More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_1735 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_1735  50S ribosomal protein L27  100 
 
 
94 aa  186  7e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000015343  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1702  50S ribosomal protein L27  100 
 
 
94 aa  186  7e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000326176  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1209  50S ribosomal protein L27  97.87 
 
 
94 aa  184  4e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000000066933  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3157  50S ribosomal protein L27  86.17 
 
 
96 aa  166  9e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00125079  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4575  50S ribosomal protein L27  86.17 
 
 
96 aa  165  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000185796  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4534  50S ribosomal protein L27  86.17 
 
 
96 aa  165  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000009897  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4560  50S ribosomal protein L27  86.17 
 
 
96 aa  165  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4340  50S ribosomal protein L27  85.11 
 
 
96 aa  164  5e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000839795  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4176  50S ribosomal protein L27  85.11 
 
 
96 aa  164  5e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000152453  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4187  50S ribosomal protein L27  85.11 
 
 
96 aa  164  5e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0200239  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4522  50S ribosomal protein L27  85.11 
 
 
96 aa  164  5e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.230769 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4674  50S ribosomal protein L27  85.11 
 
 
96 aa  164  5e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000903634  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0674  50S ribosomal protein L27  85.11 
 
 
96 aa  164  5e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000611432  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4288  50S ribosomal protein L27  85.11 
 
 
96 aa  164  5e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000779074  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2549  50S ribosomal protein L27  85.87 
 
 
95 aa  161  3e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000275731  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2540  50S ribosomal protein L27  82.98 
 
 
96 aa  160  8.000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000133026  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0910  50S ribosomal protein L27  80.85 
 
 
96 aa  158  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1368  50S ribosomal protein L27  80 
 
 
94 aa  148  2e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000272527  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2383  50S ribosomal protein L27  78.26 
 
 
100 aa  148  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000271812  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2095  50S ribosomal protein L27  78.26 
 
 
100 aa  148  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000243754  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0456  50S ribosomal protein L27  79.17 
 
 
96 aa  149  2e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.031206  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl439  50S ribosomal protein L27  73.63 
 
 
95 aa  138  1.9999999999999998e-32  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000583794  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1611  50S ribosomal protein L27  75 
 
 
97 aa  138  3e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000833239  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2115  50S ribosomal protein L27  77.27 
 
 
95 aa  137  4.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000381623  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1182  50S ribosomal protein L27  73.91 
 
 
94 aa  136  8.999999999999999e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0143034  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2534  50S ribosomal protein L27  80.25 
 
 
89 aa  135  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00269432  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4336  50S ribosomal protein L27  69.23 
 
 
98 aa  133  8e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000256783  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0162  50S ribosomal protein L27  71.43 
 
 
92 aa  132  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000470304  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0414  50S ribosomal protein L27  74.42 
 
 
93 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0656018  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1190  50S ribosomal protein L27  67.74 
 
 
93 aa  131  3.9999999999999996e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000026143  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1322  50S ribosomal protein L27  71.11 
 
 
93 aa  128  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202247  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1815  ribosomal protein L27  69.89 
 
 
102 aa  127  6e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0559  50S ribosomal protein L27  69.32 
 
 
90 aa  127  6e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0746  50S ribosomal protein L27  69.66 
 
 
103 aa  125  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000122269  hitchhiker  0.000403944 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1325  50S ribosomal protein L27  70 
 
 
105 aa  126  1.0000000000000001e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00638387  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14110  ribosomal protein L27  75.9 
 
 
92 aa  124  4.0000000000000003e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000254683  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0530  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 
98 aa  121  3e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163692  normal  0.125881 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0928  ribosomal protein L27  70.21 
 
 
97 aa  121  3e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000470923  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3314  50S ribosomal protein L27  71.95 
 
 
88 aa  120  8e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000201837  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1451  50S ribosomal protein L27  67.06 
 
 
87 aa  118  1.9999999999999998e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000000109711  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0958  50S ribosomal protein L27  63.33 
 
 
106 aa  118  1.9999999999999998e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000205292  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1120  50S ribosomal protein L27  65.59 
 
 
99 aa  117  7.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000194791  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3196  50S ribosomal protein L27  68.24 
 
 
85 aa  115  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000840306  unclonable  7.875010000000001e-24 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3465  50S ribosomal protein L27  66.28 
 
 
94 aa  115  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.360708 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0647  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 
89 aa  115  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.908873 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3235  50S ribosomal protein L27  69.88 
 
 
85 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000158281  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2772  50S ribosomal protein L27  67.06 
 
 
87 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.436114  normal  0.118024 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3345  50S ribosomal protein L27  67.06 
 
