More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1341 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1341  50S ribosomal protein L27  100 
 
 		 85 aa  172  1.9999999999999998e-42  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00883743  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0996  50S ribosomal protein L27  89.41 
 
 		 85 aa  157  4e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0184  50S ribosomal protein L27  92.77 
 
 		 84 aa  156  1e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0090  50S ribosomal protein L27  92.77 
 
 		 84 aa  155  1e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0327893  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0130  50S ribosomal protein L27  92.77 
 
 		 84 aa  155  1e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0099  50S ribosomal protein L27  92.77 
 
 		 84 aa  155  1e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1725  50S ribosomal protein L27  89.41 
 
 		 85 aa  154  3e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1537  50S ribosomal protein L27  89.41 
 
 		 85 aa  154  4e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0503  ribosomal protein L27  83.13 
 
 		 85 aa  140  5e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1415  50S ribosomal protein L27  74.12 
 
 		 85 aa  128  2.0000000000000002e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0424  50S ribosomal protein L27  74.7 
 
 		 92 aa  127  4.0000000000000003e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.85685  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3589  50S ribosomal protein L27  72.29 
 
 		 84 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000197888  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3196  50S ribosomal protein L27  70.59 
 
 		 85 aa  123  8.000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000840306  unclonable  7.875010000000001e-24 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3242  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 		 95 aa  123  9e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0163  50S ribosomal protein L27  72.29 
 
 		 85 aa  123  9e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000390958  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3235  50S ribosomal protein L27  72.29 
 
 		 85 aa  122  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000158281  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0305  50S ribosomal protein L27  72.29 
 
 		 85 aa  122  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000393871  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0146  50S ribosomal protein L27  71.08 
 
 		 85 aa  122  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0647  50S ribosomal protein L27  68.24 
 
 		 89 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.908873 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1515  50S ribosomal protein L27  72.29 
 
 		 93 aa  121  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0090282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3640  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 		 88 aa  120  7e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.320466  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3465  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 		 94 aa  119  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.360708 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0348  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 		 84 aa  119  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000453633  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2237  ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 91 aa  115  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3345  50S ribosomal protein L27  62.35 
 
 		 87 aa  115  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2772  50S ribosomal protein L27  62.35 
 
 		 87 aa  115  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.436114  normal  0.118024 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1220  50S ribosomal protein L27  71.08 
 
 		 88 aa  113  8.999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4336  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 98 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000256783  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3282  50S ribosomal protein L27  70.37 
 
 		 91 aa  110  6e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0455195 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2582  50S ribosomal protein L27  63.41 
 
 		 84 aa  110  6e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.6027199999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0232  50S ribosomal protein L27  68.24 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3188  50S ribosomal protein L27  68.24 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.263255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0489  ribosomal protein L27  60 
 
 		 86 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2651  ribosomal protein L27  64.63 
 
 		 95 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000469897  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1611  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 97 aa  108  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000833239  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0499  ribosomal protein L27  63.86 
 
 		 93 aa  108  3e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001672  LSU ribosomal protein L27p  69.51 
 
 		 85 aa  107  7.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000226464  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00801  50S ribosomal protein L27  69.51 
 
 		 85 aa  107  7.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0162  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 		 92 aa  106  9.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000470304  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2115  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 		 95 aa  106  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000381623  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3073  50S ribosomal protein L27  58.82 
 
 		 91 aa  105  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000209952  unclonable  0.0000000174741 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1815  ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 102 aa  105  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3418  50S ribosomal protein L27  60.47 
 
 		 88 aa  105  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0746  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000122269  hitchhiker  0.000403944 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3892  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.624543  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4511  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 		 85 aa  105  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2143  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 90 aa  105  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.672881 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2549  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 95 aa  105  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000275731  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0530  50S ribosomal protein L27  63.41 
 
 		 98 aa  105  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163692  normal  0.125881 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0559  50S ribosomal protein L27  65.43 
 
 		 90 aa  105  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0108  50S ribosomal protein L27  60.24 
 
 		 87 aa  104  3e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3359  ribosomal protein L27  68.29 
 
 		 85 aa  105  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000421163  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2383  50S ribosomal protein L27  60.71 
 
 		 100 aa  105  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000271812  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2095  50S ribosomal protein L27  60.71 
 
 		 100 aa  105  3e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000243754  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0238  ribosomal protein L27  60 
 
 		 87 aa  104  4e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0764  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 85 aa  104  4e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000191049  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0269  50S ribosomal protein L27  60 
 
 		 85 aa  104  4e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.876975  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0362  50S ribosomal protein L27  68.29 
 
 		 85 aa  104  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000249852  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2854  50S ribosomal protein L27  68.29 
 
 		 86 aa  103  6e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000234792  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0870  50S ribosomal protein L27  68.29 
 
 		 84 aa  103  6e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000545576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3737  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 		 85 aa  103  6e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000346028  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0955  50S ribosomal protein L27  68.29 
 
 		 84 aa  103  7e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.455715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0213  50S ribosomal protein L27  65.12 
 
 		 86 aa  103  8e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.280528 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0087  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 		 83 aa  103  8e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000279495  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4921  50S ribosomal protein L27  62.35 
 
 		 88 aa  103  8e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0271507  normal  0.71556 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0559  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 		 85 aa  103  9e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00191418  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3460  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 89 aa  103  9e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159862  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1849  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 89 aa  102  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0856  50S ribosomal protein L27  61.63 
 
 		 86 aa  103  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.701213  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4413  50S ribosomal protein L27  62.35 
 
 		 88 aa  102  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1781  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 89 aa  102  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.810643  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1461  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 89 aa  103  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0317862 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0310  50S ribosomal protein L27  62.35 
 
 		 89 aa  102  1e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0910  50S ribosomal protein L27  58.82 
 
 		 96 aa  102  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4876  50S ribosomal protein L27  62.35 
 
 		 88 aa  102  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.387156 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2696  50S ribosomal protein L27  60.98 
 
 		 85 aa  103  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000136289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0454  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 89 aa  102  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0750  ribosomal protein L27  59.52 
 
 		 90 aa  102  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000003902  hitchhiker  0.00471075 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0853  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152445  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3651  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0968  50S ribosomal protein L27  74.29 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000160226  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0980  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000110997  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1482  50S ribosomal protein L27  67.9 
 
 		 93 aa  102  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0417  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 		 91 aa  102  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.302693 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1070  50S ribosomal protein L27  74.29 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000153229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2828  50S ribosomal protein L27  68.29 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000113295  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0794  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000203934  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0246  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000945082  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3322  50S ribosomal protein L27  74.29 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000182867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1037  50S ribosomal protein L27  74.29 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000911721  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3218  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0110  50S ribosomal protein L27  62.35 
 
 		 87 aa  101  3e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000081142  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2540  50S ribosomal protein L27  58.82 
 
 		 96 aa  101  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000133026  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2181  50S ribosomal protein L27  59.09 
 
 		 88 aa  101  3e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.128983  normal  0.935252 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0865  50S ribosomal protein L27  60.47 
 
 		 87 aa  101  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.437144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0195  50S ribosomal protein L27  65.12 
 
 		 86 aa  101  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000826463  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03730  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 		 85 aa  101  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00000322672  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2926  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 		 84 aa  101  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000309766  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0896  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 		 84 aa  101  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000837185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3124  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 		 84 aa  101  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000107863  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>