More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3073 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_3073  50S ribosomal protein L27  100 
 
 
91 aa  186  7e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000209952  unclonable  0.0000000174741 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2669  50S ribosomal protein L27  74.71 
 
 
88 aa  145  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000924332  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2002  50S ribosomal protein L27  75.86 
 
 
85 aa  131  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.245442  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0489  ribosomal protein L27  70.59 
 
 
86 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2696  50S ribosomal protein L27  76.54 
 
 
85 aa  129  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000136289  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2237  ribosomal protein L27  63.74 
 
 
91 aa  128  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140821  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2772  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 
87 aa  120  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.436114  normal  0.118024 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3345  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 
87 aa  120  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3640  50S ribosomal protein L27  62.07 
 
 
88 aa  120  6e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.320466  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0424  50S ribosomal protein L27  65.22 
 
 
92 aa  119  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.85685  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0647  50S ribosomal protein L27  64.04 
 
 
89 aa  118  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.908873 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3465  50S ribosomal protein L27  63.33 
 
 
94 aa  117  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.360708 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3235  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 
85 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000158281  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0305  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 
85 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000393871  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3589  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 
84 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000197888  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2217  50S ribosomal protein L27  64.84 
 
 
91 aa  115  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.856627  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3242  50S ribosomal protein L27  62.07 
 
 
95 aa  115  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0146  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 
85 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0163  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 
85 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000390958  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3196  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 
85 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000840306  unclonable  7.875010000000001e-24 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1120  50S ribosomal protein L27  65.52 
 
 
87 aa  110  7.000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.645406  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1515  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 
93 aa  110  8.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0090282  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2057  50S ribosomal protein L27  59.3 
 
 
87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.976216  normal  0.840982 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0503  ribosomal protein L27  63.86 
 
 
85 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2703  50S ribosomal protein L27  59.78 
 
 
92 aa  108  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2575  50S ribosomal protein L27  59.78 
 
 
92 aa  108  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3418  50S ribosomal protein L27  61.63 
 
 
88 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1220  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 
88 aa  108  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1379  50S ribosomal protein L27  60.67 
 
 
89 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1326  50S ribosomal protein L27  62.2 
 
 
84 aa  108  3e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0019115  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05534  50S ribosomal protein L27  65.91 
 
 
86 aa  108  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000340822  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1108  ribosomal protein L27  62.2 
 
 
84 aa  108  3e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000226179  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0232  50S ribosomal protein L27  65.17 
 
 
89 aa  107  4.0000000000000004e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0162  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 
92 aa  107  4.0000000000000004e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000470304  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1537  50S ribosomal protein L27  62.35 
 
 
85 aa  107  5e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2651  ribosomal protein L27  60.47 
 
 
95 aa  107  5e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000469897  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4883  ribosomal protein L27  60 
 
 
92 aa  107  6e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.113157  normal  0.111687 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1137  50S ribosomal protein L27  62.2 
 
 
84 aa  107  6e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00024272  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2181  50S ribosomal protein L27  62.5 
 
 
88 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.128983  normal  0.935252 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1280  50S ribosomal protein L27  74.29 
 
 
84 aa  107  8.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00391085  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2582  50S ribosomal protein L27  67.9 
 
 
84 aa  106  8.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.6027199999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0559  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 
90 aa  107  8.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0497  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 
90 aa  106  9.000000000000001e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000367607  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0348  50S ribosomal protein L27  62.65 
 
 
84 aa  106  9.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000453633  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3379  ribosomal protein L27  63.22 
 
 
86 aa  106  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1548  ribosomal protein L27  67.06 
 
 
85 aa  106  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104993  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1341  50S ribosomal protein L27  58.82 
 
 
85 aa  105  1e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00883743  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2115  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 
95 aa  105  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000381623  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2691  50S ribosomal protein L27  59.3 
 
 
89 aa  105  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0303281  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1682  50S ribosomal protein L27  73.91 
 
 
90 aa  105  2e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00000249957  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1112  ribosomal protein L27  65.12 
 