 
87 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2651  ribosomal protein L27  63.74 
 
 
95 aa  113  8.999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000469897  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0180  ribosomal protein L27  66.67 
 
 
87 aa  111  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00344183  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1220  50S ribosomal protein L27  65.12 
 
 
88 aa  111  4.0000000000000004e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0424  50S ribosomal protein L27  66.28 
 
 
92 aa  110  6e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.85685  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0305  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 
85 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000393871  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3589  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 
84 aa  108  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000197888  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2582  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 
84 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.6027199999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0146  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 
85 aa  107  6e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2459  50S ribosomal protein L27  65.12 
 
 
85 aa  106  8.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.177847 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0499  ribosomal protein L27  62.64 
 
 
93 aa  105  1e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0163  50S ribosomal protein L27  62.65 
 
 
85 aa  105  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000390958  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0203  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 
100 aa  105  2e-22  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1112  ribosomal protein L27  65.48 
 
 
86 aa  105  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.55245  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1515  50S ribosomal protein L27  64.63 
 
 
93 aa  104  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0090282  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1009  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 
85 aa  101  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000911893  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3242  50S ribosomal protein L27  59.3 
 
 
95 aa  102  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf327  50S ribosomal protein L27  60.47 
 
 
90 aa  100  5e-21  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.871003  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0896  ribosomal protein L27  62.79 
 
 
92 aa  100  6e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000144427  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1548  ribosomal protein L27  61.63 
 
 
85 aa  100  6e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104993  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18260  LSU ribosomal protein L27P  65.85 
 
 
84 aa  99.4  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0740446  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1524  50S ribosomal protein L27  65.43 
 
 
86 aa  99.4  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.846788  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0348  50S ribosomal protein L27  59.04 
 
 
84 aa  100  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000453633  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0764  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 
85 aa  99.4  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000191049  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2128  50S ribosomal protein L27  59.09 
 
 
88 aa  99  2e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.861173  normal  0.607727 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05401  50S ribosomal protein L27  61.63 
 
 
88 aa  98.6  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7270  50S ribosomal protein L27  59.3 
 
 
85 aa  98.2  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410235  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1537  50S ribosomal protein L27  57.65 
 
 
85 aa  97.4  6e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0284  50S ribosomal protein L27  61.63 
 
 
86 aa  96.7  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.349085  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0461  50S ribosomal protein L27  61.63 
 
 
86 aa  96.7  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00297252 
 
 
-
 
NC_002936  DET1326  50S ribosomal protein L27  59.04 
 
 
84 aa  95.5  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0019115  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1137  50S ribosomal protein L27  59.04 
 
 
84 aa  95.5  2e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00024272  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1108  ribosomal protein L27  59.04 
 
 
84 aa  95.9  2e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000226179  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12468  50S ribosomal protein L27  62.96 
 
 
86 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.141175  normal  0.856367 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3379  ribosomal protein L27  60 
 
 
86 aa  95.1  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0846  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 
86 aa  95.1  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2237  ribosomal protein L27  59.26 
 
 
91 aa  94.7  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140821  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13991  50S ribosomal protein L27  60.71 
 
 
88 aa  94.7  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.228123 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2181  50S ribosomal protein L27  61.73 
 
 
88 aa  94.7  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.188028  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0865  50S ribosomal protein L27  62.03 
 
 
87 aa  94.7  4e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.437144  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0545  50S ribosomal protein L27  59.3 
 
 
88 aa  94.7  4e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0757  50S ribosomal protein L27  61.73 
 
 
97 aa  94.7  4e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.819574  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2696  50S ribosomal protein L27  57.83 
 
 
85 aa  94  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000136289  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0090  50S ribosomal protein L27  58.54 
 
 
84 aa  94  7e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0327893  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0130  50S ribosomal protein L27  58.54 
 
 
84 aa  94  7e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0099  50S ribosomal protein L27  58.54 
 
 
84 aa  94  7e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1651  ribosomal protein L27  64 
 
 
84 aa  94  7e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000313884 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17721  50S ribosomal protein L27  60.71 
 
 
90 aa  93.6  8e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.106255  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0916  50S ribosomal protein L27  60.71 
 
 
90 aa  93.6  8e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0269  50S ribosomal protein L27  58.82 
 
 
85 aa  93.6  8e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.876975  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1725  50S ribosomal protein L27  56.47 
 
 
85 aa  93.6  9e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0110  50S ribosomal protein L27  60.71 
 
 
87 aa  92.8  1e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000081142  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1341  50S ribosomal protein L27  56.47 
 
 
85 aa  93.2  1e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00883743  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>