More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0110 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0110  50S ribosomal protein L27  100 
 
 
87 aa  172  9.999999999999999e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000081142  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0764  50S ribosomal protein L27  70.59 
 
 
85 aa  122  1e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000191049  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0269  50S ribosomal protein L27  70.59 
 
 
85 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.876975  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0424  50S ribosomal protein L27  65.52 
 
 
92 aa  114  5e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.85685  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2854  50S ribosomal protein L27  69.77 
 
 
86 aa  114  6e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000234792  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0497  50S ribosomal protein L27  64.77 
 
 
90 aa  114  6e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000367607  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1009  50S ribosomal protein L27  70.73 
 
 
85 aa  113  8.999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000911893  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0474  50S ribosomal protein L27  71.08 
 
 
85 aa  113  8.999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000537628  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3975  50S ribosomal protein L27  72.29 
 
 
85 aa  113  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000219143  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3756  50S ribosomal protein L27  72.29 
 
 
85 aa  113  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000137777  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3611  50S ribosomal protein L27  72.29 
 
 
85 aa  113  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000711047  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0213  50S ribosomal protein L27  69.05 
 
 
86 aa  112  1.0000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.280528 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1682  50S ribosomal protein L27  64.77 
 
 
90 aa  112  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00000249957  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2703  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 
92 aa  112  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2575  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 
92 aa  112  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0865  50S ribosomal protein L27  64.37 
 
 
87 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.437144  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0955  50S ribosomal protein L27  71.08 
 
 
84 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.455715  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00801  50S ribosomal protein L27  71.08 
 
 
85 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0508  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 
87 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.868007  normal  0.531544 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2651  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 
86 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0231869  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0870  50S ribosomal protein L27  71.08 
 
 
84 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000545576  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3359  ribosomal protein L27  73.17 
 
 
85 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000421163  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001672  LSU ribosomal protein L27p  71.08 
 
 
85 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000226464  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3471  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 
87 aa  111  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00282639  normal  0.386116 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0195  50S ribosomal protein L27  69.05 
 
 
86 aa  111  3e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000826463  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1112  ribosomal protein L27  65.12 
 
 
86 aa  111  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.55245  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3448  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 
87 aa  111  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0232252  hitchhiker  0.00744788 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2218  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 
85 aa  110  4.0000000000000004e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000800329  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3322  50S ribosomal protein L27  69.05 
 
 
84 aa  110  5e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000182867  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0853  50S ribosomal protein L27  69.88 
 
 
84 aa  110  5e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152445  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1037  50S ribosomal protein L27  69.05 
 
 
84 aa  110  5e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000911721  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3242  50S ribosomal protein L27  62.5 
 
 
95 aa  110  5e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0968  50S ribosomal protein L27  69.05 
 
 
84 aa  110  5e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000160226  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2828  50S ribosomal protein L27  71.08 
 
 
84 aa  110  5e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000113295  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1070  50S ribosomal protein L27  69.05 
 
 
84 aa  110  5e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000153229  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3651  50S ribosomal protein L27  69.88 
 
 
84 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3207  ribosomal protein L27  64.71 
 
 
85 aa  110  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2926  50S ribosomal protein L27  69.88 
 
 
84 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000309766  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0980  50S ribosomal protein L27  69.88 
 
 
84 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000110997  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0362  50S ribosomal protein L27  69.88 
 
 
85 aa  110  7.000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000249852  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3218  50S ribosomal protein L27  69.88 
 
 
84 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270517  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1816  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 
85 aa  110  8.000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0896  50S ribosomal protein L27  69.88 
 
 
84 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000837185  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3124  50S ribosomal protein L27  69.88 
 
 
84 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000107863  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1632  50S ribosomal protein L27  63.22 
 
 
87 aa  110  9e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.848306  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0552  50S ribosomal protein L27  62.07 
 
 
87 aa  110  9e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000367957  normal  0.045539 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3667  50S ribosomal protein L27  62.07 
 
