More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2383 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2383  50S ribosomal protein L27  100 
 
 		 100 aa  201  2e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000271812  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2095  50S ribosomal protein L27  100 
 
 		 100 aa  201  2e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000243754  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2549  50S ribosomal protein L27  82.11 
 
 		 95 aa  163  9e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000275731  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2115  50S ribosomal protein L27  85.23 
 
 		 95 aa  152  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000381623  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0910  50S ribosomal protein L27  73.68 
 
 		 96 aa  152  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2540  50S ribosomal protein L27  74.74 
 
 		 96 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000133026  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1735  50S ribosomal protein L27  78.26 
 
 		 94 aa  148  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000015343  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1702  50S ribosomal protein L27  78.26 
 
 		 94 aa  148  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000326176  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3157  50S ribosomal protein L27  71.58 
 
 		 96 aa  147  5e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00125079  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4560  50S ribosomal protein L27  71.58 
 
 		 96 aa  146  8e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1209  50S ribosomal protein L27  77.17 
 
 		 94 aa  146  8e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000000066933  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4534  50S ribosomal protein L27  71.58 
 
 		 96 aa  146  8e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000009897  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4575  50S ribosomal protein L27  71.58 
 
 		 96 aa  146  8e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000185796  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4340  50S ribosomal protein L27  71.58 
 
 		 96 aa  145  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000839795  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4176  50S ribosomal protein L27  71.58 
 
 		 96 aa  145  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000152453  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4187  50S ribosomal protein L27  71.58 
 
 		 96 aa  145  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0200239  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4288  50S ribosomal protein L27  71.58 
 
 		 96 aa  145  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000779074  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4674  50S ribosomal protein L27  71.58 
 
 		 96 aa  145  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000903634  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4522  50S ribosomal protein L27  71.58 
 
 		 96 aa  145  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.230769 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0674  50S ribosomal protein L27  71.58 
 
 		 96 aa  145  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000611432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0162  50S ribosomal protein L27  76.92 
 
 		 92 aa  145  1.0000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000470304  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1611  50S ribosomal protein L27  76.6 
 
 		 97 aa  145  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000833239  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4336  50S ribosomal protein L27  75.82 
 
 		 98 aa  144  5e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000256783  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1322  50S ribosomal protein L27  80.9 
 
 		 93 aa  143  6e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202247  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1368  50S ribosomal protein L27  75 
 
 		 94 aa  140  7e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000272527  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0456  50S ribosomal protein L27  73.4 
 
 		 96 aa  139  9.999999999999999e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.031206  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0559  50S ribosomal protein L27  77.01 
 
 		 90 aa  134  3.0000000000000003e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1182  50S ribosomal protein L27  70.65 
 
 		 94 aa  134  4e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0143034  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2534  50S ribosomal protein L27  72.83 
 
 		 89 aa  134  6.0000000000000005e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00269432  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1815  ribosomal protein L27  65.35 
 
 		 102 aa  132  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0530  50S ribosomal protein L27  69.7 
 
 		 98 aa  130  6e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163692  normal  0.125881 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0414  50S ribosomal protein L27  68.18 
 
 		 93 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0656018  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1190  50S ribosomal protein L27  65.17 
 
 		 93 aa  127  5.0000000000000004e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000026143  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1120  50S ribosomal protein L27  67.35 
 
 		 99 aa  127  6e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000194791  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl439  50S ribosomal protein L27  68.6 
 
 		 95 aa  126  8.000000000000001e-29  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000583794  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0647  50S ribosomal protein L27  71.43 
 
 		 89 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.908873 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3314  50S ribosomal protein L27  74.07 
 
 		 88 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000201837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0746  50S ribosomal protein L27  70.11 
 
 		 103 aa  125  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000122269  hitchhiker  0.000403944 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3465  50S ribosomal protein L27  70.45 
 
 		 94 aa  124  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.360708 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0180  ribosomal protein L27  71.95 
 
 		 87 aa  124  3e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00344183  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14110  ribosomal protein L27  70 
 
 		 92 aa  124  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000254683  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3235  50S ribosomal protein L27  72.94 
 
 		 85 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000158281  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1451  50S ribosomal protein L27  69.88 
 
 		 87 aa  123  8.000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000000109711  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1325  50S ribosomal protein L27  62 
 
 		 105 aa  123  9e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00638387  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3196  50S ribosomal protein L27  71.76 
 
 		 85 aa  122  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000840306  unclonable  7.875010000000001e-24 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0424  50S ribosomal protein L27  64.13 
 
 		 92 aa  121  4e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.85685  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3345  50S ribosomal protein L27  67.82 
 
 		 87 aa  120  8e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2772  50S ribosomal protein L27  67.82 
 
