More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2128 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2128  50S ribosomal protein L27  100 
 
 		 88 aa  173  8e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.861173  normal  0.607727 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0545  50S ribosomal protein L27  94.19 
 
 		 88 aa  163  6.9999999999999995e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05401  50S ribosomal protein L27  88.64 
 
 		 88 aa  160  6e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0916  50S ribosomal protein L27  91.76 
 
 		 90 aa  157  4e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17721  50S ribosomal protein L27  91.76 
 
 		 90 aa  157  4e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.106255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13991  50S ribosomal protein L27  87.5 
 
 		 88 aa  157  5e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.228123 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15311  50S ribosomal protein L27  86.9 
 
 		 86 aa  149  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.854601  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1443  50S ribosomal protein L27  85.71 
 
 		 86 aa  148  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15061  50S ribosomal protein L27  82.14 
 
 		 86 aa  143  6e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.610968  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15461  50S ribosomal protein L27  84.52 
 
 		 86 aa  142  1e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.120914  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0647  50S ribosomal protein L27  68.18 
 
 		 89 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.908873 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3345  50S ribosomal protein L27  65.91 
 
 		 87 aa  115  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2772  50S ribosomal protein L27  65.91 
 
 		 87 aa  115  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.436114  normal  0.118024 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3465  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 		 94 aa  114  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.360708 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1220  50S ribosomal protein L27  77.14 
 
 		 88 aa  113  7.999999999999999e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0679  ribosomal protein L27  72.86 
 
 		 84 aa  113  8.999999999999998e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000246581  normal  0.202248 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0424  50S ribosomal protein L27  70.24 
 
 		 92 aa  112  1.0000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.85685  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3196  50S ribosomal protein L27  62.5 
 
 		 85 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000840306  unclonable  7.875010000000001e-24 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1009  50S ribosomal protein L27  68.6 
 
 		 85 aa  112  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000911893  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3235  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 		 85 aa  111  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000158281  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0559  50S ribosomal protein L27  67.44 
 
 		 85 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00191418  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0794  50S ribosomal protein L27  67.44 
 
 		 85 aa  110  5e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000203934  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3379  ribosomal protein L27  64.77 
 
 		 86 aa  110  6e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0019  50S ribosomal protein L27  74.29 
 
 		 86 aa  110  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3756  50S ribosomal protein L27  67.44 
 
 		 85 aa  110  8.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000137777  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3611  50S ribosomal protein L27  67.44 
 
 		 85 aa  110  8.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000711047  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3975  50S ribosomal protein L27  67.44 
 
 		 85 aa  110  8.000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000219143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1515  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 		 93 aa  110  9e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0090282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3418  50S ribosomal protein L27  63.95 
 
 		 88 aa  110  9e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0269  50S ribosomal protein L27  62.07 
 
 		 85 aa  109  1.0000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.876975  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3359  ribosomal protein L27  67.44 
 
 		 85 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000421163  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3478  ribosomal protein L27  67.44 
 
 		 85 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000653762  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3322  50S ribosomal protein L27  67.44 
 
 		 84 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000182867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1037  50S ribosomal protein L27  67.44 
 
 		 84 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000911721  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0474  50S ribosomal protein L27  68.6 
 
 		 85 aa  108  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000537628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1070  50S ribosomal protein L27  67.44 
 
 		 84 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000153229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0968  50S ribosomal protein L27  67.44 
 
 		 84 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000160226  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0870  50S ribosomal protein L27  67.44 
 
 		 84 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000545576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13010  LSU ribosomal protein L27P  72.46 
 
 		 95 aa  108  2.0000000000000002e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000839598  normal  0.102019 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3651  50S ribosomal protein L27  67.44 
 
 		 84 aa  108  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0856  50S ribosomal protein L27  63.64 
 
 		 86 aa  108  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.701213  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3207  ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 85 aa  108  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0980  50S ribosomal protein L27  67.44 
 
 		 84 aa  108  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000110997  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0180  ribosomal protein L27  69.05 
 
 		 87 aa  108  3e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00344183  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0896  50S ribosomal protein L27  67.44 
 
 		 84 aa  108  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000837185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3124  50S ribosomal protein L27  67.44 
 
 		 84 aa  108  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000107863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3218  50S ribosomal protein L27  67.44 
 
 		 84 aa  108  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1112  ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 86 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.55245  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0853  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 		 84 aa  107  5e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152445  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0955  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 		 84 aa  107  5e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.455715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2534  50S ribosomal protein L27  64.37 
 
