More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0162 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0162  50S ribosomal protein L27  100 
 
 		 92 aa  181  4.0000000000000006e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000470304  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1322  50S ribosomal protein L27  82.61 
 
 		 93 aa  153  8e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202247  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2115  50S ribosomal protein L27  84.88 
 
 		 95 aa  149  8.999999999999999e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000381623  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2549  50S ribosomal protein L27  78.02 
 
 		 95 aa  147  4e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000275731  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2383  50S ribosomal protein L27  76.92 
 
 		 100 aa  145  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000271812  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2095  50S ribosomal protein L27  76.92 
 
 		 100 aa  145  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000243754  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4336  50S ribosomal protein L27  76.92 
 
 		 98 aa  144  4.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000256783  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1611  50S ribosomal protein L27  75.82 
 
 		 97 aa  140  6e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000833239  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0559  50S ribosomal protein L27  74.71 
 
 		 90 aa  136  8.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3157  50S ribosomal protein L27  70.33 
 
 		 96 aa  135  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00125079  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2540  50S ribosomal protein L27  70.33 
 
 		 96 aa  134  4e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000133026  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4534  50S ribosomal protein L27  70.33 
 
 		 96 aa  134  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000009897  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4340  50S ribosomal protein L27  70.33 
 
 		 96 aa  134  4e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000839795  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4176  50S ribosomal protein L27  70.33 
 
 		 96 aa  134  4e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000152453  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4187  50S ribosomal protein L27  70.33 
 
 		 96 aa  134  4e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0200239  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4560  50S ribosomal protein L27  70.33 
 
 		 96 aa  134  4e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4674  50S ribosomal protein L27  70.33 
 
 		 96 aa  134  4e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000903634  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4522  50S ribosomal protein L27  70.33 
 
 		 96 aa  134  4e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.230769 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4575  50S ribosomal protein L27  70.33 
 
 		 96 aa  134  4e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000185796  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4288  50S ribosomal protein L27  70.33 
 
 		 96 aa  134  4e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000779074  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0674  50S ribosomal protein L27  70.33 
 
 		 96 aa  134  4e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000611432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0910  50S ribosomal protein L27  69.23 
 
 		 96 aa  134  4e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1735  50S ribosomal protein L27  71.43 
 
 		 94 aa  132  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000015343  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1702  50S ribosomal protein L27  71.43 
 
 		 94 aa  132  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000326176  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1209  50S ribosomal protein L27  70.33 
 
 		 94 aa  132  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000000066933  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0414  50S ribosomal protein L27  72.09 
 
 		 93 aa  131  3.9999999999999996e-30  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0656018  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3196  50S ribosomal protein L27  76.19 
 
 		 85 aa  130  6.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000840306  unclonable  7.875010000000001e-24 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3235  50S ribosomal protein L27  76.19 
 
 		 85 aa  130  7.999999999999999e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000158281  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1120  50S ribosomal protein L27  77.27 
 
 		 99 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000194791  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2534  50S ribosomal protein L27  79.27 
 
 		 89 aa  128  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00269432  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1451  50S ribosomal protein L27  72.62 
 
 		 87 aa  126  9.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000000109711  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1815  ribosomal protein L27  69.23 
 
 		 102 aa  125  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0180  ribosomal protein L27  74.7 
 
 		 87 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00344183  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1368  50S ribosomal protein L27  68.13 
 
 		 94 aa  124  3e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000272527  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl439  50S ribosomal protein L27  69.66 
 
 		 95 aa  125  3e-28  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000583794  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0424  50S ribosomal protein L27  73.81 
 
 		 92 aa  124  4.0000000000000003e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.85685  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0647  50S ribosomal protein L27  71.08 
 
 		 89 aa  124  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.908873 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0456  50S ribosomal protein L27  68.97 
 
 		 96 aa  123  7e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.031206  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2651  ribosomal protein L27  65.93 
 
 		 95 aa  122  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000469897  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0530  50S ribosomal protein L27  68.89 
 
 		 98 aa  122  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163692  normal  0.125881 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14110  ribosomal protein L27  75.31 
 
 		 92 aa  121  4e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000254683  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3465  50S ribosomal protein L27  71.08 
 
 		 94 aa  121  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.360708 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0746  50S ribosomal protein L27  69.77 
 
