More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1546 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1546  50S ribosomal protein L27  100 
 
 		 86 aa  172  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.653067  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02725  50S ribosomal protein L27  86.05 
 
 		 86 aa  154  4e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1466  50S ribosomal protein L27  81.4 
 
 		 86 aa  149  1e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.55318  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0454  50S ribosomal protein L27  73.49 
 
 		 89 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2480  ribosomal protein L27  74.7 
 
 		 100 aa  128  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.782187  normal  0.22295 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4883  ribosomal protein L27  73.81 
 
 		 92 aa  124  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.113157  normal  0.111687 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1625  ribosomal protein L27  72.29 
 
 		 143 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.388698 
 
 
-
 
NC_002950  PG0315  50S ribosomal protein L27  74.07 
 
 		 85 aa  122  2e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.385897 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0310  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 		 89 aa  114  5e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0417  50S ribosomal protein L27  62.79 
 
 		 91 aa  109  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.302693 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3460  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159862  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2143  50S ribosomal protein L27  60.47 
 
 		 90 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.672881 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0108  50S ribosomal protein L27  61.45 
 
 		 87 aa  108  2.0000000000000002e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3006  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 		 89 aa  107  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.549132 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2046  ribosomal protein L27  64.2 
 
 		 90 aa  107  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1849  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 89 aa  107  5e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1781  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 89 aa  107  5e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.810643  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40780  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 		 85 aa  105  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1051  50S ribosomal protein L27  60.71 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212456  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1201  50S ribosomal protein L27  60.24 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.862516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1611  50S ribosomal protein L27  61.63 
 
 		 97 aa  105  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000833239  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4194  50S ribosomal protein L27  60.24 
 
 		 89 aa  104  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3870  50S ribosomal protein L27  60.24 
 
 		 89 aa  104  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.403314  normal  0.0137956 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4102  50S ribosomal protein L27  57.83 
 
 		 90 aa  104  5e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.500877 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0475  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 		 85 aa  103  6e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0828621  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2651  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 86 aa  103  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0231869  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0798  ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 91 aa  103  7e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0702  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 91 aa  103  7e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.616074 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1009  50S ribosomal protein L27  62.65 
 
 		 85 aa  103  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000911893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3512  50S ribosomal protein L27  56.63 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3820  50S ribosomal protein L27  56.63 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360985  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0643  50S ribosomal protein L27  61.45 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.301948  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1515  50S ribosomal protein L27  60.24 
 
 		 93 aa  101  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0090282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2785  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 89 aa  101  4e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0242571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0856  50S ribosomal protein L27  60.71 
 
 		 86 aa  101  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.701213  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4496  50S ribosomal protein L27  60.71 
 
 		 85 aa  100  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.191975  normal  0.508112 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5207  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 85 aa  100  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.121929  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60450  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 85 aa  100  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0112062 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0841  ribosomal protein L27  59.04 
 
 		 84 aa  100  5e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.82493e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0865  50S ribosomal protein L27  59.77 
 
 		 87 aa  100  6e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.437144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3667  50S ribosomal protein L27  63.22 
 
 		 87 aa  100  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000345306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0510  50S ribosomal protein L27  63.22 
 
 		 87 aa  100  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0309377  normal  0.755964 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1632  50S ribosomal protein L27  62.79 
 
 		 87 aa  100  6e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.848306  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0552  50S ribosomal protein L27  63.22 
 
 		 87 aa  100  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000367957  normal  0.045539 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0100  50S ribosomal protein L27  63.22 
 
 		 87 aa  100  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00352754  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0485  50S ribosomal protein L27  63.22 
 
 		 87 aa  100  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0162621  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0582  50S ribosomal protein L27  63.22 
 
 		 87 aa  100  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00040366  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4724  50S ribosomal protein L27  56.98 
 
 		 88 aa  100  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0668122  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2801  50S ribosomal protein L27  63.22 
 
 		 87 aa  100  8e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000884705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1415  50S ribosomal protein L27  59.04 
 
 		 85 aa  100  8e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0588  50S ribosomal protein L27  54.65 
 
 		 90 aa  100  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3681  50S ribosomal protein L27  61.45 
 
 		 85 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1482  50S ribosomal protein L27  56.1 
 
 		 93 aa  99.4  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0424  50S ribosomal protein L27  56.63 
 
 		 92 aa  99.4  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.85685  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0193  50S ribosomal protein L27  59.26 
 
