More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0530 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_0530  50S ribosomal protein L27  100 
 
 
98 aa  201  3e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163692  normal  0.125881 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4336  50S ribosomal protein L27  68.75 
 
 
98 aa  135  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000256783  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2115  50S ribosomal protein L27  72.34 
 
 
95 aa  131  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000381623  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1815  ribosomal protein L27  67.35 
 
 
102 aa  130  5e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2383  50S ribosomal protein L27  69.7 
 
 
100 aa  130  6e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000271812  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2095  50S ribosomal protein L27  69.7 
 
 
100 aa  130  6e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000243754  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0647  50S ribosomal protein L27  69.66 
 
 
89 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.908873 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2651  ribosomal protein L27  69.47 
 
 
95 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000469897  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1611  50S ribosomal protein L27  68.42 
 
 
97 aa  128  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000833239  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0424  50S ribosomal protein L27  70.93 
 
 
92 aa  128  3e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.85685  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0499  ribosomal protein L27  69.89 
 
 
93 aa  127  7.000000000000001e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0910  50S ribosomal protein L27  65.56 
 
 
96 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2540  50S ribosomal protein L27  65.56 
 
 
96 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000133026  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1515  50S ribosomal protein L27  74.7 
 
 
93 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0090282  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0559  50S ribosomal protein L27  70.45 
 
 
90 aa  125  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2549  50S ribosomal protein L27  68.82 
 
 
95 aa  124  4.0000000000000003e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000275731  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1322  50S ribosomal protein L27  70.45 
 
 
93 aa  123  7e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202247  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1209  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 
94 aa  122  1e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000000066933  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4288  50S ribosomal protein L27  64.44 
 
 
96 aa  122  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000779074  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4340  50S ribosomal protein L27  64.44 
 
 
96 aa  122  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000839795  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4176  50S ribosomal protein L27  64.44 
 
 
96 aa  122  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000152453  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4187  50S ribosomal protein L27  64.44 
 
 
96 aa  122  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0200239  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4674  50S ribosomal protein L27  64.44 
 
 
96 aa  122  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000903634  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0674  50S ribosomal protein L27  64.44 
 
 
96 aa  122  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000611432  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4522  50S ribosomal protein L27  64.44 
 
 
96 aa  122  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.230769 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3465  50S ribosomal protein L27  69.41 
 
 
94 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.360708 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0162  50S ribosomal protein L27  68.89 
 
 
92 aa  122  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000470304  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4560  50S ribosomal protein L27  64.44 
 
 
96 aa  121  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4534  50S ribosomal protein L27  64.44 
 
 
96 aa  121  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000009897  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4575  50S ribosomal protein L27  64.44 
 
 
96 aa  121  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000185796  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3242  50S ribosomal protein L27  69.88 
 
 
95 aa  121  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1735  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 
94 aa  121  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000015343  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3157  50S ribosomal protein L27  64.44 
 
 
96 aa  121  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00125079  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1702  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 
94 aa  121  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000326176  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3345  50S ribosomal protein L27  66.28 
 
 
87 aa  117  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2772  50S ribosomal protein L27  66.28 
 
 
87 aa  117  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.436114  normal  0.118024 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0746  50S ribosomal protein L27  63.95 
 
 
103 aa  116  9.999999999999999e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000122269  hitchhiker  0.000403944 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1220  50S ribosomal protein L27  67.05 
 
 
88 aa  115  1.9999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2181  50S ribosomal protein L27  68.97 
 
 
88 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.128983  normal  0.935252 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2582  50S ribosomal protein L27  69.05 
 
 
84 aa  115  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.6027199999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3196  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 
85 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000840306  unclonable  7.875010000000001e-24 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0414  50S ribosomal protein L27  61.29 
 
 
93 aa  113  8.999999999999998e-25  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0656018  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3235  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 
85 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000158281  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl439  50S ribosomal protein L27  63.33 
 
 
95 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000583794  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1368  50S ribosomal protein L27  64.37 
 
 
94 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000272527  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2237  ribosomal protein L27  62.65 
 
 
91 aa  112  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140821  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1451  50S ribosomal protein L27  64.37 
 
 
87 aa  111  3e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000000109711  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0865  50S ribosomal protein L27  68.18 
 
 
87 aa  111  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.437144  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0456  50S ribosomal protein L27  64.37 
 
