More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0928 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_0928  ribosomal protein L27  100 
 
 		 97 aa  195  2.0000000000000003e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000470923  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1702  50S ribosomal protein L27  70.21 
 
 		 94 aa  139  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000326176  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1735  50S ribosomal protein L27  70.21 
 
 		 94 aa  139  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000015343  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1209  50S ribosomal protein L27  69.15 
 
 		 94 aa  137  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000000066933  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2115  50S ribosomal protein L27  70.97 
 
 		 95 aa  132  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000381623  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1611  50S ribosomal protein L27  71.43 
 
 		 97 aa  132  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000833239  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2540  50S ribosomal protein L27  68.13 
 
 		 96 aa  131  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000133026  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0910  50S ribosomal protein L27  67.03 
 
 		 96 aa  131  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4336  50S ribosomal protein L27  65.62 
 
 		 98 aa  130  6e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000256783  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3157  50S ribosomal protein L27  65.62 
 
 		 96 aa  130  6e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00125079  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2549  50S ribosomal protein L27  68.13 
 
 		 95 aa  130  6.999999999999999e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000275731  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4534  50S ribosomal protein L27  65.62 
 
 		 96 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000009897  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4340  50S ribosomal protein L27  65.62 
 
 		 96 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000839795  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4176  50S ribosomal protein L27  65.62 
 
 		 96 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000152453  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4187  50S ribosomal protein L27  65.62 
 
 		 96 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0200239  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4288  50S ribosomal protein L27  65.62 
 
 		 96 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000779074  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4522  50S ribosomal protein L27  65.62 
 
 		 96 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.230769 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4674  50S ribosomal protein L27  65.62 
 
 		 96 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000903634  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4560  50S ribosomal protein L27  65.62 
 
 		 96 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0674  50S ribosomal protein L27  65.62 
 
 		 96 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000611432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2383  50S ribosomal protein L27  71.11 
 
 		 100 aa  129  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000271812  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2095  50S ribosomal protein L27  71.11 
 
 		 100 aa  129  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000243754  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4575  50S ribosomal protein L27  65.62 
 
 		 96 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000185796  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0559  50S ribosomal protein L27  71.11 
 
 		 90 aa  129  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2534  50S ribosomal protein L27  65.91 
 
 		 89 aa  123  8.000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00269432  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1815  ribosomal protein L27  62.89 
 
 		 102 aa  123  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1322  50S ribosomal protein L27  68.54 
 
 		 93 aa  120  5e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202247  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0162  50S ribosomal protein L27  65.17 
 
 		 92 aa  119  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000470304  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl439  50S ribosomal protein L27  58.95 
 
 		 95 aa  119  9.999999999999999e-27  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000583794  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14110  ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 92 aa  119  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000254683  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0530  50S ribosomal protein L27  62.89 
 
 		 98 aa  119  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163692  normal  0.125881 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1368  50S ribosomal protein L27  65.17 
 
 		 94 aa  118  3e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000272527  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3314  50S ribosomal protein L27  70.37 
 
 		 88 aa  118  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000201837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0456  50S ribosomal protein L27  65.17 
 
 		 96 aa  118  3e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.031206  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2651  ribosomal protein L27  61.29 
 
 		 95 aa  117  4.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000469897  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1451  50S ribosomal protein L27  63.22 
 
 		 87 aa  117  4.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000000109711  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0414  50S ribosomal protein L27  62.22 
 
 		 93 aa  117  4.9999999999999996e-26  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0656018  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0647  50S ribosomal protein L27  62.5 
 
 		 89 aa  117  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.908873 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0424  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 		 92 aa  116  9.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.85685  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0746  50S ribosomal protein L27  63.04 
 
 		 103 aa  115  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000122269  hitchhiker  0.000403944 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1325  50S ribosomal protein L27  63.04 
 
 		 105 aa  115  1.9999999999999998e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00638387  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0499  ribosomal protein L27  63.44 
 
 		 93 aa  114  3.9999999999999997e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1182  50S ribosomal protein L27  61.11 
 
 		 94 aa  112  1.0000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0143034  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0958  50S ribosomal protein L27  60 
 
 		 106 aa  111  3e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000205292  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1220  50S ribosomal protein L27  60.23 
 
 		 88 aa  110  4.0000000000000004e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3465  50S ribosomal protein L27  62.65 
 
 		 94 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.360708 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0180  ribosomal protein L27  64.2 
 
 		 87 aa  110  5e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00344183  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1190  50S ribosomal protein L27  59.34 
 