 		 90 aa  99.4  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.451706 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3800  50S ribosomal protein L27  55.42 
 
 		 89 aa  99.8  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0152  50S ribosomal protein L27  55.95 
 
 		 90 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.670785  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1461  50S ribosomal protein L27  56.63 
 
 		 89 aa  99.8  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0317862 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3242  50S ribosomal protein L27  58.33 
 
 		 95 aa  99.4  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4287  50S ribosomal protein L27  55.81 
 
 		 90 aa  99.8  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.835773  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0526  50S ribosomal protein L27  60.24 
 
 		 85 aa  99.8  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3465  50S ribosomal protein L27  59.04 
 
 		 94 aa  99  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.360708 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0284  50S ribosomal protein L27  68.06 
 
 		 86 aa  98.6  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.349085  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3448  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 87 aa  99  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0232252  hitchhiker  0.00744788 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1112  ribosomal protein L27  54.65 
 
 		 86 aa  99  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.55245  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0461  50S ribosomal protein L27  68.06 
 
 		 86 aa  98.6  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00297252 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0269  50S ribosomal protein L27  59.52 
 
 		 85 aa  99  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.876975  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0750  ribosomal protein L27  58.33 
 
 		 90 aa  98.6  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000003902  hitchhiker  0.00471075 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3235  50S ribosomal protein L27  57.83 
 
 		 85 aa  98.2  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000158281  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2522  50S ribosomal protein L27  62.07 
 
 		 87 aa  98.2  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.587643  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4211  50S ribosomal protein L27  57.83 
 
 		 93 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.121619 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3523  50S ribosomal protein L27  62.07 
 
 		 87 aa  98.2  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.122565  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3196  50S ribosomal protein L27  59.04 
 
 		 85 aa  98.2  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000840306  unclonable  7.875010000000001e-24 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3525  50S ribosomal protein L27  62.07 
 
 		 87 aa  98.2  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.986116  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1141  50S ribosomal protein L27  62.07 
 
 		 87 aa  98.2  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0247  50S ribosomal protein L27  54.76 
 
 		 89 aa  98.6  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0445  50S ribosomal protein L27  62.07 
 
 		 87 aa  98.2  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0154  50S ribosomal protein L27  54.76 
 
 		 90 aa  98.6  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3489  50S ribosomal protein L27  62.07 
 
 		 87 aa  98.2  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.562103  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0508  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 87 aa  98.2  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.868007  normal  0.531544 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3259  50S ribosomal protein L27  62.07 
 
 		 87 aa  98.2  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1304  50S ribosomal protein L27  62.07 
 
 		 87 aa  98.2  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2006  ribosomal protein L27  59.52 
 
 		 86 aa  97.8  4e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.962508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4413  50S ribosomal protein L27  55.95 
 
 		 88 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4876  50S ribosomal protein L27  55.95 
 
 		 88 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.387156 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0689  50S ribosomal protein L27  60.24 
 
 		 85 aa  97.4  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0721  50S ribosomal protein L27  60.24 
 
 		 85 aa  97.4  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.980566  normal  0.0233999 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0721  50S ribosomal protein L27  60.24 
 
 		 85 aa  97.4  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.71975 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4921  50S ribosomal protein L27  55.95 
 
 		 88 aa  97.8  5e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0271507  normal  0.71556 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0515  50S ribosomal protein L27  54.76 
 
 		 90 aa  97.8  5e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3207  ribosomal protein L27  59.04 
 
 		 85 aa  97.4  5e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2237  ribosomal protein L27  55.81 
 
 		 91 aa  97.1  6e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0107  50S ribosomal protein L27  55.95 
 
 		 88 aa  96.7  9e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.176189 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3282  50S ribosomal protein L27  58.54 
 
 		 91 aa  96.7  9e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0455195 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2854  50S ribosomal protein L27  62.2 
 
 		 86 aa  96.7  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000234792  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1223  ribosomal protein L27  61.84 
 
 		 83 aa  96.3  1e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000141785 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00801  50S ribosomal protein L27  62.2 
 
 		 85 aa  96.7  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001672  LSU ribosomal protein L27p  62.2 
 
 		 85 aa  96.7  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000226464  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3088  50S ribosomal protein L27  60.98 
 
 		 84 aa  96.3  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0232  50S ribosomal protein L27  55.95 
 
 		 89 aa  96.7  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>