More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0679 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0679  ribosomal protein L27  100 
 
 		 84 aa  168  2e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000246581  normal  0.202248 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2012  ribosomal protein L27  79.75 
 
 		 83 aa  134  6.0000000000000005e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000441981  unclonable  3.43128e-16 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05970  LSU ribosomal protein L27P  66.67 
 
 		 84 aa  120  8e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000567704  hitchhiker  0.000000000000675699 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13010  LSU ribosomal protein L27P  68.89 
 
 		 95 aa  119  1.9999999999999998e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000839598  normal  0.102019 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5259  50S ribosomal protein L27  70.24 
 
 		 95 aa  115  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137345  normal  0.272276 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3945  50S ribosomal protein L27  69.32 
 
 		 88 aa  114  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0019  50S ribosomal protein L27  67.44 
 
 		 86 aa  114  5e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2636  50S ribosomal protein L27  68.18 
 
 		 88 aa  114  5e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.288729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2128  50S ribosomal protein L27  72.86 
 
 		 88 aa  113  8.999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.861173  normal  0.607727 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1188  50S ribosomal protein L27  68.24 
 
 		 87 aa  113  8.999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11550  LSU ribosomal protein L27P  68.24 
 
 		 88 aa  113  8.999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.66488  normal  0.230054 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3345  50S ribosomal protein L27  67.82 
 
 		 87 aa  113  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2772  50S ribosomal protein L27  67.82 
 
 		 87 aa  113  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.436114  normal  0.118024 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0508  50S ribosomal protein L27  71.76 
 
 		 87 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.868007  normal  0.531544 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1220  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 88 aa  112  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05401  50S ribosomal protein L27  72.86 
 
 		 88 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0424  50S ribosomal protein L27  66.29 
 
 		 92 aa  111  3e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.85685  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3554  50S ribosomal protein L27  68.29 
 
 		 88 aa  111  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3448  50S ribosomal protein L27  71.76 
 
 		 87 aa  112  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0232252  hitchhiker  0.00744788 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3549  50S ribosomal protein L27  68.29 
 
 		 88 aa  111  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3622  50S ribosomal protein L27  68.29 
 
 		 88 aa  111  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0545  50S ribosomal protein L27  62.07 
 
 		 88 aa  111  4.0000000000000004e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13991  50S ribosomal protein L27  70 
 
 		 88 aa  111  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.228123 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2651  50S ribosomal protein L27  69.41 
 
 		 86 aa  110  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0231869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3456  50S ribosomal protein L27  69.05 
 
 		 85 aa  110  7.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0916  50S ribosomal protein L27  71.43 
 
 		 90 aa  110  7.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17721  50S ribosomal protein L27  71.43 
 
 		 90 aa  110  7.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.106255  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1623  50S ribosomal protein L27  67.44 
 
 		 85 aa  110  9e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.723727  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3465  50S ribosomal protein L27  72.86 
 
 		 94 aa  110  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.360708 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2282  ribosomal protein L27  69.05 
 
 		 84 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.277784  hitchhiker  0.000388636 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7271  50S ribosomal protein L27  67.06 
 
 		 85 aa  109  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.956462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1651  ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 84 aa  108  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000313884 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1120  50S ribosomal protein L27  67.82 
 
 		 87 aa  108  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.645406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2060  ribosomal protein L27  65.88 
 
 		 87 aa  107  4.0000000000000004e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1589  ribosomal protein L27  66.28 
 
 		 85 aa  107  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00579219  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12468  50S ribosomal protein L27  71.79 
 
 		 86 aa  107  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.141175  normal  0.856367 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0647  50S ribosomal protein L27  68.92 
 
 		 89 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.908873 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11410  LSU ribosomal protein L27P  66.67 
 
 		 85 aa  107  6e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.624774  hitchhiker  0.0010423 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1443  50S ribosomal protein L27  62.82 
 
 		 86 aa  107  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15311  50S ribosomal protein L27  62.82 
 
 		 86 aa  107  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.854601  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1504  ribosomal protein L27  67.06 
 
 		 94 aa  107  8.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00591698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0510  50S ribosomal protein L27  68.97 
 
 		 87 aa  105  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0309377  normal  0.755964 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3259  50S ribosomal protein L27  68.97 
 
 		 87 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3489  50S ribosomal protein L27  68.97 
 
 		 87 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.562103  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2522  50S ribosomal protein L27  68.97 
 
 		 87 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.587643  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3523  50S ribosomal protein L27  68.97 
 
