More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_14110 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_14110  ribosomal protein L27  100 
 
 
92 aa  181  3e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000254683  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2115  50S ribosomal protein L27  76.74 
 
 
95 aa  131  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000381623  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2534  50S ribosomal protein L27  77.65 
 
 
89 aa  130  6.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00269432  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4336  50S ribosomal protein L27  71.76 
 
 
98 aa  124  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000256783  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2383  50S ribosomal protein L27  70 
 
 
100 aa  124  3e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000271812  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2095  50S ribosomal protein L27  70 
 
 
100 aa  124  3e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000243754  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1735  50S ribosomal protein L27  75.9 
 
 
94 aa  124  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000015343  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1702  50S ribosomal protein L27  75.9 
 
 
94 aa  124  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000326176  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2549  50S ribosomal protein L27  72.62 
 
 
95 aa  124  5e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000275731  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1209  50S ribosomal protein L27  74.7 
 
 
94 aa  123  7e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000000066933  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1611  50S ribosomal protein L27  75 
 
 
97 aa  123  7e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000833239  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0424  50S ribosomal protein L27  65.22 
 
 
92 aa  123  7e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.85685  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1451  50S ribosomal protein L27  68.97 
 
 
87 aa  122  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000000109711  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3465  50S ribosomal protein L27  65.93 
 
 
94 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.360708 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1220  50S ribosomal protein L27  71.95 
 
 
88 aa  121  3e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0910  50S ribosomal protein L27  69.77 
 
 
96 aa  121  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0162  50S ribosomal protein L27  75.31 
 
 
92 aa  121  4e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000470304  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3314  50S ribosomal protein L27  70.59 
 
 
88 aa  120  5e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000201837  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3157  50S ribosomal protein L27  68.24 
 
 
96 aa  120  9e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00125079  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0647  50S ribosomal protein L27  69.51 
 
 
89 aa  119  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.908873 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2540  50S ribosomal protein L27  71.95 
 
 
96 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000133026  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4534  50S ribosomal protein L27  67.44 
 
 
96 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000009897  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0674  50S ribosomal protein L27  67.44 
 
 
96 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000611432  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4288  50S ribosomal protein L27  67.44 
 
 
96 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000779074  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4340  50S ribosomal protein L27  67.44 
 
 
96 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000839795  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4176  50S ribosomal protein L27  67.44 
 
 
96 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000152453  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4187  50S ribosomal protein L27  67.44 
 
 
96 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0200239  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4674  50S ribosomal protein L27  67.44 
 
 
96 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000903634  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4560  50S ribosomal protein L27  67.44 
 
 
96 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4575  50S ribosomal protein L27  67.44 
 
 
96 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000185796  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4522  50S ribosomal protein L27  67.44 
 
 
96 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.230769 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0559  50S ribosomal protein L27  71.95 
 
 
90 aa  117  4.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1120  50S ribosomal protein L27  69.66 
 
 
99 aa  117  4.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000194791  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0180  ribosomal protein L27  71.6 
 
 
87 aa  117  7e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00344183  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1322  50S ribosomal protein L27  70.24 
 
 
93 aa  114  3.9999999999999997e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202247  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2772  50S ribosomal protein L27  69.51 
 
 
87 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.436114  normal  0.118024 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3345  50S ribosomal protein L27  69.51 
 
 
87 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1112  ribosomal protein L27  68.24 
 
 
86 aa  114  6e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.55245  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0414  50S ribosomal protein L27  70.37 
 
 
93 aa  114  6.9999999999999995e-25  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0656018  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3242  50S ribosomal protein L27  64.84 
 
 
95 aa  113  7.999999999999999e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1515  50S ribosomal protein L27  70.73 
 
 
93 aa  112  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0090282  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1524  50S ribosomal protein L27  70.24 
 
 
86 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.846788  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0456  50S ribosomal protein L27  67.9 
 
 
96 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.031206  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3235  50S ribosomal protein L27  68.29 
 
 
85 aa  111  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000158281  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1368  50S ribosomal protein L27  67.9 
 
 
94 aa  112  3e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000272527  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0530  50S ribosomal protein L27  69.88 
 
 
98 aa  110  6e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163692  normal  0.125881 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2459  50S ribosomal protein L27  69.14 
 
 
85 aa  110  7.000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.177847 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3196  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 
85 aa  110  9e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000840306  unclonable  7.875010000000001e-24 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2582  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 
84 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.6027199999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1325  50S ribosomal protein L27  60.67 
 