 
87 aa  110  9e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000345306  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0100  50S ribosomal protein L27  62.07 
 
 
87 aa  110  9e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00352754  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0485  50S ribosomal protein L27  62.07 
 
 
87 aa  110  9e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0162621  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0510  50S ribosomal protein L27  62.07 
 
 
87 aa  110  9e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0309377  normal  0.755964 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0582  50S ribosomal protein L27  62.07 
 
 
87 aa  110  9e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00040366  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03050  50S ribosomal protein L27  69.88 
 
 
85 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00726587  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0522  ribosomal protein L27  69.88 
 
 
85 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000023922  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1051  50S ribosomal protein L27  61.36 
 
 
89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212456  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3235  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 
85 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000158281  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3670  50S ribosomal protein L27  69.88 
 
 
85 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000967389  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3489  50S ribosomal protein L27  62.07 
 
 
87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.562103  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2522  50S ribosomal protein L27  62.07 
 
 
87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.587643  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3585  50S ribosomal protein L27  69.88 
 
 
85 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000250774  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3259  50S ribosomal protein L27  62.07 
 
 
87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2957  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 
86 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668202  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03001  hypothetical protein  69.88 
 
 
85 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0066535  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3523  50S ribosomal protein L27  62.07 
 
 
87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.122565  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3481  50S ribosomal protein L27  69.88 
 
 
85 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000491459  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3465  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 
94 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.360708 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3525  50S ribosomal protein L27  62.07 
 
 
87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.986116  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4507  50S ribosomal protein L27  69.88 
 
 
85 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000060246  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1141  50S ribosomal protein L27  62.07 
 
 
87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0445  50S ribosomal protein L27  62.07 
 
 
87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0515  50S ribosomal protein L27  69.88 
 
 
85 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000794781  normal  0.0169565 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1005  50S ribosomal protein L27  69.88 
 
 
84 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000876711  decreased coverage  0.00000356458 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3105  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 
86 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0643  50S ribosomal protein L27  69.14 
 
 
84 aa  109  1.0000000000000001e-23  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.301948  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1304  50S ribosomal protein L27  62.07 
 
 
87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0794  50S ribosomal protein L27  68.29 
 
 
85 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000203934  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3460  50S ribosomal protein L27  61.36 
 
 
89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159862  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3640  50S ribosomal protein L27  60.92 
 
 
88 aa  110  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.320466  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3378  50S ribosomal protein L27  69.88 
 
 
85 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.4045e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2247  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 
85 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000000479005  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2821  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 
86 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000571878  normal  0.308516 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3478  ribosomal protein L27  69.51 
 
 
85 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000653762  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0426  50S ribosomal protein L27  57.47 
 
 
89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449955  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2582  50S ribosomal protein L27  68.92 
 
 
84 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.6027199999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2801  50S ribosomal protein L27  62.07 
 
 
87 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000884705  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2656  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 
86 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0134308  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0512  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 
85 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0535164 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5207  50S ribosomal protein L27  68.29 
 
 
85 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.121929  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3066  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 
86 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447038  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0559  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 
85 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00191418  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0246  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 
85 aa  108  2.0000000000000002e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000945082  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3088  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 
84 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60450  50S ribosomal protein L27  68.29 
 
 
85 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0112062 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3196  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 
85 aa  108  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000840306  unclonable  7.875010000000001e-24 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0238  ribosomal protein L27  60.47 
 
 
87 aa  108  3e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0475  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 
85 aa  108  3e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0828621  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3674  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 
85 aa  108  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.99139  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2006  ribosomal protein L27  62.79 
 
 
86 aa  108  3e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.962508  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1849  50S ribosomal protein L27  61.36 
 
 
89 aa  107  4.0000000000000004e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1781  50S ribosomal protein L27  61.36 
 
 
89 aa  107  4.0000000000000004e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.810643  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3345  50S ribosomal protein L27  65.12 
 
 
87 aa  107  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>