More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2459 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2459  50S ribosomal protein L27  100 
 
 		 85 aa  169  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.177847 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7270  50S ribosomal protein L27  90.59 
 
 		 85 aa  155  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410235  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1548  ribosomal protein L27  87.06 
 
 		 85 aa  147  7e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104993  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2181  50S ribosomal protein L27  84.34 
 
 		 88 aa  142  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.188028  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3450  50S ribosomal protein L27  81.71 
 
 		 84 aa  137  3.9999999999999997e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.136953  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3379  ribosomal protein L27  80.95 
 
 		 86 aa  137  6e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3480  50S ribosomal protein L27  80.49 
 
 		 84 aa  137  6e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.219876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5259  50S ribosomal protein L27  81.48 
 
 		 95 aa  135  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137345  normal  0.272276 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11410  LSU ribosomal protein L27P  79.27 
 
 		 85 aa  135  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.624774  hitchhiker  0.0010423 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7271  50S ribosomal protein L27  76.47 
 
 		 85 aa  135  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.956462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3549  50S ribosomal protein L27  77.38 
 
 		 88 aa  134  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1651  ribosomal protein L27  79.27 
 
 		 84 aa  134  4e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000313884 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3554  50S ribosomal protein L27  77.38 
 
 		 88 aa  134  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3622  50S ribosomal protein L27  77.38 
 
 		 88 aa  134  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0757  50S ribosomal protein L27  82.72 
 
 		 97 aa  133  8e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.819574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2060  ribosomal protein L27  79.76 
 
 		 87 aa  133  9e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3859  50S ribosomal protein L27  79.27 
 
 		 84 aa  132  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.598699  hitchhiker  0.0021541 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2282  ribosomal protein L27  78.05 
 
 		 84 aa  131  3e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.277784  hitchhiker  0.000388636 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12510  50S ribosomal protein L27  79.52 
 
 		 85 aa  130  3.9999999999999996e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.768162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3945  50S ribosomal protein L27  78.31 
 
 		 88 aa  130  6.999999999999999e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2259  ribosomal protein L27  74.12 
 
 		 86 aa  130  9e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.583782  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1188  50S ribosomal protein L27  77.11 
 
 		 87 aa  129  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12468  50S ribosomal protein L27  79.01 
 
 		 86 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.141175  normal  0.856367 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2636  50S ribosomal protein L27  79.01 
 
 		 88 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.288729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11550  LSU ribosomal protein L27P  77.78 
 
 		 88 aa  128  2.0000000000000002e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.66488  normal  0.230054 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1504  ribosomal protein L27  77.78 
 
 		 94 aa  128  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00591698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5479  50S ribosomal protein L27  75.61 
 
 		 84 aa  128  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0840601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3456  50S ribosomal protein L27  74.12 
 
 		 85 aa  128  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225888  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1623  50S ribosomal protein L27  74.7 
 
 		 85 aa  127  5.0000000000000004e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.723727  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2144  50S ribosomal protein L27  77.78 
 
 		 87 aa  127  7.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.67084e-17 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2390  50S ribosomal protein L27  77.78 
 
 		 87 aa  127  7.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0854372  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1120  50S ribosomal protein L27  75.29 
 
 		 99 aa  126  9.000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000194791  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1589  ribosomal protein L27  77.11 
 
 		 85 aa  125  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00579219  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10120  LSU ribosomal protein L27P  70.59 
 
 		 85 aa  123  8.000000000000001e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.28486  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18260  LSU ribosomal protein L27P  73.17 
 
 		 84 aa  121  4e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0740446  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3465  50S ribosomal protein L27  70.93 
 
 		 94 aa  120  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.360708 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1474  ribosomal protein L27  80.95 
 
 		 87 aa  118  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.867034  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1221  50S ribosomal protein L27  82.86 
 
 		 88 aa  118  3e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.393173 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1524  50S ribosomal protein L27  72.84 
 
 		 86 aa  116  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.846788  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2772  50S ribosomal protein L27  68.24 
 
 		 87 aa  113  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.436114  normal  0.118024 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3345  50S ribosomal protein L27  68.24 
 
 		 87 aa  113  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1220  50S ribosomal protein L27  67.44 
 
 		 88 aa  113  8.999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0424  50S ribosomal protein L27  69.88 
 
 		 92 aa  113  1.0000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.85685  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2247  50S ribosomal protein L27  71.43 
 