 		 87 aa  120  8e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.436114  normal  0.118024 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2651  ribosomal protein L27  64.84 
 
 		 95 aa  119  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000469897  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3589  50S ribosomal protein L27  71.08 
 
 		 84 aa  118  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000197888  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0146  50S ribosomal protein L27  69.41 
 
 		 85 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0305  50S ribosomal protein L27  68.24 
 
 		 85 aa  117  6e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000393871  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1220  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 		 88 aa  117  6e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0163  50S ribosomal protein L27  68.24 
 
 		 85 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000390958  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1515  50S ribosomal protein L27  69.88 
 
 		 93 aa  116  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0090282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0499  ribosomal protein L27  64.84 
 
 		 93 aa  114  3.9999999999999997e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1112  ribosomal protein L27  67.47 
 
 		 86 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.55245  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0928  ribosomal protein L27  71.11 
 
 		 97 aa  113  7.999999999999999e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000470923  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0958  50S ribosomal protein L27  62.07 
 
 		 106 aa  111  3e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000205292  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2582  50S ribosomal protein L27  71.95 
 
 		 84 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.6027199999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3242  50S ribosomal protein L27  60.44 
 
 		 95 aa  110  9e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0348  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 84 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000453633  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2237  ribosomal protein L27  59.77 
 
 		 91 aa  108  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1524  50S ribosomal protein L27  73.24 
 
 		 86 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.846788  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0203  50S ribosomal protein L27  64.37 
 
 		 100 aa  107  6e-23  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1537  50S ribosomal protein L27  63.41 
 
 		 85 aa  106  1e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1341  50S ribosomal protein L27  60.71 
 
 		 85 aa  105  3e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00883743  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0090  50S ribosomal protein L27  63.41 
 
 		 84 aa  104  4e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0327893  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0130  50S ribosomal protein L27  63.41 
 
 		 84 aa  104  4e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0099  50S ribosomal protein L27  63.41 
 
 		 84 aa  104  4e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0996  50S ribosomal protein L27  62.2 
 
 		 85 aa  104  4e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2181  50S ribosomal protein L27  63.95 
 
 		 88 aa  103  6e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.188028  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3379  ribosomal protein L27  62.79 
 
 		 86 aa  103  6e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1725  50S ribosomal protein L27  62.2 
 
 		 85 aa  103  8e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1548  ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 85 aa  103  9e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104993  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0865  50S ribosomal protein L27  62.64 
 
 		 87 aa  103  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.437144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0454  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 89 aa  102  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0184  50S ribosomal protein L27  62.2 
 
 		 84 aa  102  1e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3640  50S ribosomal protein L27  59.77 
 
 		 88 aa  103  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.320466  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2128  50S ribosomal protein L27  66.22 
 
 		 88 aa  102  2e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.861173  normal  0.607727 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2057  50S ribosomal protein L27  64.94 
 
 		 87 aa  102  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.976216  normal  0.840982 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3073  50S ribosomal protein L27  62.07 
 
 		 91 aa  102  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000209952  unclonable  0.0000000174741 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0896  ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 92 aa  101  3e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000144427  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3418  50S ribosomal protein L27  68.83 
 
 		 88 aa  101  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2691  50S ribosomal protein L27  68.83 
 
 		 89 aa  100  5e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0303281  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05401  50S ribosomal protein L27  60.71 
 
 		 88 aa  100  6e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4883  ribosomal protein L27  59.77 
 
 		 92 aa  100  6e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.113157  normal  0.111687 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0764  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 85 aa  100  7e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000191049  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0284  50S ribosomal protein L27  67.12 
 
 		 86 aa  100  9e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.349085  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf327  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 90 aa  100  9e-21  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.871003  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0461  50S ribosomal protein L27  67.12 
 
 		 86 aa  100  9e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00297252 
 
 
-
 
NC_002620  TC0700  50S ribosomal protein L27  60.24 
 
 		 83 aa  99.4  1e-20  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.987628  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1849  50S ribosomal protein L27  59.52 
 
 		 89 aa  99.8  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2480  ribosomal protein L27  68.83 
 
 		 100 aa  99.4  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.782187  normal  0.22295 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02725  50S ribosomal protein L27  61.45 
 
 		 86 aa  99.8  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1781  50S ribosomal protein L27  59.52 
 
 		 89 aa  99.8  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.810643  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2227  50S ribosomal protein L27  60.92 
 
 		 91 aa  100  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00813215  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2459  50S ribosomal protein L27  62.65 
 
 		 85 aa  99.8  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.177847 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12468  50S ribosomal protein L27  64.2 
 
 		 86 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.141175  normal  0.856367 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13010  LSU ribosomal protein L27P  66.67 
 
 		 95 aa  99.8  1e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000839598  normal  0.102019 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>