More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1322 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1322  50S ribosomal protein L27  100 
 
 
93 aa  182  1.0000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202247  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0162  50S ribosomal protein L27  82.61 
 
 
92 aa  153  8e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000470304  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2115  50S ribosomal protein L27  86.05 
 
 
95 aa  146  9e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000381623  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2549  50S ribosomal protein L27  76.34 
 
 
95 aa  144  3e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000275731  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2383  50S ribosomal protein L27  80.9 
 
 
100 aa  143  7.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000271812  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2095  50S ribosomal protein L27  80.9 
 
 
100 aa  143  7.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000243754  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4336  50S ribosomal protein L27  76.67 
 
 
98 aa  140  8e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000256783  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1611  50S ribosomal protein L27  75.27 
 
 
97 aa  139  9.999999999999999e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000833239  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0559  50S ribosomal protein L27  77.27 
 
 
90 aa  137  4.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1702  50S ribosomal protein L27  71.11 
 
 
94 aa  128  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000326176  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1735  50S ribosomal protein L27  71.11 
 
 
94 aa  128  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000015343  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0910  50S ribosomal protein L27  68.54 
 
 
96 aa  128  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2540  50S ribosomal protein L27  69.66 
 
 
96 aa  128  3e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000133026  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1209  50S ribosomal protein L27  70 
 
 
94 aa  127  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000000066933  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3157  50S ribosomal protein L27  68.54 
 
 
96 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00125079  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4534  50S ribosomal protein L27  68.54 
 
 
96 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000009897  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4340  50S ribosomal protein L27  68.54 
 
 
96 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000839795  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4176  50S ribosomal protein L27  68.54 
 
 
96 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000152453  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4187  50S ribosomal protein L27  68.54 
 
 
96 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0200239  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4560  50S ribosomal protein L27  68.54 
 
 
96 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4288  50S ribosomal protein L27  68.54 
 
 
96 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000779074  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4674  50S ribosomal protein L27  68.54 
 
 
96 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000903634  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0674  50S ribosomal protein L27  68.54 
 
 
96 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000611432  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4575  50S ribosomal protein L27  68.54 
 
 
96 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000185796  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4522  50S ribosomal protein L27  68.54 
 
 
96 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.230769 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2534  50S ribosomal protein L27  76.47 
 
 
89 aa  123  7e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00269432  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0530  50S ribosomal protein L27  70.45 
 
 
98 aa  123  8.000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163692  normal  0.125881 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1451  50S ribosomal protein L27  72.62 
 
 
87 aa  123  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000000109711  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1815  ribosomal protein L27  67.42 
 
 
102 aa  122  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0746  50S ribosomal protein L27  69.32 
 
 
103 aa  122  2e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000122269  hitchhiker  0.000403944 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2651  ribosomal protein L27  62.64 
 
 
95 aa  121  3e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000469897  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1120  50S ribosomal protein L27  70 
 
 
99 aa  120  9e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000194791  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1325  50S ribosomal protein L27  65.59 
 
 
105 aa  119  9.999999999999999e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00638387  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3314  50S ribosomal protein L27  72.94 
 
 
88 aa  118  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000201837  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3196  50S ribosomal protein L27  68.24 
 
 
85 aa  118  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000840306  unclonable  7.875010000000001e-24 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0456  50S ribosomal protein L27  71.76 
 
 
96 aa  118  3e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.031206  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3235  50S ribosomal protein L27  69.05 
 
 
85 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000158281  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1368  50S ribosomal protein L27  69.77 
 
 
94 aa  116  9.999999999999999e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000272527  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1632  50S ribosomal protein L27  68.24 
 
 
87 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.848306  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0424  50S ribosomal protein L27  69.05 
 
 
92 aa  115  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.85685  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl439  50S ribosomal protein L27  64.37 
 
 
95 aa  115  3e-25  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000583794  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0180  ribosomal protein L27  71.08 
 