 		 93 aa  110  8.000000000000001e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000026143  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2582  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 		 84 aa  110  9e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.6027199999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3589  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 84 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000197888  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1120  50S ribosomal protein L27  59.38 
 
 		 99 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000194791  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1515  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 		 93 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0090282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3345  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 87 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2772  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 87 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.436114  normal  0.118024 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0146  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 85 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0305  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 		 85 aa  108  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000393871  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3242  50S ribosomal protein L27  59.34 
 
 		 95 aa  107  4.0000000000000004e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0163  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 		 85 aa  107  6e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000390958  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18260  LSU ribosomal protein L27P  69.14 
 
 		 84 aa  107  7.000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0740446  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1108  ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 84 aa  106  1e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000226179  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2696  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 85 aa  105  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000136289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1137  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 84 aa  105  2e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00024272  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1548  ribosomal protein L27  62.79 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104993  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3235  50S ribosomal protein L27  62.65 
 
 		 85 aa  104  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000158281  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1326  50S ribosomal protein L27  60.71 
 
 		 84 aa  104  4e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0019115  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3196  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 85 aa  104  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000840306  unclonable  7.875010000000001e-24 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11410  LSU ribosomal protein L27P  68 
 
 		 85 aa  103  7e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.624774  hitchhiker  0.0010423 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2459  50S ribosomal protein L27  59.3 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.177847 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11550  LSU ribosomal protein L27P  63.64 
 
 		 88 aa  101  3e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.66488  normal  0.230054 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7270  50S ribosomal protein L27  59.3 
 
 		 85 aa  101  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410235  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0896  ribosomal protein L27  60 
 
 		 92 aa  102  3e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000144427  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1537  50S ribosomal protein L27  57.65 
 
 		 85 aa  101  4e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0348  50S ribosomal protein L27  60.24 
 
 		 84 aa  100  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000453633  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0203  50S ribosomal protein L27  58.89 
 
 		 100 aa  99.8  1e-20  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2181  50S ribosomal protein L27  62.96 
 
 		 88 aa  99.4  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.188028  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2060  ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 87 aa  99.8  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1112  ribosomal protein L27  59.26 
 
 		 86 aa  99.8  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.55245  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5479  50S ribosomal protein L27  60.49 
 
 		 84 aa  98.2  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0840601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2636  50S ribosomal protein L27  60.49 
 
 		 88 aa  97.8  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.288729  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3379  ribosomal protein L27  60 
 
 		 86 aa  97.8  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf327  50S ribosomal protein L27  56.32 
 
 		 90 aa  97.4  5e-20  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.871003  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2002  50S ribosomal protein L27  60.24 
 
 		 85 aa  97.4  6e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.245442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1651  ribosomal protein L27  64 
 
 		 84 aa  97.4  6e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000313884 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0090  50S ribosomal protein L27  57.32 
 
 		 84 aa  97.1  8e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0327893  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0099  50S ribosomal protein L27  57.32 
 
 		 84 aa  97.1  8e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0130  50S ribosomal protein L27  57.32 
 
 		 84 aa  97.1  8e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2259  ribosomal protein L27  56.32 
 
 		 86 aa  97.1  8e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.583782  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0757  50S ribosomal protein L27  59.26 
 
 		 97 aa  97.1  8e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.819574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3480  50S ribosomal protein L27  58.33 
 
 		 84 aa  97.1  8e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.219876  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2703  50S ribosomal protein L27  57.65 
 
 		 92 aa  96.7  9e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2575  50S ribosomal protein L27  57.65 
 
 		 92 aa  96.7  9e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2128  50S ribosomal protein L27  55.68 
 
 		 88 aa  96.7  9e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.861173  normal  0.607727 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1504  ribosomal protein L27  57.95 
 
 		 94 aa  96.7  9e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00591698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12468  50S ribosomal protein L27  61.73 
 
 		 86 aa  96.7  9e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.141175  normal  0.856367 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2282  ribosomal protein L27  65.33 
 
 		 84 aa  96.7  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.277784  hitchhiker  0.000388636 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3450  50S ribosomal protein L27  62.67 
 
 		 84 aa  96.3  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.136953  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0110  50S ribosomal protein L27  60.81 
 
 		 87 aa  95.1  2e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000081142  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0091  50S ribosomal protein L27  56.47 
 
 		 114 aa  95.9  2e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0260692 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1009  50S ribosomal protein L27  58.33 
 
 		 85 aa  95.5  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000911893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5259  50S ribosomal protein L27  65.28 
 
 		 95 aa  95.9  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137345  normal  0.272276 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>