More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0841 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_0841  ribosomal protein L27  100 
 
 
84 aa  166  7e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.82493e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0284  50S ribosomal protein L27  69.05 
 
 
86 aa  114  3e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.349085  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0461  50S ribosomal protein L27  69.05 
 
 
86 aa  114  3e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00297252 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0798  ribosomal protein L27  62.35 
 
 
91 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0702  50S ribosomal protein L27  62.35 
 
 
91 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.616074 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1241  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 
85 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.572861  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5207  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 
85 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.121929  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60450  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 
85 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0112062 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4237  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 
85 aa  112  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000765087  hitchhiker  0.00000018706 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2651  50S ribosomal protein L27  70.13 
 
 
86 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0231869  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3737  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 
85 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000346028  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3621  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 
85 aa  112  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000351057  normal  0.260967 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1781  50S ribosomal protein L27  65.43 
 
 
89 aa  111  3e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.810643  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3282  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 
91 aa  111  3e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0455195 
 
 
-
 
NC_004310  BR1849  50S ribosomal protein L27  65.43 
 
 
89 aa  111  3e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1051  50S ribosomal protein L27  65.43 
 
 
89 aa  111  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212456  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001672  LSU ribosomal protein L27p  64.71 
 
 
85 aa  111  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000226464  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00801  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 
85 aa  111  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2042  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 
89 aa  111  3e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.20995 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4194  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 
89 aa  111  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3870  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 
89 aa  111  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.403314  normal  0.0137956 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4859  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 
85 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0930  50S ribosomal protein L27  62.96 
 
 
89 aa  110  4.0000000000000004e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3564  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 
85 aa  110  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00211833  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40780  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 
85 aa  110  6e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3662  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 
85 aa  110  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.0000324123  normal  0.0701159 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3495  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 
85 aa  110  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000222447  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3600  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 
85 aa  110  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00592088  normal  0.834432 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1201  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 
89 aa  110  6e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.862516  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3493  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 
85 aa  110  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000310399  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0510  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 
87 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0309377  normal  0.755964 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3667  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 
87 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000345306  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0100  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 
87 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00352754  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0485  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 
87 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0162621  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0582  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 
87 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00040366  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0552  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 
87 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000367957  normal  0.045539 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2522  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 
87 aa  110  9e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.587643  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3523  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 
87 aa  110  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.122565  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0445  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 
87 aa  110  9e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3525  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 
87 aa  110  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.986116  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1141  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 
87 aa  110  9e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3259  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 
87 aa  110  9e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3489  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 
87 aa  110  9e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.562103  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1304  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 
87 aa  110  9e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0865  50S ribosomal protein L27  72.86 
 
 
87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.437144  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3478  ribosomal protein L27  63.53 
 
 
85 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000653762  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03730  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 
85 aa  109  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00000322672  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0246  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 
85 aa  109  1.0000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000945082  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4287  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 
90 aa  109  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.835773  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2801  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 
87 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000884705  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0362  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 
85 aa  109  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000249852  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0310  50S ribosomal protein L27  61.45 
 
 
89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1482  50S ribosomal protein L27  63.41 
 
 
93 aa  108  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1632  50S ribosomal protein L27  62.35 
 
 
87 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.848306  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0526  50S ribosomal protein L27  65.52 
 
 
85 aa  108  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3359  ribosomal protein L27  61.18 
 
 
85 aa  108  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000421163  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2854  50S ribosomal protein L27  71.43 
 
 
86 aa  108  3e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000234792  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2046  ribosomal protein L27  66.67 
 
 
90 aa  108  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3006  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 
89 aa  108  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.549132 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0856  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 
86 aa  108  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.701213  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03050  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 
85 aa  107  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00726587  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0522  ribosomal protein L27  63.53 
 
 
85 aa  107  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000023922  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3681  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 
85 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0689  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 
85 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3670  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 
85 aa  107  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000967389  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0417  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 
91 aa  107  4.0000000000000004e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.302693 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3481  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 
85 aa  107  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000491459  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0721  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 
85 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.71975 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3378  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 
85 aa  107  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.4045e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3207  ribosomal protein L27  65.06 
 
 
85 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4496  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 
85 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.191975  normal  0.508112 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2926  50S ribosomal protein L27  71.83 
 
 
84 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000309766  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03001  hypothetical protein  63.53 
 
 
85 aa  107  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0066535  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0892  50S ribosomal protein L27  64.63 
 
 
85 aa  107  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0670599 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3585  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 
85 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000250774  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4507  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 
85 aa  107  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000060246  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0515  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 
85 aa  107  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000794781  normal  0.0169565 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0721  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 
85 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.980566  normal  0.0233999 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3322  50S ribosomal protein L27  71.83 
 
 
84 aa  107  5e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000182867  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3651  50S ribosomal protein L27  71.83 
 
 
84 aa  107  5e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0870  50S ribosomal protein L27  71.83 
 
 
84 aa  107  5e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000545576  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1037  50S ribosomal protein L27  71.83 
 
 
84 aa  107  5e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000911721  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0968  50S ribosomal protein L27  71.83 
 
 
84 aa  107  5e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000160226  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3892  50S ribosomal protein L27  62.96 
 
 
89 aa  107  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.624543  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0980  50S ribosomal protein L27  71.83 
 
 
84 aa  107  5e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000110997  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0955  50S ribosomal protein L27  71.83 
 
 
84 aa  107  5e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.455715  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3218  50S ribosomal protein L27  71.83 
 
 
84 aa  107  5e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270517  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1070  50S ribosomal protein L27  71.83 
 
 
84 aa  107  5e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000153229  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3088  50S ribosomal protein L27  71.83 
 
 
84 aa  107  6e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2828  50S ribosomal protein L27  71.83 
 
 
84 aa  107  6e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000113295  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0853  50S ribosomal protein L27  71.83 
 
 
84 aa  107  6e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152445  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0896  50S ribosomal protein L27  70.42 
 
 
84 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000837185  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3124  50S ribosomal protein L27  70.42 
 
 
84 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000107863  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3611  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 
85 aa  106  9.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000711047  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3975  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 
85 aa  106  9.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000219143  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3756  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 
85 aa  106  9.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000137777  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1005  50S ribosomal protein L27  70.42 
 
 
84 aa  106  9.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000876711  decreased coverage  0.00000356458 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3471  50S ribosomal protein L27  58.33 
 
 
87 aa  106  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00282639  normal  0.386116 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3448  50S ribosomal protein L27  67.53 
 
 
87 aa  106  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0232252  hitchhiker  0.00744788 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1108  ribosomal protein L27  61.9 
 
 
84 aa  106  1e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000226179  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>