 
87 aa  114  3e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00344183  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14110  ribosomal protein L27  70.24 
 
 
92 aa  114  3.9999999999999997e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000254683  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0414  50S ribosomal protein L27  60.92 
 
 
93 aa  113  6.9999999999999995e-25  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0656018  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3589  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 
84 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000197888  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1515  50S ribosomal protein L27  71.6 
 
 
93 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0090282  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0146  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 
85 aa  111  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0499  ribosomal protein L27  62.37 
 
 
93 aa  111  4.0000000000000004e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1182  50S ribosomal protein L27  64.04 
 
 
94 aa  110  4.0000000000000004e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0143034  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0647  50S ribosomal protein L27  67.9 
 
 
89 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.908873 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3471  50S ribosomal protein L27  68.29 
 
 
87 aa  110  5e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00282639  normal  0.386116 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0163  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 
85 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000390958  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2582  50S ribosomal protein L27  70.37 
 
 
84 aa  110  7.000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.6027199999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0305  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 
85 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000393871  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0958  50S ribosomal protein L27  62.92 
 
 
106 aa  109  1.0000000000000001e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000205292  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2237  ribosomal protein L27  64.71 
 
 
91 aa  109  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140821  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2854  50S ribosomal protein L27  70.59 
 
 
86 aa  109  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000234792  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0896  ribosomal protein L27  65.17 
 
 
92 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000144427  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3465  50S ribosomal protein L27  67.9 
 
 
94 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.360708 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3418  50S ribosomal protein L27  68.97 
 
 
88 aa  108  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0474  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 
85 aa  107  4.0000000000000004e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000537628  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0968  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 
84 aa  107  6e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000160226  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3322  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 
84 aa  107  6e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000182867  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1070  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 
84 aa  107  6e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000153229  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2926  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 
84 aa  107  6e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000309766  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1037  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 
84 aa  107  6e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000911721  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3651  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 
84 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3218  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 
84 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270517  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0980  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 
84 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000110997  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2772  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 
87 aa  106  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.436114  normal  0.118024 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3345  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 
87 aa  106  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3088  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 
84 aa  106  8.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0870  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 
84 aa  106  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000545576  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3207  ribosomal protein L27  65.88 
 
 
85 aa  106  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0896  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 
84 aa  106  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000837185  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3124  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 
84 aa  106  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000107863  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0362  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 
85 aa  106  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000249852  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00801  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 
85 aa  105  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0865  50S ribosomal protein L27  70 
 
 
87 aa  105  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.437144  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3478  ribosomal protein L27  63.53 
 
 
85 aa  105  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000653762  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3242  50S ribosomal protein L27  65.43 
 
 
95 aa  105  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13010  LSU ribosomal protein L27P  72.46 
 
 
95 aa  105  2e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000839598  normal  0.102019 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2651  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 
86 aa  105  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0231869  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001672  LSU ribosomal protein L27p  65.48 
 
 
85 aa  105  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000226464  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3379  ribosomal protein L27  69.88 
 
 
86 aa  104  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1220  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 
88 aa  105  3e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0794  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 
85 aa  104  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000203934  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3975  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 
85 aa  105  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000219143  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0928  ribosomal protein L27  68.54 
 
 
97 aa  105  3e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000470923  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3611  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 
85 aa  105  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000711047  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3756  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 
85 aa  105  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000137777  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0461  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 
86 aa  105  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00297252 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0559  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 
85 aa  105  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00191418  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2828  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 
84 aa  105  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000113295  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0284  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 
86 aa  105  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.349085  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1005  50S ribosomal protein L27  65.43 
 
 
84 aa  104  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000876711  decreased coverage  0.00000356458 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0955  50S ribosomal protein L27  77.94 
 
 
84 aa  104  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.455715  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0510  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 
87 aa  104  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0309377  normal  0.755964 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0853  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 
84 aa  104  4e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152445  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0552  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 
87 aa  104  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000367957  normal  0.045539 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>