 		 87 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.122565  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3667  50S ribosomal protein L27  68.97 
 
 		 87 aa  105  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000345306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1304  50S ribosomal protein L27  68.97 
 
 		 87 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3525  50S ribosomal protein L27  68.97 
 
 		 87 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.986116  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0552  50S ribosomal protein L27  68.97 
 
 		 87 aa  105  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000367957  normal  0.045539 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1141  50S ribosomal protein L27  68.97 
 
 		 87 aa  106  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0445  50S ribosomal protein L27  68.97 
 
 		 87 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0100  50S ribosomal protein L27  68.97 
 
 		 87 aa  105  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00352754  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0485  50S ribosomal protein L27  68.97 
 
 		 87 aa  105  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0162621  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0582  50S ribosomal protein L27  68.97 
 
 		 87 aa  105  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00040366  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3450  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 84 aa  106  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.136953  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7270  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410235  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2801  50S ribosomal protein L27  68.97 
 
 		 87 aa  105  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000884705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0454  50S ribosomal protein L27  72.22 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15061  50S ribosomal protein L27  62.82 
 
 		 86 aa  105  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.610968  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2259  ribosomal protein L27  65.88 
 
 		 86 aa  105  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.583782  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2390  50S ribosomal protein L27  65.43 
 
 		 87 aa  105  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0854372  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2144  50S ribosomal protein L27  65.43 
 
 		 87 aa  105  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.67084e-17 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5479  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 84 aa  104  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0840601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1221  50S ribosomal protein L27  75.36 
 
 		 88 aa  104  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.393173 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1112  ribosomal protein L27  60.47 
 
 		 86 aa  105  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.55245  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3196  50S ribosomal protein L27  70.42 
 
 		 85 aa  104  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000840306  unclonable  7.875010000000001e-24 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3379  ribosomal protein L27  63.53 
 
 		 86 aa  104  5e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3471  50S ribosomal protein L27  69.41 
 
 		 87 aa  104  5e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00282639  normal  0.386116 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2821  50S ribosomal protein L27  67.06 
 
 		 86 aa  103  7e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000571878  normal  0.308516 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1515  50S ribosomal protein L27  70.27 
 
 		 93 aa  103  7e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0090282  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0700  50S ribosomal protein L27  60.49 
 
 		 83 aa  103  8e-22  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.987628  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3235  50S ribosomal protein L27  69.01 
 
 		 85 aa  103  8e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000158281  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0838  50S ribosomal protein L27  67.06 
 
 		 85 aa  103  8e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.34705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05534  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 		 86 aa  103  8e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000340822  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1548  ribosomal protein L27  63.53 
 
 		 85 aa  103  9e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104993  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15461  50S ribosomal protein L27  62.82 
 
 		 86 aa  102  1e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.120914  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2665  ribosomal protein L27  58.82 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.344366 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2656  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 		 86 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0134308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2046  ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3066  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 		 86 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1524  50S ribosomal protein L27  65.43 
 
 		 86 aa  103  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.846788  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0750  ribosomal protein L27  69.57 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000003902  hitchhiker  0.00471075 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2181  50S ribosomal protein L27  61.36 
 
 		 88 aa  102  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.188028  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2115  50S ribosomal protein L27  69.01 
 
 		 95 aa  102  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000381623  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0771  50S ribosomal protein L27  67.06 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0842  50S ribosomal protein L27  67.06 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.987021  normal  0.6635 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14110  ribosomal protein L27  57.65 
 
 		 92 aa  101  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000254683  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12510  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 85 aa  101  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.768162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18260  LSU ribosomal protein L27P  65.43 
 
 		 84 aa  101  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0740446  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4102  50S ribosomal protein L27  70.27 
 
 		 90 aa  101  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.500877 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2247  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 85 aa  101  4e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000000479005  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1451  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 87 aa  101  4e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000000109711  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0162  50S ribosomal protein L27  67.61 
 
 		 92 aa  101  4e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000470304  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3681  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 		 85 aa  101  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40780  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 		 85 aa  101  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0213  50S ribosomal protein L27  71.01 
 
 		 86 aa  100  5e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.280528 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3589  50S ribosomal protein L27  70.42 
 
 		 84 aa  100  5e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000197888  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0559  50S ribosomal protein L27  70.42 
 
 		 90 aa  100  5e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3418  50S ribosomal protein L27  63.22 
 
 		 88 aa  100  5e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>