 
105 aa  109  1.0000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00638387  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2651  ribosomal protein L27  66.67 
 
 
95 aa  108  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000469897  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3207  ribosomal protein L27  71.95 
 
 
85 aa  108  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2002  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 
85 aa  108  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.245442  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1815  ribosomal protein L27  71.6 
 
 
102 aa  108  4.0000000000000004e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12468  50S ribosomal protein L27  67.9 
 
 
86 aa  107  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.141175  normal  0.856367 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0958  50S ribosomal protein L27  56.18 
 
 
106 aa  107  4.0000000000000004e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000205292  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1548  ribosomal protein L27  65.12 
 
 
85 aa  107  5e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104993  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0928  ribosomal protein L27  67.11 
 
 
97 aa  107  7.000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000470923  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl439  50S ribosomal protein L27  61.63 
 
 
95 aa  106  1e-22  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000583794  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2181  50S ribosomal protein L27  69.14 
 
 
88 aa  106  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.188028  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3589  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 
84 aa  105  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000197888  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3493  50S ribosomal protein L27  67.06 
 
 
85 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000310399  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0865  50S ribosomal protein L27  70.89 
 
 
87 aa  105  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.437144  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3495  50S ribosomal protein L27  67.06 
 
 
85 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000222447  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3564  50S ribosomal protein L27  67.06 
 
 
85 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00211833  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3600  50S ribosomal protein L27  67.06 
 
 
85 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00592088  normal  0.834432 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0163  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 
85 aa  105  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000390958  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3662  50S ribosomal protein L27  67.06 
 
 
85 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.0000324123  normal  0.0701159 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3975  50S ribosomal protein L27  67.06 
 
 
85 aa  105  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000219143  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3756  50S ribosomal protein L27  67.06 
 
 
85 aa  105  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000137777  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3611  50S ribosomal protein L27  67.06 
 
 
85 aa  105  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000711047  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0146  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 
85 aa  104  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03050  50S ribosomal protein L27  67.06 
 
 
85 aa  104  4e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00726587  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0522  ribosomal protein L27  67.06 
 
 
85 aa  104  4e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000023922  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4507  50S ribosomal protein L27  67.06 
 
 
85 aa  104  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000060246  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3670  50S ribosomal protein L27  67.06 
 
 
85 aa  104  4e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000967389  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0305  50S ribosomal protein L27  63.41 
 
 
85 aa  104  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000393871  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3585  50S ribosomal protein L27  67.06 
 
 
85 aa  104  4e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000250774  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3481  50S ribosomal protein L27  67.06 
 
 
85 aa  104  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000491459  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1009  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 
85 aa  104  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000911893  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0846  50S ribosomal protein L27  69.05 
 
 
86 aa  104  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0515  50S ribosomal protein L27  67.06 
 
 
85 aa  104  4e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000794781  normal  0.0169565 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03001  hypothetical protein  67.06 
 
 
85 aa  104  4e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0066535  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3378  50S ribosomal protein L27  67.06 
 
 
85 aa  104  4e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.4045e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0764  50S ribosomal protein L27  68.24 
 
 
85 aa  104  4e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000191049  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3379  ribosomal protein L27  73.91 
 
 
86 aa  104  5e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0757  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 
97 aa  104  5e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.819574  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3945  50S ribosomal protein L27  60.67 
 
 
88 aa  104  5e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2237  ribosomal protein L27  60 
 
 
91 aa  103  6e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140821  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2696  50S ribosomal protein L27  62.35 
 
 
85 aa  103  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000136289  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0269  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 
85 aa  103  6e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.876975  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3554  50S ribosomal protein L27  58.43 
 
 
88 aa  103  7e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2636  50S ribosomal protein L27  65.43 
 
 
88 aa  103  7e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.288729  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3549  50S ribosomal protein L27  58.43 
 
 
88 aa  103  7e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1182  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 
94 aa  103  7e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0143034  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13991  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 
88 aa  103  7e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.228123 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3622  50S ribosomal protein L27  58.43 
 
 
88 aa  103  7e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0916  50S ribosomal protein L27  60.23 
 
 
90 aa  103  8e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0545  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 
88 aa  103  8e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17721  50S ribosomal protein L27  60.23 
 
 
90 aa  103  8e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.106255  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>