More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1325 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1325  50S ribosomal protein L27  100 
 
 
105 aa  216  1e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00638387  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0958  50S ribosomal protein L27  72.45 
 
 
106 aa  151  4e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000205292  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0456  50S ribosomal protein L27  72.83 
 
 
96 aa  144  3e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.031206  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0746  50S ribosomal protein L27  71.88 
 
 
103 aa  142  1e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000122269  hitchhiker  0.000403944 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1368  50S ribosomal protein L27  72.22 
 
 
94 aa  141  4e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000272527  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1190  50S ribosomal protein L27  73.91 
 
 
93 aa  135  1e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000026143  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2549  50S ribosomal protein L27  68.82 
 
 
95 aa  130  3.9999999999999996e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000275731  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1735  50S ribosomal protein L27  70 
 
 
94 aa  126  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000015343  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1702  50S ribosomal protein L27  70 
 
 
94 aa  126  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000326176  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1209  50S ribosomal protein L27  68.13 
 
 
94 aa  124  3e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000000066933  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4534  50S ribosomal protein L27  64.89 
 
 
96 aa  123  7e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000009897  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4575  50S ribosomal protein L27  64.89 
 
 
96 aa  123  7e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000185796  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4560  50S ribosomal protein L27  64.89 
 
 
96 aa  123  7e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2383  50S ribosomal protein L27  62 
 
 
100 aa  123  9e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000271812  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2095  50S ribosomal protein L27  62 
 
 
100 aa  123  9e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000243754  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3157  50S ribosomal protein L27  64.89 
 
 
96 aa  122  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00125079  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2115  50S ribosomal protein L27  70.93 
 
 
95 aa  122  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000381623  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4340  50S ribosomal protein L27  63.83 
 
 
96 aa  122  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000839795  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4176  50S ribosomal protein L27  63.83 
 
 
96 aa  122  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000152453  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4187  50S ribosomal protein L27  63.83 
 
 
96 aa  122  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0200239  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4674  50S ribosomal protein L27  63.83 
 
 
96 aa  122  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000903634  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4288  50S ribosomal protein L27  63.83 
 
 
96 aa  122  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000779074  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1611  50S ribosomal protein L27  68.54 
 
 
97 aa  122  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000833239  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0674  50S ribosomal protein L27  63.83 
 
 
96 aa  122  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000611432  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4522  50S ribosomal protein L27  63.83 
 
 
96 aa  122  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.230769 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1322  50S ribosomal protein L27  65.59 
 
 
93 aa  119  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202247  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1182  50S ribosomal protein L27  63.33 
 
 
94 aa  119  1.9999999999999998e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0143034  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0910  50S ribosomal protein L27  59.57 
 
 
96 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2540  50S ribosomal protein L27  62.22 
 
 
96 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000133026  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0559  50S ribosomal protein L27  67.82 
 
 
90 aa  115  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4336  50S ribosomal protein L27  61.7 
 
 
98 aa  114  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000256783  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2534  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 
89 aa  113  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00269432  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0162  50S ribosomal protein L27  60.44 
 
 
92 aa  113  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000470304  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3314  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 
88 aa  110  5e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000201837  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2582  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 
84 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.6027199999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14110  ribosomal protein L27  60.67 
 
 
92 aa  109  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000254683  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0414  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 
93 aa  107  5e-23  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0656018  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl439  50S ribosomal protein L27  62.35 
 
 
95 aa  106  1e-22  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000583794  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0928  ribosomal protein L27  63.04 
 
 
97 aa  105  2e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000470923  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3196  50S ribosomal protein L27  63.41 
 
 
85 aa  103  6e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000840306  unclonable  7.875010000000001e-24 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0530  50S ribosomal protein L27  56.99 
 
 
98 aa  103  8e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163692  normal  0.125881 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3235  50S ribosomal protein L27  63.41 
 
 
85 aa  103  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000158281  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1815  ribosomal protein L27  54 
 
 
102 aa  102  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1120  50S ribosomal protein L27  57.78 
 
 
99 aa  102  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000194791  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0348  50S ribosomal protein L27  62.2 
 
 
84 aa  102  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000453633  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1220  50S ribosomal protein L27  63.41 
 
 
88 aa  101  3e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3589  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 
84 aa  101  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000197888  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1451  50S ribosomal protein L27  64.2 
 
 
87 aa  101  4e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000000109711  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf327  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 
90 aa  100  5e-21  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.871003  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0180  ribosomal protein L27  62.5 
 
 
87 aa  100  7e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00344183  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0424  50S ribosomal protein L27  60.98 
 
 
92 aa  100  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.85685  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0146  50S ribosomal protein L27  62.65 
 