 
96 aa  111  4.0000000000000004e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.031206  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3640  50S ribosomal protein L27  62.35 
 
 
88 aa  110  5e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.320466  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1120  50S ribosomal protein L27  61.86 
 
 
99 aa  110  6e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000194791  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14110  ribosomal protein L27  69.88 
 
 
92 aa  110  6e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000254683  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1632  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 
87 aa  110  8.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.848306  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0163  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 
85 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000390958  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3589  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 
84 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000197888  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0146  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 
85 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1847  50S ribosomal protein L27  69.23 
 
 
85 aa  108  3e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0846  50S ribosomal protein L27  68.75 
 
 
86 aa  108  3e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0284  50S ribosomal protein L27  66.25 
 
 
86 aa  107  4.0000000000000004e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.349085  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0461  50S ribosomal protein L27  66.25 
 
 
86 aa  107  4.0000000000000004e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00297252 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0348  50S ribosomal protein L27  62.65 
 
 
84 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000453633  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0856  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 
86 aa  107  5e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.701213  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3471  50S ribosomal protein L27  65.12 
 
 
87 aa  107  5e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00282639  normal  0.386116 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0305  50S ribosomal protein L27  61.45 
 
 
85 aa  107  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000393871  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0454  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 
89 aa  107  5e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1182  50S ribosomal protein L27  61.11 
 
 
94 aa  107  7.000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0143034  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1537  50S ribosomal protein L27  63.41 
 
 
85 aa  106  8.000000000000001e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0269  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 
85 aa  106  9.000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.876975  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3448  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 
87 aa  106  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0232252  hitchhiker  0.00744788 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0928  ribosomal protein L27  62.89 
 
 
97 aa  105  2e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000470923  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0764  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 
85 aa  105  2e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000191049  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2534  50S ribosomal protein L27  60.67 
 
 
89 aa  105  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00269432  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2691  50S ribosomal protein L27  65.12 
 
 
89 aa  105  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0303281  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15461  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 
86 aa  105  2e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.120914  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0508  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 
87 aa  105  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.868007  normal  0.531544 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2002  50S ribosomal protein L27  64.63 
 
 
85 aa  105  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.245442  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0310  50S ribosomal protein L27  59.55 
 
 
89 aa  105  2e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1190  50S ribosomal protein L27  56.67 
 
 
93 aa  105  2e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000026143  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0996  50S ribosomal protein L27  62.2 
 
 
85 aa  105  2e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2006  ribosomal protein L27  65.88 
 
 
86 aa  105  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.962508  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0087  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 
83 aa  105  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000279495  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05401  50S ribosomal protein L27  60.23 
 
 
88 aa  104  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1341  50S ribosomal protein L27  63.41 
 
 
85 aa  105  3e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00883743  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3207  ribosomal protein L27  67.95 
 
 
85 aa  105  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1504  ribosomal protein L27  63.95 
 
 
94 aa  104  4e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00591698  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3314  50S ribosomal protein L27  64.77 
 
 
88 aa  104  5e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000201837  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0526  50S ribosomal protein L27  74.32 
 
 
85 aa  104  5e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0445  50S ribosomal protein L27  64.37 
 
 
87 aa  103  6e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2522  50S ribosomal protein L27  64.37 
 
 
87 aa  103  6e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.587643  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3523  50S ribosomal protein L27  64.37 
 
 
87 aa  103  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.122565  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1304  50S ribosomal protein L27  64.37 
 
 
87 aa  103  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1141  50S ribosomal protein L27  64.37 
 
 
87 aa  103  6e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3489  50S ribosomal protein L27  64.37 
 
 
87 aa  103  6e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.562103  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3105  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 
86 aa  103  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1201  50S ribosomal protein L27  60.67 
 
 
89 aa  103  6e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.862516  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3259  50S ribosomal protein L27  64.37 
 
 
87 aa  103  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3525  50S ribosomal protein L27  64.37 
 
 
87 aa  103  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.986116  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13010  LSU ribosomal protein L27P  73.91 
 
 
95 aa  103  7e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000839598  normal  0.102019 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1725  50S ribosomal protein L27  62.2 
 
 
85 aa  103  7e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2143  50S ribosomal protein L27  61.36 
 
 
90 aa  103  7e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.672881 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>