More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0746 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0746  50S ribosomal protein L27  100 
 
 		 103 aa  208  2e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000122269  hitchhiker  0.000403944 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1325  50S ribosomal protein L27  71.88 
 
 		 105 aa  142  1e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00638387  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0456  50S ribosomal protein L27  70.21 
 
 		 96 aa  138  1.9999999999999998e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.031206  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1190  50S ribosomal protein L27  73.03 
 
 		 93 aa  138  3e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000026143  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1368  50S ribosomal protein L27  68.82 
 
 		 94 aa  134  3.0000000000000003e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000272527  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2549  50S ribosomal protein L27  73.86 
 
 		 95 aa  134  6.0000000000000005e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000275731  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4340  50S ribosomal protein L27  70.79 
 
 		 96 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000839795  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4176  50S ribosomal protein L27  70.79 
 
 		 96 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000152453  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4187  50S ribosomal protein L27  70.79 
 
 		 96 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0200239  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4288  50S ribosomal protein L27  70.79 
 
 		 96 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000779074  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4674  50S ribosomal protein L27  70.79 
 
 		 96 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000903634  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0674  50S ribosomal protein L27  70.79 
 
 		 96 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000611432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4522  50S ribosomal protein L27  70.79 
 
 		 96 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.230769 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4534  50S ribosomal protein L27  70.79 
 
 		 96 aa  131  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000009897  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3157  50S ribosomal protein L27  70.79 
 
 		 96 aa  131  3e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00125079  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4575  50S ribosomal protein L27  70.79 
 
 		 96 aa  131  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000185796  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4560  50S ribosomal protein L27  70.79 
 
 		 96 aa  131  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0958  50S ribosomal protein L27  64.58 
 
 		 106 aa  130  5e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000205292  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0910  50S ribosomal protein L27  68.54 
 
 		 96 aa  129  9e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1611  50S ribosomal protein L27  70.45 
 
 		 97 aa  130  9e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000833239  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2540  50S ribosomal protein L27  69.66 
 
 		 96 aa  128  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000133026  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1209  50S ribosomal protein L27  69.66 
 
 		 94 aa  127  7.000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000000066933  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1702  50S ribosomal protein L27  69.66 
 
 		 94 aa  125  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000326176  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1735  50S ribosomal protein L27  69.66 
 
 		 94 aa  125  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000015343  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2383  50S ribosomal protein L27  70.11 
 
 		 100 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000271812  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2095  50S ribosomal protein L27  70.11 
 
 		 100 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000243754  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2115  50S ribosomal protein L27  70.93 
 
 		 95 aa  123  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000381623  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1322  50S ribosomal protein L27  69.32 
 
 		 93 aa  122  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202247  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0414  50S ribosomal protein L27  67.42 
 
 		 93 aa  122  2e-27  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0656018  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4336  50S ribosomal protein L27  65.56 
 
 		 98 aa  121  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000256783  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0162  50S ribosomal protein L27  69.77 
 
 		 92 aa  120  5e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000470304  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl439  50S ribosomal protein L27  68.54 
 
 		 95 aa  120  8e-27  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000583794  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1182  50S ribosomal protein L27  67.82 
 
 		 94 aa  119  1.9999999999999998e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0143034  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3196  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 		 85 aa  118  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000840306  unclonable  7.875010000000001e-24 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0559  50S ribosomal protein L27  67.06 
 
 		 90 aa  118  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3235  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 		 85 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000158281  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1120  50S ribosomal protein L27  67.42 
 
 		 99 aa  117  7e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000194791  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1815  ribosomal protein L27  63.22 
 
 		 102 aa  117  7.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3589  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 		 84 aa  116  9e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000197888  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0305  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 		 85 aa  116  9e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000393871  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0530  50S ribosomal protein L27  63.95 
 
 		 98 aa  116  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163692  normal  0.125881 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0146  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 		 85 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0348  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 84 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000453633  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0424  50S ribosomal protein L27  64.77 
 
 		 92 aa  115  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.85685  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0163  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 		 85 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000390958  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1451  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 		 87 aa  114  5e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000000109711  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0647  50S ribosomal protein L27  63.22 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.908873 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2582  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 		 84 aa  111  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.6027199999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf327  50S ribosomal protein L27  68.18 
 
 		 90 aa  111  3e-24  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.871003  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3465  50S ribosomal protein L27  62.79 
 
