More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1112 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1112  ribosomal protein L27  100 
 
 		 86 aa  170  5.999999999999999e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.55245  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0180  ribosomal protein L27  77.65 
 
 		 87 aa  121  3e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00344183  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0647  50S ribosomal protein L27  70.93 
 
 		 89 aa  119  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.908873 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1524  50S ribosomal protein L27  81.08 
 
 		 86 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.846788  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1188  50S ribosomal protein L27  69.77 
 
 		 87 aa  116  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3314  50S ribosomal protein L27  69.77 
 
 		 88 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000201837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12510  50S ribosomal protein L27  70.93 
 
 		 85 aa  115  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.768162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1220  50S ribosomal protein L27  71.76 
 
 		 88 aa  114  3.9999999999999997e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3465  50S ribosomal protein L27  70.24 
 
 		 94 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.360708 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14110  ribosomal protein L27  68.24 
 
 		 92 aa  114  6e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000254683  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2383  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 		 100 aa  113  7.999999999999999e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000271812  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2095  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 		 100 aa  113  7.999999999999999e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000243754  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0424  50S ribosomal protein L27  69.77 
 
 		 92 aa  113  8.999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.85685  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3379  ribosomal protein L27  69.77 
 
 		 86 aa  113  8.999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0910  50S ribosomal protein L27  69.41 
 
 		 96 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2549  50S ribosomal protein L27  67.44 
 
 		 95 aa  112  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000275731  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1548  ribosomal protein L27  72.62 
 
 		 85 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104993  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2459  50S ribosomal protein L27  75 
 
 		 85 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.177847 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1120  50S ribosomal protein L27  68.97 
 
 		 87 aa  112  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.645406  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2540  50S ribosomal protein L27  69.41 
 
 		 96 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000133026  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2534  50S ribosomal protein L27  70.37 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00269432  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0454  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0110  50S ribosomal protein L27  65.12 
 
 		 87 aa  111  3e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000081142  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0512  50S ribosomal protein L27  70.59 
 
 		 85 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0535164 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0892  50S ribosomal protein L27  69.05 
 
 		 85 aa  110  5e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0670599 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2060  ribosomal protein L27  68.6 
 
 		 87 aa  110  7.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1451  50S ribosomal protein L27  69.05 
 
 		 87 aa  110  7.000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000000109711  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0162  50S ribosomal protein L27  71.95 
 
 		 92 aa  110  8.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000470304  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0838  50S ribosomal protein L27  69.05 
 
 		 85 aa  110  9e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.34705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05970  LSU ribosomal protein L27P  63.95 
 
 		 84 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000567704  hitchhiker  0.000000000000675699 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2703  50S ribosomal protein L27  63.95 
 
 		 92 aa  109  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2575  50S ribosomal protein L27  63.95 
 
 		 92 aa  109  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2181  50S ribosomal protein L27  71.43 
 
 		 88 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.188028  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1515  50S ribosomal protein L27  72.29 
 
 		 93 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0090282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3157  50S ribosomal protein L27  69.88 
 
 		 96 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00125079  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0019  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 86 aa  109  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4575  50S ribosomal protein L27  69.05 
 
 		 96 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000185796  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4534  50S ribosomal protein L27  69.05 
 
 		 96 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000009897  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1572  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 		 85 aa  108  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.355414  normal  0.759943 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4883  ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 92 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.113157  normal  0.111687 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3276  50S ribosomal protein L27  67.06 
 
 		 85 aa  108  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000212602 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1754  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 		 85 aa  108  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.163114  normal  0.0575884 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2636  50S ribosomal protein L27  69.14 
 
 		 88 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.288729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4560  50S ribosomal protein L27  69.05 
 
 		 96 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3674  50S ribosomal protein L27  67.06 
 
 		 85 aa  108  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.99139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0269  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 		 85 aa  108  3e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.876975  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1120  50S ribosomal protein L27  70.59 
 
 		 99 aa  108  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000194791  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2772  50S ribosomal protein L27  65.12 
 
 		 87 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.436114  normal  0.118024 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3345  50S ribosomal protein L27  65.12 
 
 		 87 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4217  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 85 aa  108  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0674  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 		 96 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000611432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3916  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 91 aa  107  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00853508 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4340  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 		 96 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000839795  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4176  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 		 96 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000152453  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4187  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 		 96 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0200239  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0916  50S ribosomal protein L27  62.92 
 
 		 90 aa  108  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17721  50S ribosomal protein L27  62.92 
 
 		 90 aa  108  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.106255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4288  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 		 96 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000779074  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4522  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 		 96 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.230769 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2128  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 88 aa  107  4.0000000000000004e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.861173  normal  0.607727 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4674  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 		 96 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000903634  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2259  ribosomal protein L27  64.71 
 
 		 86 aa  107  4.0000000000000004e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.583782  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7270  50S ribosomal protein L27  70.24 
 
 		 85 aa  107  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410235  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4336  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 98 aa  107  6e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000256783  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05534  50S ribosomal protein L27  69.51 
 
 		 86 aa  107  7.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000340822  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12468  50S ribosomal protein L27  65.12 
 
 		 86 aa  107  7.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.141175  normal  0.856367 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1611  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 		 97 aa  106  8.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000833239  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0757  50S ribosomal protein L27  72.84 
 
 		 97 aa  106  8.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.819574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0896  ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 92 aa  106  9.000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000144427  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05401  50S ribosomal protein L27  75.36 
 
 		 88 aa  106  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0865  50S ribosomal protein L27  64.37 
 
 		 87 aa  106  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.437144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0545  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 		 88 aa  106  1e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1651  ribosomal protein L27  67.44 
 
 		 84 aa  106  1e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000313884 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13991  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 		 88 aa  106  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.228123 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2115  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 		 95 aa  106  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000381623  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2218  50S ribosomal protein L27  67.06 
 
 		 85 aa  106  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000800329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0497  50S ribosomal protein L27  62.79 
 
 		 90 aa  106  1e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000367607  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0750  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 		 85 aa  106  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00233026 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1589  ribosomal protein L27  67.44 
 
 		 85 aa  106  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00579219  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3945  50S ribosomal protein L27  67.9 
 
 		 88 aa  105  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3073  50S ribosomal protein L27  65.12 
 
 		 91 aa  105  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000209952  unclonable  0.0000000174741 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5485  50S ribosomal protein L27  75.71 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.132015  normal  0.505389 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1735  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 		 94 aa  105  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000015343  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40780  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1269  50S ribosomal protein L27  74.29 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000774064  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11410  LSU ribosomal protein L27P  66.28 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.624774  hitchhiker  0.0010423 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1702  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 		 94 aa  105  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000326176  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0456  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 96 aa  105  2e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.031206  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2006  ribosomal protein L27  68.6 
 
 		 86 aa  105  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.962508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3450  50S ribosomal protein L27  67.06 
 
 		 84 aa  105  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.136953  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0700  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 83 aa  105  3e-22  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.987628  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1368  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 		 94 aa  105  3e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000272527  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0771  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 85 aa  104  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0679  ribosomal protein L27  60.47 
 
 		 84 aa  105  3e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000246581  normal  0.202248 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3554  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 88 aa  105  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1682  50S ribosomal protein L27  62.79 
 
 		 90 aa  104  3e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00000249957  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2217  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 		 91 aa  105  3e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.856627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3549  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 88 aa  105  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0842  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 85 aa  104  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.987021  normal  0.6635 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3622  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 88 aa  105  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>