More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1466 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1466  50S ribosomal protein L27  100 
 
 		 86 aa  171  1.9999999999999998e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.55318  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1546  50S ribosomal protein L27  81.4 
 
 		 86 aa  149  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.653067  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02725  50S ribosomal protein L27  81.4 
 
 		 86 aa  149  2e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0454  50S ribosomal protein L27  78.57 
 
 		 89 aa  135  2e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1625  ribosomal protein L27  74.7 
 
 		 143 aa  127  7.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.388698 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2480  ribosomal protein L27  72.29 
 
 		 100 aa  124  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.782187  normal  0.22295 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4883  ribosomal protein L27  71.43 
 
 		 92 aa  123  7e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.113157  normal  0.111687 
 
 
-
 
NC_002950  PG0315  50S ribosomal protein L27  69.14 
 
 		 85 aa  115  1.9999999999999998e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.385897 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0310  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 		 89 aa  110  7.000000000000001e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0108  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 87 aa  110  7.000000000000001e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2046  ribosomal protein L27  62.79 
 
 		 90 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0475  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 		 85 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0828621  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1611  50S ribosomal protein L27  66.28 
 
 		 97 aa  109  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000833239  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1515  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 		 93 aa  107  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0090282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0865  50S ribosomal protein L27  65.52 
 
 		 87 aa  107  6e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.437144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4496  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 85 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.191975  normal  0.508112 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2006  ribosomal protein L27  65.12 
 
 		 86 aa  105  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.962508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2143  50S ribosomal protein L27  59.3 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.672881 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40780  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3242  50S ribosomal protein L27  60.71 
 
 		 95 aa  105  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0856  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 86 aa  105  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.701213  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4102  50S ribosomal protein L27  59.04 
 
 		 90 aa  105  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.500877 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0269  50S ribosomal protein L27  62.35 
 
 		 85 aa  103  6e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.876975  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3235  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 		 85 aa  103  7e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000158281  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1849  50S ribosomal protein L27  59.52 
 
 		 89 aa  103  8e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1781  50S ribosomal protein L27  59.52 
 
 		 89 aa  103  8e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.810643  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5207  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 85 aa  103  9e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.121929  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60450  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 85 aa  103  9e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0112062 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0841  ribosomal protein L27  63.86 
 
 		 84 aa  103  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.82493e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0798  ribosomal protein L27  59.52 
 
 		 91 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3465  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 94 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.360708 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0702  50S ribosomal protein L27  59.52 
 
 		 91 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.616074 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1051  50S ribosomal protein L27  59.52 
 
 		 89 aa  102  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212456  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4287  50S ribosomal protein L27  62.65 
 
 		 90 aa  102  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.835773  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1201  50S ribosomal protein L27  61.45 
 
 		 89 aa  102  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.862516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0846  50S ribosomal protein L27  63.95 
 
 		 86 aa  102  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1112  ribosomal protein L27  56.98 
 
 		 86 aa  103  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.55245  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0689  50S ribosomal protein L27  62.65 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0510  50S ribosomal protein L27  63.22 
 
 		 87 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0309377  normal  0.755964 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0721  50S ribosomal protein L27  62.65 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.980566  normal  0.0233999 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0440  50S ribosomal protein L27  59.52 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.944777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4859  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2227  50S ribosomal protein L27  60.47 
 
 		 91 aa  102  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00813215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3667  50S ribosomal protein L27  63.22 
 
 		 87 aa  102  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000345306  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0750  ribosomal protein L27  59.52 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000003902  hitchhiker  0.00471075 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1009  50S ribosomal protein L27  62.65 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000911893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0152  50S ribosomal protein L27  59.52 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.670785  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0552  50S ribosomal protein L27  63.22 
 
 		 87 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000367957  normal  0.045539 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2854  50S ribosomal protein L27  65.12 
 
 		 86 aa  102  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000234792  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0100  50S ribosomal protein L27  63.22 
 
 		 87 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00352754  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0526  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3460  50S ribosomal protein L27  60.71 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159862  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0721  50S ribosomal protein L27  62.65 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.71975 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0485  50S ribosomal protein L27  63.22 
 