 
85 aa  99.4  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2128  50S ribosomal protein L27  59.52 
 
 
88 aa  98.2  3e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.861173  normal  0.607727 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0163  50S ribosomal protein L27  61.45 
 
 
85 aa  98.2  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000390958  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3465  50S ribosomal protein L27  54.84 
 
 
94 aa  98.2  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.360708 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2772  50S ribosomal protein L27  59.76 
 
 
87 aa  98.2  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.436114  normal  0.118024 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3345  50S ribosomal protein L27  59.76 
 
 
87 aa  98.2  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0305  50S ribosomal protein L27  61.45 
 
 
85 aa  97.8  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000393871  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2651  ribosomal protein L27  54.35 
 
 
95 aa  97.8  5e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000469897  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05401  50S ribosomal protein L27  59.52 
 
 
88 aa  97.4  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0896  ribosomal protein L27  58.62 
 
 
92 aa  97.4  6e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000144427  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0545  50S ribosomal protein L27  67.14 
 
 
88 aa  96.3  1e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13991  50S ribosomal protein L27  58.33 
 
 
88 aa  96.3  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.228123 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0203  50S ribosomal protein L27  56.18 
 
 
100 aa  95.9  2e-19  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0679  ribosomal protein L27  66.2 
 
 
84 aa  95.5  2e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000246581  normal  0.202248 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0284  50S ribosomal protein L27  60.71 
 
 
86 aa  95.5  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.349085  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0461  50S ribosomal protein L27  60.71 
 
 
86 aa  95.5  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00297252 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1515  50S ribosomal protein L27  59.76 
 
 
93 aa  94.4  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0090282  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17721  50S ribosomal protein L27  55.81 
 
 
90 aa  93.6  7e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.106255  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0916  50S ribosomal protein L27  55.81 
 
 
90 aa  93.6  7e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0647  50S ribosomal protein L27  56.1 
 
 
89 aa  93.2  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.908873 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1537  50S ribosomal protein L27  58.54 
 
 
85 aa  92.4  2e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3418  50S ribosomal protein L27  59.52 
 
 
88 aa  92  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2042  50S ribosomal protein L27  60.49 
 
 
89 aa  90.9  5e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.20995 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0193  50S ribosomal protein L27  59.26 
 
 
90 aa  90.9  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.451706 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3282  50S ribosomal protein L27  56.98 
 
 
91 aa  90.5  6e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0455195 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1112  ribosomal protein L27  60 
 
 
86 aa  90.5  7e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.55245  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1443  50S ribosomal protein L27  55.95 
 
 
86 aa  90.1  8e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15311  50S ribosomal protein L27  54.76 
 
 
86 aa  90.1  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.854601  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0269  50S ribosomal protein L27  59.76 
 
 
85 aa  89.7  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.876975  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1415  50S ribosomal protein L27  56.79 
 
 
85 aa  89.7  1e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2651  50S ribosomal protein L27  60.76 
 
 
86 aa  89.4  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0231869  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0508  50S ribosomal protein L27  59.49 
 
 
87 aa  89.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.868007  normal  0.531544 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3554  50S ribosomal protein L27  55.17 
 
 
88 aa  90.1  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3549  50S ribosomal protein L27  55.17 
 
 
88 aa  90.1  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1524  50S ribosomal protein L27  60.49 
 
 
86 aa  89.7  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.846788  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0195  50S ribosomal protein L27  58.14 
 
 
86 aa  89.7  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000826463  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3622  50S ribosomal protein L27  55.17 
 
 
88 aa  90.1  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2143  50S ribosomal protein L27  58.02 
 
 
90 aa  89  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.672881 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0090  50S ribosomal protein L27  58.02 
 
 
84 aa  89.4  2e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0327893  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0130  50S ribosomal protein L27  58.02 
 
 
84 aa  89.4  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0930  50S ribosomal protein L27  58.02 
 
 
89 aa  89.4  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3188  50S ribosomal protein L27  59.26 
 
 
89 aa  88.6  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.263255  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1341  50S ribosomal protein L27  59.26 
 
 
85 aa  89  2e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00883743  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0099  50S ribosomal protein L27  58.02 
 
 
84 aa  89.4  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1725  50S ribosomal protein L27  58.02 
 
 
85 aa  89  2e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2785  50S ribosomal protein L27  60.49 
 
 
89 aa  89.4  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0242571  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0213  50S ribosomal protein L27  58.14 
 
 
86 aa  89  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.280528 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0184  50S ribosomal protein L27  58.02 
 
 
84 aa  89  2e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3448  50S ribosomal protein L27  59.49 
 
 
87 aa  89  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0232252  hitchhiker  0.00744788 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>