 
86 aa  105  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.55245  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3674  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 
85 aa  105  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.99139  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0499  ribosomal protein L27  60.24 
 
 
93 aa  105  2e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1269  50S ribosomal protein L27  71.43 
 
 
85 aa  105  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000774064  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0838  50S ribosomal protein L27  71.43 
 
 
85 aa  105  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.34705  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2227  50S ribosomal protein L27  59.52 
 
 
91 aa  105  3e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00813215  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1188  50S ribosomal protein L27  60.47 
 
 
87 aa  104  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4336  50S ribosomal protein L27  61.45 
 
 
98 aa  104  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000256783  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3188  50S ribosomal protein L27  62.92 
 
 
89 aa  104  4e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.263255  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0454  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 
89 aa  104  4e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1611  50S ribosomal protein L27  59.09 
 
 
97 aa  104  4e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000833239  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5485  50S ribosomal protein L27  74.29 
 
 
85 aa  104  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.132015  normal  0.505389 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0771  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 
85 aa  103  6e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1725  50S ribosomal protein L27  58.82 
 
 
85 aa  103  6e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0750  ribosomal protein L27  57.78 
 
 
90 aa  103  6e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000003902  hitchhiker  0.00471075 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0842  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 
85 aa  103  6e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.987021  normal  0.6635 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1526  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 
85 aa  103  7e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1816  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 
85 aa  103  7e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1583  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 
85 aa  103  7e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0996  50S ribosomal protein L27  60 
 
 
85 aa  103  7e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3314  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 
88 aa  103  8e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000201837  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0269  50S ribosomal protein L27  58.82 
 
 
85 aa  103  8e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.876975  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0750  50S ribosomal protein L27  70 
 
 
85 aa  103  8e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00233026 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2249  50S ribosomal protein L27  57.3 
 
 
89 aa  103  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0281332  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0180  ribosomal protein L27  67.47 
 
 
87 aa  102  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00344183  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1899  50S ribosomal protein L27  61.45 
 
 
84 aa  102  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.617273  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4327  50S ribosomal protein L27  60 
 
 
85 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.520915 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2143  50S ribosomal protein L27  62.07 
 
 
90 aa  102  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.672881 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1030  50S ribosomal protein L27  60.24 
 
 
84 aa  102  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0011666  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1509  50S ribosomal protein L27  60.24 
 
 
84 aa  102  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00258122  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0863  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 
85 aa  102  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0966779  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1322  50S ribosomal protein L27  62.2 
 
 
93 aa  102  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202247  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1617  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 
82 aa  102  2e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000121175  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2383  50S ribosomal protein L27  62.07 
 
 
100 aa  102  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000271812  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2095  50S ribosomal protein L27  62.07 
 
 
100 aa  102  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000243754  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0087  50S ribosomal protein L27  65.43 
 
 
83 aa  102  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000279495  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2247  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 
85 aa  101  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000000479005  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4217  50S ribosomal protein L27  72.46 
 
 
85 aa  101  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3471  50S ribosomal protein L27  60.92 
 
 
87 aa  101  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00282639  normal  0.386116 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2549  50S ribosomal protein L27  59.77 
 
 
95 aa  101  3e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000275731  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0019  50S ribosomal protein L27  60.47 
 
 
86 aa  101  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0184  50S ribosomal protein L27  59.04 
 
 
84 aa  101  4e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0310  50S ribosomal protein L27  59.77 
 
 
89 aa  101  4e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0090  50S ribosomal protein L27  59.04 
 
 
84 aa  100  5e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0327893  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1712  50S ribosomal protein L27  59.04 
 
 
84 aa  100  5e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.592545  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0099  50S ribosomal protein L27  59.04 
 
 
84 aa  100  5e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0130  50S ribosomal protein L27  59.04 
 
 
84 aa  100  5e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2181  50S ribosomal protein L27  64.04 
 
 
88 aa  100  6e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.188028  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0892  50S ribosomal protein L27  71.43 
 
 
85 aa  100  6e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0670599 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4312  50S ribosomal protein L27  58.82 
 
 
85 aa  100  7e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>