 		 87 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0162621  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0582  50S ribosomal protein L27  63.22 
 
 		 87 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00040366  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1461  50S ribosomal protein L27  58.33 
 
 		 89 aa  101  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0317862 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0497  50S ribosomal protein L27  60.47 
 
 		 90 aa  101  3e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000367607  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0588  50S ribosomal protein L27  55.81 
 
 		 90 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2801  50S ribosomal protein L27  63.22 
 
 		 87 aa  101  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000884705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3196  50S ribosomal protein L27  62.65 
 
 		 85 aa  101  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000840306  unclonable  7.875010000000001e-24 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3207  ribosomal protein L27  63.86 
 
 		 85 aa  101  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1725  50S ribosomal protein L27  62.65 
 
 		 85 aa  101  4e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0515  50S ribosomal protein L27  59.52 
 
 		 90 aa  101  4e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1223  ribosomal protein L27  64.47 
 
 		 83 aa  101  4e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000141785 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0417  50S ribosomal protein L27  59.3 
 
 		 91 aa  100  5e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.302693 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1482  50S ribosomal protein L27  59.3 
 
 		 93 aa  100  5e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0184  50S ribosomal protein L27  62.65 
 
 		 84 aa  100  5e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2785  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 89 aa  100  5e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0242571  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0424  50S ribosomal protein L27  57.83 
 
 		 92 aa  100  6e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.85685  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3006  50S ribosomal protein L27  62.65 
 
 		 89 aa  100  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.549132 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3820  50S ribosomal protein L27  56.63 
 
 		 89 aa  100  6e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360985  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3512  50S ribosomal protein L27  56.63 
 
 		 89 aa  100  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2828  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 		 84 aa  100  6e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000113295  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1682  50S ribosomal protein L27  60.47 
 
 		 90 aa  100  7e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00000249957  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3870  50S ribosomal protein L27  60.24 
 
 		 89 aa  100  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.403314  normal  0.0137956 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4194  50S ribosomal protein L27  60.24 
 
 		 89 aa  100  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2651  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 86 aa  100  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0231869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3322  50S ribosomal protein L27  64.63 
 
 		 84 aa  100  8e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000182867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0968  50S ribosomal protein L27  64.63 
 
 		 84 aa  100  8e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000160226  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1070  50S ribosomal protein L27  64.63 
 
 		 84 aa  100  8e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000153229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1037  50S ribosomal protein L27  64.63 
 
 		 84 aa  100  8e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000911721  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3651  50S ribosomal protein L27  64.63 
 
 		 84 aa  100  9e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1572  50S ribosomal protein L27  63.41 
 
 		 85 aa  100  9e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.355414  normal  0.759943 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0980  50S ribosomal protein L27  64.63 
 
 		 84 aa  100  9e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000110997  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1754  50S ribosomal protein L27  63.41 
 
 		 85 aa  100  9e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.163114  normal  0.0575884 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3218  50S ribosomal protein L27  64.63 
 
 		 84 aa  100  9e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3681  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 		 85 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0130  50S ribosomal protein L27  61.45 
 
 		 84 aa  99.4  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0090  50S ribosomal protein L27  61.45 
 
 		 84 aa  99.4  1e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0327893  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0853  50S ribosomal protein L27  64.63 
 
 		 84 aa  99.4  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152445  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3621  50S ribosomal protein L27  60.24 
 
 		 85 aa  99.8  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000351057  normal  0.260967 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001672  LSU ribosomal protein L27p  65.85 
 
 		 85 aa  99.8  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000226464  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0099  50S ribosomal protein L27  61.45 
 
 		 84 aa  99.4  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0247  50S ribosomal protein L27  57.14 
 
 		 89 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0154  50S ribosomal protein L27  57.14 
 
 		 90 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03730  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 		 85 aa  99.8  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00000322672  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1005  50S ribosomal protein L27  63.41 
 
 		 84 aa  99.4  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000876711  decreased coverage  0.00000356458 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00801  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 		 85 aa  99.8  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0896  50S ribosomal protein L27  63.41 
 
 		 84 aa  99.8  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000837185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3124  50S ribosomal protein L27  63.41 
 
 		 84 aa  99.8  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000107863  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>