa  142  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.360708 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4336  50S ribosomal protein L27  73.33 
 
 		 98 aa  137  6e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000256783  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0163  50S ribosomal protein L27  76.19 
 
 		 85 aa  134  6.0000000000000005e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000390958  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0146  50S ribosomal protein L27  75 
 
 		 85 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0530  50S ribosomal protein L27  73.03 
 
 		 98 aa  132  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163692  normal  0.125881 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2115  50S ribosomal protein L27  71.91 
 
 		 95 aa  131  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000381623  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0305  50S ribosomal protein L27  73.81 
 
 		 85 aa  130  5e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000393871  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3235  50S ribosomal protein L27  73.81 
 
 		 85 aa  130  6e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000158281  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2237  ribosomal protein L27  67.78 
 
 		 91 aa  130  7.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3589  50S ribosomal protein L27  72.62 
 
 		 84 aa  130  9e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000197888  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3196  50S ribosomal protein L27  71.76 
 
 		 85 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000840306  unclonable  7.875010000000001e-24 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0348  50S ribosomal protein L27  72.29 
 
 		 84 aa  128  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000453633  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0184  50S ribosomal protein L27  73.81 
 
 		 84 aa  126  8.000000000000001e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1725  50S ribosomal protein L27  72.94 
 
 		 85 aa  126  9.000000000000001e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1537  50S ribosomal protein L27  74.12 
 
 		 85 aa  126  9.000000000000001e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0090  50S ribosomal protein L27  73.81 
 
 		 84 aa  126  1.0000000000000001e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0327893  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0099  50S ribosomal protein L27  73.81 
 
 		 84 aa  126  1.0000000000000001e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0559  50S ribosomal protein L27  78.05 
 
 		 85 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00191418  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0996  50S ribosomal protein L27  74.12 
 
 		 85 aa  126  1.0000000000000001e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0130  50S ribosomal protein L27  73.81 
 
 		 84 aa  126  1.0000000000000001e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0794  50S ribosomal protein L27  78.05 
 
 		 85 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000203934  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2143  50S ribosomal protein L27  70.45 
 
 		 90 aa  125  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.672881 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2582  50S ribosomal protein L27  75.61 
 
 		 84 aa  125  3e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.6027199999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1611  50S ribosomal protein L27  67.05 
 
 		 97 aa  125  3e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000833239  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4511  50S ribosomal protein L27  76.83 
 
 		 85 aa  123  7e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00801  50S ribosomal protein L27  76.83 
 
 		 85 aa  123  8.000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001672  LSU ribosomal protein L27p  76.83 
 
 		 85 aa  123  8.000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000226464  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1341  50S ribosomal protein L27  70.59 
 
 		 85 aa  122  1e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00883743  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1451  50S ribosomal protein L27  72.09 
 
 		 87 aa  122  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000000109711  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1415  50S ribosomal protein L27  68.24 
 
 		 85 aa  122  1e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0454  50S ribosomal protein L27  70.11 
 
 		 89 aa  122  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3640  50S ribosomal protein L27  67.44 
 
 		 88 aa  122  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.320466  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3471  50S ribosomal protein L27  70.93 
 
 		 87 aa  122  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00282639  normal  0.386116 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0865  50S ribosomal protein L27  71.26 
 
 		 87 aa  122  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.437144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0559  50S ribosomal protein L27  71.95 
 
 		 90 aa  122  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2549  50S ribosomal protein L27  69.77 
 
 		 95 aa  121  3e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000275731  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0310  50S ribosomal protein L27  65.17 
 
 		 89 aa  121  3e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0162  50S ribosomal protein L27  75 
 
 		 92 aa  120  5e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000470304  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2854  50S ribosomal protein L27  74.12 
 
 		 86 aa  120  5e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000234792  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1781  50S ribosomal protein L27  66.29 
 
 		 89 aa  120  6e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.810643  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1849  50S ribosomal protein L27  66.29 
 
 		 89 aa  120  6e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1815  ribosomal protein L27  68.13 
 
 		 102 aa  120  7e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3359  ribosomal protein L27  74.39 
 
 		 85 aa  120  7e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000421163  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0362  50S ribosomal protein L27  75.61 
 
 		 85 aa  120  7e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000249852  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0846  50S ribosomal protein L27  75.61 
 
 		 86 aa  120  8e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0750  ribosomal protein L27  67.78 
 
