More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2534 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2534  50S ribosomal protein L27  100 
 
 		 89 aa  173  7e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00269432  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3314  50S ribosomal protein L27  81.18 
 
 		 88 aa  140  5e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000201837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1735  50S ribosomal protein L27  80.25 
 
 		 94 aa  135  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000015343  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1702  50S ribosomal protein L27  80.25 
 
 		 94 aa  135  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000326176  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1209  50S ribosomal protein L27  80.25 
 
 		 94 aa  134  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000000066933  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2115  50S ribosomal protein L27  77.53 
 
 		 95 aa  134  4e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000381623  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2383  50S ribosomal protein L27  72.83 
 
 		 100 aa  134  6.0000000000000005e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000271812  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2095  50S ribosomal protein L27  72.83 
 
 		 100 aa  134  6.0000000000000005e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000243754  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2549  50S ribosomal protein L27  75.58 
 
 		 95 aa  131  3e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000275731  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14110  ribosomal protein L27  77.65 
 
 		 92 aa  130  6.999999999999999e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000254683  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0162  50S ribosomal protein L27  79.27 
 
 		 92 aa  128  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000470304  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1451  50S ribosomal protein L27  74.39 
 
 		 87 aa  128  3e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000000109711  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1611  50S ribosomal protein L27  73.86 
 
 		 97 aa  127  4.0000000000000003e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000833239  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0180  ribosomal protein L27  72.73 
 
 		 87 aa  127  4.0000000000000003e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00344183  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1368  50S ribosomal protein L27  76.54 
 
 		 94 aa  127  7.000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000272527  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3157  50S ribosomal protein L27  75.31 
 
 		 96 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00125079  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4522  50S ribosomal protein L27  76.54 
 
 		 96 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.230769 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4288  50S ribosomal protein L27  76.54 
 
 		 96 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000779074  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4340  50S ribosomal protein L27  76.54 
 
 		 96 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000839795  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4176  50S ribosomal protein L27  76.54 
 
 		 96 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000152453  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4187  50S ribosomal protein L27  76.54 
 
 		 96 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0200239  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0674  50S ribosomal protein L27  76.54 
 
 		 96 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000611432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4674  50S ribosomal protein L27  76.54 
 
 		 96 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000903634  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0456  50S ribosomal protein L27  76.54 
 
 		 96 aa  126  1.0000000000000001e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.031206  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4336  50S ribosomal protein L27  69.66 
 
 		 98 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000256783  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4575  50S ribosomal protein L27  75.31 
 
 		 96 aa  125  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000185796  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4534  50S ribosomal protein L27  75.31 
 
 		 96 aa  125  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000009897  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4560  50S ribosomal protein L27  75.31 
 
 		 96 aa  125  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1322  50S ribosomal protein L27  76.47 
 
 		 93 aa  123  7e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202247  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0910  50S ribosomal protein L27  71.6 
 
 		 96 aa  121  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2540  50S ribosomal protein L27  72.84 
 
 		 96 aa  121  4e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000133026  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0559  50S ribosomal protein L27  74.07 
 
 		 90 aa  120  5e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl439  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 		 95 aa  118  1.9999999999999998e-26  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000583794  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0424  50S ribosomal protein L27  66.29 
 
 		 92 aa  118  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.85685  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2772  50S ribosomal protein L27  70.37 
 
 		 87 aa  118  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.436114  normal  0.118024 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0647  50S ribosomal protein L27  67.9 
 
 		 89 aa  118  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.908873 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3465  50S ribosomal protein L27  67.44 
 
 		 94 aa  118  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.360708 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3345  50S ribosomal protein L27  70.37 
 
 		 87 aa  118  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0414  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 		 93 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0656018  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1120  50S ribosomal protein L27  71.76 
 
 		 99 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000194791  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3235  50S ribosomal protein L27  70.37 
 
 		 85 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000158281  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3196  50S ribosomal protein L27  70.37 
 
 		 85 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000840306  unclonable  7.875010000000001e-24 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1815  ribosomal protein L27  74.07 
 
 		 102 aa  114  3.9999999999999997e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1220  50S ribosomal protein L27  69.14 
 