 		 103 aa  120  5e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000122269  hitchhiker  0.000403944 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3589  50S ribosomal protein L27  69.05 
 
 		 84 aa  120  6e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000197888  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0163  50S ribosomal protein L27  70.24 
 
 		 85 aa  120  6e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000390958  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3314  50S ribosomal protein L27  74.39 
 
 		 88 aa  120  6e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000201837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2237  ribosomal protein L27  70.24 
 
 		 91 aa  119  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0305  50S ribosomal protein L27  69.05 
 
 		 85 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000393871  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0146  50S ribosomal protein L27  69.05 
 
 		 85 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3242  50S ribosomal protein L27  73.49 
 
 		 95 aa  119  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0499  ribosomal protein L27  68.13 
 
 		 93 aa  118  3e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1515  50S ribosomal protein L27  74.7 
 
 		 93 aa  117  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0090282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2772  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 		 87 aa  116  9e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.436114  normal  0.118024 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3345  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 		 87 aa  116  9e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1182  50S ribosomal protein L27  62.64 
 
 		 94 aa  116  9.999999999999999e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0143034  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1220  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 88 aa  115  3e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2181  50S ribosomal protein L27  71.08 
 
 		 88 aa  114  5e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.188028  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1325  50S ribosomal protein L27  60.44 
 
 		 105 aa  113  1.0000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00638387  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0896  ribosomal protein L27  64.77 
 
 		 92 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000144427  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0269  50S ribosomal protein L27  69.05 
 
 		 85 aa  111  3e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.876975  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1537  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 85 aa  111  3e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0348  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 84 aa  111  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000453633  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1548  ribosomal protein L27  69.05 
 
 		 85 aa  110  5e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104993  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1524  50S ribosomal protein L27  70.73 
 
 		 86 aa  110  5e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.846788  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0996  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 85 aa  110  5e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0489  ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 86 aa  110  5e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3207  ribosomal protein L27  71.76 
 
 		 85 aa  110  6e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3379  ribosomal protein L27  67.86 
 
 		 86 aa  110  7.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2459  50S ribosomal protein L27  72.29 
 
 		 85 aa  110  7.000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.177847 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1112  ribosomal protein L27  71.95 
 
 		 86 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.55245  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0700  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 		 83 aa  110  9e-24  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.987628  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0099  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 		 84 aa  109  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0764  50S ribosomal protein L27  71.08 
 
 		 85 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000191049  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2247  50S ribosomal protein L27  69.41 
 
 		 85 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000000479005  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0090  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 		 84 aa  109  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0327893  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0130  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 		 84 aa  109  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2582  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 		 84 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.6027199999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0203  50S ribosomal protein L27  60.23 
 
 		 100 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1816  50S ribosomal protein L27  67.06 
 
 		 85 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1725  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 85 aa  108  3e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0184  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 84 aa  107  4.0000000000000004e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3471  50S ribosomal protein L27  67.06 
 
 		 87 aa  107  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00282639  normal  0.386116 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3073  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 91 aa  107  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000209952  unclonable  0.0000000174741 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3066  50S ribosomal protein L27  67.06 
 
 		 86 aa  107  5e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1415  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 		 85 aa  107  5e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0856  50S ribosomal protein L27  67.06 
 
 		 86 aa  107  5e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.701213  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2656  50S ribosomal protein L27  67.06 
 
 		 86 aa  107  6e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0134308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0510  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 		 87 aa  107  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0309377  normal  0.755964 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3667  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 		 87 aa  107  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000345306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0100  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 		 87 aa  107  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00352754  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0552  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 		 87 aa  107  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000367957  normal  0.045539 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0485  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 		 87 aa  107  6e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0162621  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0582  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 		 87 aa  107  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00040366  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2801  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 		 87 aa  107  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000884705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0213  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 86 aa  106  8.000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.280528 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0508  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 		 87 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.868007  normal  0.531544 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2143  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 90 aa  107  8.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.672881 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2821  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 		 86 aa  106  9.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000571878  normal  0.308516 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1341  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 		 85 aa  106  9.000000000000001e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00883743  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4883  ribosomal protein L27  67.47 
 
 		 92 aa  106  9.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.113157  normal  0.111687 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>