 		 94 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.360708 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2534  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00269432  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3314  50S ribosomal protein L27  64.37 
 
 		 88 aa  108  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000201837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1515  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 		 93 aa  107  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0090282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1220  50S ribosomal protein L27  64.37 
 
 		 88 aa  107  5e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0928  ribosomal protein L27  63.04 
 
 		 97 aa  107  8.000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000470923  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2651  ribosomal protein L27  60.47 
 
 		 95 aa  106  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000469897  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3345  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 87 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1341  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00883743  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1537  50S ribosomal protein L27  64.63 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2772  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 87 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.436114  normal  0.118024 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3242  50S ribosomal protein L27  59.3 
 
 		 95 aa  104  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1415  50S ribosomal protein L27  61.45 
 
 		 85 aa  103  8e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0499  ribosomal protein L27  59.3 
 
 		 93 aa  102  1e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0180  ribosomal protein L27  63.41 
 
 		 87 aa  102  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00344183  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0996  50S ribosomal protein L27  62.2 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0099  50S ribosomal protein L27  62.2 
 
 		 84 aa  101  4e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0130  50S ribosomal protein L27  62.2 
 
 		 84 aa  101  4e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0090  50S ribosomal protein L27  62.2 
 
 		 84 aa  101  4e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0327893  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0764  50S ribosomal protein L27  62.35 
 
 		 85 aa  101  4e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000191049  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1108  ribosomal protein L27  60.49 
 
 		 84 aa  100  6e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000226179  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14110  ribosomal protein L27  60 
 
 		 92 aa  100  6e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000254683  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1548  ribosomal protein L27  60.47 
 
 		 85 aa  100  7e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104993  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3640  50S ribosomal protein L27  57.83 
 
 		 88 aa  100  8e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.320466  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1725  50S ribosomal protein L27  60.98 
 
 		 85 aa  99.4  1e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2237  ribosomal protein L27  55.17 
 
 		 91 aa  99.8  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1137  50S ribosomal protein L27  60.49 
 
 		 84 aa  99.4  1e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00024272  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0184  50S ribosomal protein L27  60.98 
 
 		 84 aa  99  2e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0203  50S ribosomal protein L27  55.32 
 
 		 100 aa  99.4  2e-20  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1326  50S ribosomal protein L27  59.26 
 
 		 84 aa  98.6  3e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0019115  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0269  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 85 aa  98.2  3e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.876975  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0454  50S ribosomal protein L27  61.36 
 
 		 89 aa  97.4  5e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2143  50S ribosomal protein L27  59.52 
 
 		 90 aa  97.4  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.672881 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2459  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 85 aa  96.7  9e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.177847 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0896  ribosomal protein L27  60.71 
 
 		 92 aa  96.3  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000144427  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7270  50S ribosomal protein L27  60.47 
 
 		 85 aa  96.7  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410235  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0110  50S ribosomal protein L27  58.14 
 
 		 87 aa  95.5  2e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000081142  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0193  50S ribosomal protein L27  57.95 
 
 		 90 aa  95.1  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.451706 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0503  ribosomal protein L27  57.83 
 
 		 85 aa  95.1  3e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3418  50S ribosomal protein L27  56.98 
 
 		 88 aa  94.7  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3379  ribosomal protein L27  59.04 
 
 		 86 aa  94.4  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3460  50S ribosomal protein L27  55.17 
 
 		 89 aa  94.7  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159862  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2181  50S ribosomal protein L27  58.62 
 
 		 88 aa  94.4  5e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.188028  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3892  50S ribosomal protein L27  58.62 
 
 		 89 aa  94  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.624543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1009  50S ribosomal protein L27  59.76 
 
 		 85 aa  94  6e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000911893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2785  50S ribosomal protein L27  56.32 
 
 		 89 aa  94  6e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0242571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2181  50S ribosomal protein L27  56.32 
 
 		 88 aa  94  6e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.128983  normal  0.935252 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3282  50S ribosomal protein L27  60.49 
 
 		 91 aa  94  6e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0455195 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0417  50S ribosomal protein L27  55.68 
 
 		 91 aa  94  7e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.302693 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1112  ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 86 aa  93.6  9e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.55245  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3006  50S ribosomal protein L27  55.17 
 
 		 89 aa  92.8  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.549132 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>