 		 89 aa  107  6e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00269432  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2115  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 		 95 aa  107  6e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000381623  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03050  50S ribosomal protein L27  66.28 
 
 		 85 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00726587  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0522  ribosomal protein L27  66.28 
 
 		 85 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000023922  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3481  50S ribosomal protein L27  66.28 
 
 		 85 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000491459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3378  50S ribosomal protein L27  66.28 
 
 		 85 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.4045e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0515  50S ribosomal protein L27  66.28 
 
 		 85 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000794781  normal  0.0169565 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2582  50S ribosomal protein L27  61.63 
 
 		 84 aa  107  7.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.6027199999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3585  50S ribosomal protein L27  66.28 
 
 		 85 aa  107  7.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000250774  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4507  50S ribosomal protein L27  66.28 
 
 		 85 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000060246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2926  50S ribosomal protein L27  66.28 
 
 		 84 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000309766  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03001  hypothetical protein  66.28 
 
 		 85 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0066535  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3670  50S ribosomal protein L27  66.28 
 
 		 85 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000967389  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3088  50S ribosomal protein L27  66.28 
 
 		 84 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3564  50S ribosomal protein L27  66.28 
 
 		 85 aa  106  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00211833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3493  50S ribosomal protein L27  66.28 
 
 		 85 aa  106  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000310399  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1005  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 		 84 aa  106  9.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000876711  decreased coverage  0.00000356458 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3600  50S ribosomal protein L27  66.28 
 
 		 85 aa  106  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00592088  normal  0.834432 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3495  50S ribosomal protein L27  66.28 
 
 		 85 aa  106  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000222447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3662  50S ribosomal protein L27  66.28 
 
 		 85 aa  106  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.0000324123  normal  0.0701159 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1188  50S ribosomal protein L27  63.22 
 
 		 87 aa  105  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2060  ribosomal protein L27  62.5 
 
 		 87 aa  106  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3242  50S ribosomal protein L27  62.5 
 
 		 95 aa  106  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2237  ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 91 aa  106  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140821  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4217  50S ribosomal protein L27  62.07 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0863  50S ribosomal protein L27  60.23 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0966779  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00801  50S ribosomal protein L27  65.12 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3621  50S ribosomal protein L27  67.44 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000351057  normal  0.260967 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001672  LSU ribosomal protein L27p  65.12 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000226464  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0362  50S ribosomal protein L27  63.95 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000249852  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0456  50S ribosomal protein L27  61.36 
 
 		 96 aa  105  2e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.031206  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3589  50S ribosomal protein L27  58.62 
 
 		 84 aa  105  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000197888  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2828  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 84 aa  105  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000113295  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3471  50S ribosomal protein L27  61.36 
 
 		 87 aa  104  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00282639  normal  0.386116 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05970  LSU ribosomal protein L27P  69.57 
 
 		 84 aa  104  3e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000567704  hitchhiker  0.000000000000675699 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1030  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 84 aa  105  3e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0011666  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2854  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 		 86 aa  104  4e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000234792  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7271  50S ribosomal protein L27  60.23 
 
 		 85 aa  104  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.956462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0162  50S ribosomal protein L27  62.07 
 
 		 92 aa  104  5e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000470304  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4511  50S ribosomal protein L27  62.79 
 
 		 85 aa  103  5e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2636  50S ribosomal protein L27  62.07 
 
 		 88 aa  104  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.288729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0284  50S ribosomal protein L27  57.95 
 
 		 86 aa  103  5e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.349085  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1524  50S ribosomal protein L27  72.46 
 
 		 86 aa  104  5e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.846788  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0771  50S ribosomal protein L27  61.63 
 
 		 85 aa  104  5e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0842  50S ribosomal protein L27  61.63 
 
 		 85 aa  104  5e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.987021  normal  0.6635 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0461  50S ribosomal protein L27  57.95 
 
 		 86 aa  103  5e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00297252 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0750  50S ribosomal protein L27  61.63 
 
 		 85 aa  103  6e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00233026 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1847  50S ribosomal protein L27  63.22 
 
 		 85 aa  103  6e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0838  50S ribosomal protein L27  61.63 
 
 		 85 aa  103  6e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.34705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0508  50S ribosomal protein L27  57.95 
 
 		 87 aa  103  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.868007  normal  0.531544 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>