 		 90 aa  120  9e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000003902  hitchhiker  0.00471075 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0474  50S ribosomal protein L27  75.61 
 
 		 85 aa  119  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000537628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0955  50S ribosomal protein L27  74.39 
 
 		 84 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.455715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0475  50S ribosomal protein L27  74.12 
 
 		 85 aa  119  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0828621  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3460  50S ribosomal protein L27  65.17 
 
 		 89 aa  119  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159862  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0870  50S ribosomal protein L27  74.39 
 
 		 84 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000545576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3207  ribosomal protein L27  74.12 
 
 		 85 aa  119  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0856  50S ribosomal protein L27  69.77 
 
 		 86 aa  119  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.701213  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0238  ribosomal protein L27  64.37 
 
 		 87 aa  119  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0417  50S ribosomal protein L27  65.56 
 
 		 91 aa  118  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.302693 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1051  50S ribosomal protein L27  65.17 
 
 		 89 aa  118  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212456  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3737  50S ribosomal protein L27  73.17 
 
 		 85 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000346028  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1632  50S ribosomal protein L27  67.82 
 
 		 87 aa  118  3e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.848306  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3611  50S ribosomal protein L27  74.39 
 
 		 85 aa  118  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000711047  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4194  50S ribosomal protein L27  65.17 
 
 		 89 aa  118  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3870  50S ribosomal protein L27  65.17 
 
 		 89 aa  118  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.403314  normal  0.0137956 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0246  50S ribosomal protein L27  75.61 
 
 		 85 aa  118  3e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000945082  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3975  50S ribosomal protein L27  74.39 
 
 		 85 aa  118  3e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000219143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0853  50S ribosomal protein L27  73.17 
 
 		 84 aa  118  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152445  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3756  50S ribosomal protein L27  74.39 
 
 		 85 aa  118  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000137777  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3006  50S ribosomal protein L27  66.29 
 
 		 89 aa  117  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.549132 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5207  50S ribosomal protein L27  75.29 
 
 		 85 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.121929  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1625  ribosomal protein L27  68.24 
 
 		 143 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.388698 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1070  50S ribosomal protein L27  73.17 
 
 		 84 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000153229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1548  ribosomal protein L27  74.12 
 
 		 85 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104993  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3322  50S ribosomal protein L27  73.17 
 
 		 84 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000182867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0968  50S ribosomal protein L27  73.17 
 
 		 84 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000160226  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60450  50S ribosomal protein L27  75.29 
 
 		 85 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0112062 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1037  50S ribosomal protein L27  73.17 
 
 		 84 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000911721  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3495  50S ribosomal protein L27  73.17 
 
 		 85 aa  117  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000222447  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3651  50S ribosomal protein L27  74.36 
 
 		 84 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3478  ribosomal protein L27  71.95 
 
 		 85 aa  117  4.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000653762  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3418  50S ribosomal protein L27  68.18 
 
 		 88 aa  117  4.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3600  50S ribosomal protein L27  73.17 
 
 		 85 aa  117  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00592088  normal  0.834432 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2691  50S ribosomal protein L27  68.97 
 
 		 89 aa  117  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0303281  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3662  50S ribosomal protein L27  73.17 
 
 		 85 aa  117  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.0000324123  normal  0.0701159 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3564  50S ribosomal protein L27  73.17 
 
 		 85 aa  117  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00211833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0503  ribosomal protein L27  67.86 
 
 		 85 aa  117  4.9999999999999996e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0980  50S ribosomal protein L27  74.36 
 
 		 84 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000110997  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3218  50S ribosomal protein L27  74.36 
 
 		 84 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15461  50S ribosomal protein L27  70.24 
 
 		 86 aa  117  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.120914  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3493  50S ribosomal protein L27  73.17 
 
 		 85 aa  117  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000310399  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2828  50S ribosomal protein L27  74.39 
 
 		 84 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000113295  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2383  50S ribosomal protein L27  69.88 
 
 		 100 aa  117  6e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000271812  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2095  50S ribosomal protein L27  69.88 
 
 		 100 aa  117  6e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000243754  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05970  LSU ribosomal protein L27P  68.6 
 
 		 84 aa  117  6e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000567704  hitchhiker  0.000000000000675699 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2926  50S ribosomal protein L27  74.36 
 
 		 84 aa  117  7e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000309766  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0896  50S ribosomal protein L27  73.08 
 
 		 84 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000837185  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>