 		 88 aa  113  6.9999999999999995e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1325  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 		 105 aa  113  6.9999999999999995e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00638387  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1524  50S ribosomal protein L27  75.61 
 
 		 86 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.846788  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1112  ribosomal protein L27  70.37 
 
 		 86 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.55245  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1182  50S ribosomal protein L27  70.37 
 
 		 94 aa  112  2.0000000000000002e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0143034  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0958  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 		 106 aa  111  3e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000205292  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0928  ribosomal protein L27  67.53 
 
 		 97 aa  111  3e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000470923  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3589  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 84 aa  110  5e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000197888  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0552  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 		 87 aa  110  9e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000367957  normal  0.045539 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3667  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 		 87 aa  110  9e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000345306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0510  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 		 87 aa  110  9e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0309377  normal  0.755964 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0100  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 		 87 aa  110  9e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00352754  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0485  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 		 87 aa  110  9e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0162621  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0582  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 		 87 aa  110  9e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00040366  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1515  50S ribosomal protein L27  67.9 
 
 		 93 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0090282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2582  50S ribosomal protein L27  70.37 
 
 		 84 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.6027199999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0146  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 85 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2801  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 		 87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000884705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1632  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 		 87 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.848306  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1009  50S ribosomal protein L27  69.88 
 
 		 85 aa  108  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000911893  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2459  50S ribosomal protein L27  70.73 
 
 		 85 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.177847 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2237  ribosomal protein L27  65.12 
 
 		 91 aa  109  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0746  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 		 103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000122269  hitchhiker  0.000403944 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0305  50S ribosomal protein L27  65.43 
 
 		 85 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000393871  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05401  50S ribosomal protein L27  62.5 
 
 		 88 aa  108  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1190  50S ribosomal protein L27  64.2 
 
 		 93 aa  108  3e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000026143  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0163  50S ribosomal protein L27  65.43 
 
 		 85 aa  108  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000390958  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0865  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 		 87 aa  107  5e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.437144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2128  50S ribosomal protein L27  64.37 
 
 		 88 aa  107  6e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.861173  normal  0.607727 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3489  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 		 87 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.562103  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1304  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 		 87 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2522  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 		 87 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.587643  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3523  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 		 87 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.122565  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1141  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 		 87 aa  106  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0508  50S ribosomal protein L27  63.22 
 
 		 87 aa  106  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.868007  normal  0.531544 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0445  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 		 87 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3242  50S ribosomal protein L27  65.43 
 
 		 95 aa  106  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3259  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 		 87 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3525  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 		 87 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.986116  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3448  50S ribosomal protein L27  63.22 
 
 		 87 aa  105  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0232252  hitchhiker  0.00744788 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3471  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 87 aa  105  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00282639  normal  0.386116 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2181  50S ribosomal protein L27  62.92 
 
 		 88 aa  105  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.188028  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0916  50S ribosomal protein L27  63.33 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0530  50S ribosomal protein L27  60.67 
 
 		 98 aa  105  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163692  normal  0.125881 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0545  50S ribosomal protein L27  63.22 
 
 		 88 aa  105  2e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17721  50S ribosomal protein L27  63.33 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.106255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13991  50S ribosomal protein L27  63.95 
 
 		 88 aa  105  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.228123 
 
 
-
 
NC_002620  TC0700  50S ribosomal protein L27  68.24 
 
 		 83 aa  105  3e-22  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.987628  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2651  50S ribosomal protein L27  65.12 
 
 		 86 aa  105  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0231869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0269  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 85 aa  104  3e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.876975  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0284  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 		 86 aa  104  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.349085  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0461  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 		 86 aa  104  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00297252 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1548  ribosomal protein L27  67.07 
 
 		 85 aa  104  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104993  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0489  ribosomal protein L27  64.63 
 
 		 86 aa  104  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0348  50S ribosomal protein L27  64.2 
 
 		 84 aa  104  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000453633  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0856  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 86 aa  104  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.701213  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1816  50S ribosomal protein L27  60.71 
 
 		 85 aa  103  6e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>