 		 85 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000000479005  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3471  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 87 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00282639  normal  0.386116 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0647  50S ribosomal protein L27  67.06 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.908873 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3242  50S ribosomal protein L27  67.44 
 
 		 95 aa  112  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1112  ribosomal protein L27  75 
 
 		 86 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.55245  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0269  50S ribosomal protein L27  69.41 
 
 		 85 aa  110  5e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.876975  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0162  50S ribosomal protein L27  72.29 
 
 		 92 aa  110  7.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000470304  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14110  ribosomal protein L27  69.14 
 
 		 92 aa  110  7.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000254683  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2703  50S ribosomal protein L27  69.05 
 
 		 92 aa  110  8.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2575  50S ribosomal protein L27  69.05 
 
 		 92 aa  110  8.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0180  ribosomal protein L27  71.08 
 
 		 87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00344183  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2534  50S ribosomal protein L27  70.73 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00269432  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1515  50S ribosomal protein L27  71.08 
 
 		 93 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0090282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2115  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 		 95 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000381623  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1815  ribosomal protein L27  67.06 
 
 		 102 aa  107  5e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1632  50S ribosomal protein L27  68.6 
 
 		 87 aa  107  5e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.848306  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0764  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 		 85 aa  107  6e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000191049  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4921  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 88 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0271507  normal  0.71556 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05970  LSU ribosomal protein L27P  63.86 
 
 		 84 aa  107  7.000000000000001e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000567704  hitchhiker  0.000000000000675699 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1611  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 97 aa  107  7.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000833239  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2549  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 		 95 aa  107  8.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000275731  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4336  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 		 98 aa  107  8.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000256783  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1735  50S ribosomal protein L27  65.12 
 
 		 94 aa  106  8.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000015343  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1702  50S ribosomal protein L27  65.12 
 
 		 94 aa  106  8.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000326176  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4413  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 88 aa  106  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1209  50S ribosomal protein L27  63.95 
 
 		 94 aa  106  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000000066933  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1617  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 82 aa  106  1e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000121175  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13010  LSU ribosomal protein L27P  72.46 
 
 		 95 aa  105  1e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000839598  normal  0.102019 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4876  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 88 aa  106  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.387156 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1182  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 		 94 aa  106  1e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0143034  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1451  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 		 87 aa  105  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000000109711  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3006  50S ribosomal protein L27  65.12 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.549132 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4194  50S ribosomal protein L27  63.95 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3460  50S ribosomal protein L27  63.95 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159862  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3870  50S ribosomal protein L27  63.95 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.403314  normal  0.0137956 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2957  50S ribosomal protein L27  66.28 
 
 		 86 aa  104  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668202  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3105  50S ribosomal protein L27  66.28 
 
 		 86 aa  105  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4724  50S ribosomal protein L27  63.41 
 
 		 88 aa  105  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0668122  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2006  ribosomal protein L27  69.05 
 
 		 86 aa  104  4e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.962508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0846  50S ribosomal protein L27  70.59 
 
 		 86 aa  104  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1537  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 		 85 aa  104  4e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0856  50S ribosomal protein L27  65.12 
 
 		 86 aa  104  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.701213  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0107  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 88 aa  103  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.176189 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0809  50S ribosomal protein L27  65.43 
 
 		 81 aa  103  6e-22  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.115464  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3674  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 85 aa  103  8e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.99139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0910  50S ribosomal protein L27  62.79 
 
 		 96 aa  102  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3235  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 85 aa  102  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000158281  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1849  50S ribosomal protein L27  63.95 
 
 		 89 aa  102  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0865  50S ribosomal protein L27  67.44 
 
 		 87 aa  102  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.437144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1781  50S ribosomal protein L27  63.95 
 
 		 89 aa  102  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.810643  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2237  ribosomal protein L27  66.27 
 
 		 91 aa  102  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0213  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 86 aa  103  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.280528 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1223  ribosomal protein L27  62.2 
 
 		 83 aa  103  1e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000141785 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0508  50S ribosomal protein L27  61.63 
 
 		 87 aa  103  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.868007  normal  0.531544 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0497  50S ribosomal protein L27  62.07 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000367607  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3196  50S ribosomal protein L27  62.35 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000840306  unclonable  7.875010000000001e-24 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0414  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 		 93 aa  102  2e-21  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0656018  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>