More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1625 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1625  ribosomal protein L27  100 
 
 		 143 aa  276  8e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.388698 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0454  50S ribosomal protein L27  76.47 
 
 		 89 aa  144  4.0000000000000006e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4883  ribosomal protein L27  74.42 
 
 		 92 aa  139  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.113157  normal  0.111687 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2480  ribosomal protein L27  72.94 
 
 		 100 aa  137  4.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.782187  normal  0.22295 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0310  50S ribosomal protein L27  69.77 
 
 		 89 aa  132  9.999999999999999e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1466  50S ribosomal protein L27  74.7 
 
 		 86 aa  130  3.9999999999999996e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.55318  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0108  50S ribosomal protein L27  72.62 
 
 		 87 aa  129  1.0000000000000001e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1546  50S ribosomal protein L27  72.29 
 
 		 86 aa  126  8.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.653067  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02725  50S ribosomal protein L27  73.49 
 
 		 86 aa  126  1.0000000000000001e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0315  50S ribosomal protein L27  69.14 
 
 		 85 aa  125  2.0000000000000002e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.385897 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2143  50S ribosomal protein L27  67.06 
 
 		 90 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.672881 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3006  50S ribosomal protein L27  67.06 
 
 		 89 aa  122  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.549132 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1201  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 		 89 aa  121  3e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.862516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4102  50S ribosomal protein L27  62.79 
 
 		 90 aa  121  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.500877 
 
 
-
 
NC_004310  BR1849  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 		 89 aa  120  8e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1781  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 		 89 aa  120  8e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.810643  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0417  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 91 aa  119  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.302693 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0475  50S ribosomal protein L27  69.41 
 
 		 85 aa  119  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0828621  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3800  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 		 89 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3870  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 		 89 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.403314  normal  0.0137956 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4194  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 		 89 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0424  50S ribosomal protein L27  62.22 
 
 		 92 aa  118  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.85685  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1051  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 		 89 aa  118  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212456  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3207  ribosomal protein L27  67.06 
 
 		 85 aa  117  6e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3460  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 		 89 aa  117  6e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159862  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1515  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 		 93 aa  117  7e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0090282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2046  ribosomal protein L27  64.2 
 
 		 90 aa  116  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4211  50S ribosomal protein L27  57.84 
 
 		 93 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.121619 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2785  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0242571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4287  50S ribosomal protein L27  61.45 
 
 		 90 aa  115  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.835773  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3820  50S ribosomal protein L27  60 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360985  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3512  50S ribosomal protein L27  60 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40780  50S ribosomal protein L27  68.24 
 
 		 85 aa  114  3.9999999999999997e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2006  ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 86 aa  114  5e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.962508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0485  50S ribosomal protein L27  69.44 
 
 		 87 aa  114  6e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.229022  normal  0.0825407 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3242  50S ribosomal protein L27  62.35 
 
 		 95 aa  113  8.999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0892  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 		 85 aa  112  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0670599 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0440  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 		 90 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.944777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3282  50S ribosomal protein L27  64.63 
 
 		 91 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0455195 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0152  50S ribosomal protein L27  61.63 
 
 		 90 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.670785  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1461  50S ribosomal protein L27  62.35 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0317862 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0193  50S ribosomal protein L27  61.73 
 
 		 90 aa  112  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.451706 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5207  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 		 85 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.121929  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60450  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 		 85 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0112062 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3448  50S ribosomal protein L27  65.52 
 
 		 87 aa  111  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0232252  hitchhiker  0.00744788 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1120  50S ribosomal protein L27  67.06 
 
 		 87 aa  111  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.645406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0154  50S ribosomal protein L27  60.67 
 
 		 90 aa  111  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0846  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 		 86 aa  111  3e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0238  ribosomal protein L27  68.06 
 
 		 87 aa  111  4.0000000000000004e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0700  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 		 83 aa  110  5e-24  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.987628  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3465  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 94 aa  110  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.360708 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2281  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 89 aa  110  5e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.350544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2651  50S ribosomal protein L27  63.95 
 
 		 86 aa  110  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0231869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0508  50S ribosomal protein L27  64.37 
 
 		 87 aa  110  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.868007  normal  0.531544 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1572  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 		 85 aa  110  8.000000000000001e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.355414  normal  0.759943 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1754  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 		 85 aa  110  8.000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.163114  normal  0.0575884 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0588  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 90 aa  110  9e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0247  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0643  50S ribosomal protein L27  61.45 
 
 		 84 aa  109  1.0000000000000001e-23  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.301948  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05534  50S ribosomal protein L27  72.22 
 
 		 86 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000340822  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0510  50S ribosomal protein L27  65.12 
 
 		 87 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0309377  normal  0.755964 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0865  50S ribosomal protein L27  73.61 
 
 		 87 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.437144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3667  50S ribosomal protein L27  65.12 
 
 		 87 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000345306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2854  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 		 86 aa  109  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000234792  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4181  50S ribosomal protein L27  60 
 
 		 85 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.186505  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0552  50S ribosomal protein L27  65.12 
 
 		 87 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000367957  normal  0.045539 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2801  50S ribosomal protein L27  65.12 
 
 		 87 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000884705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0515  50S ribosomal protein L27  61.45 
 
 		 90 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3105  50S ribosomal protein L27  66.28 
 
 		 86 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2217  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 91 aa  109  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.856627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0100  50S ribosomal protein L27  65.12 
 
 		 87 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00352754  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1482  50S ribosomal protein L27  59.76 
 
 		 93 aa  108  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4334  50S ribosomal protein L27  60 
 
 		 85 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0485  50S ribosomal protein L27  65.12 
 
 		 87 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0162621  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0582  50S ribosomal protein L27  65.12 
 
 		 87 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00040366  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2237  ribosomal protein L27  60.23 
 
 		 91 aa  109  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4724  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 88 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0668122  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4312  50S ribosomal protein L27  60 
 
 		 85 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3235  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 85 aa  108  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000158281  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4496  50S ribosomal protein L27  60 
 
 		 85 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.191975  normal  0.508112 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3892  50S ribosomal protein L27  62.96 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.624543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0968  50S ribosomal protein L27  62.2 
 
 		 84 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000160226  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3196  50S ribosomal protein L27  60 
 
 		 85 aa  108  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000840306  unclonable  7.875010000000001e-24 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3322  50S ribosomal protein L27  62.2 
 
 		 84 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000182867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1070  50S ribosomal protein L27  62.2 
 
 		 84 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000153229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2115  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 		 95 aa  108  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000381623  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1037  50S ribosomal protein L27  62.2 
 
 		 84 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000911721  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0232  50S ribosomal protein L27  60.24 
 
 		 89 aa  107  4.0000000000000004e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0798  ribosomal protein L27  57.78 
 
 		 91 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2703  50S ribosomal protein L27  60.71 
 
 		 92 aa  107  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2575  50S ribosomal protein L27  60.71 
 
 		 92 aa  107  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0702  50S ribosomal protein L27  57.78 
 
 		 91 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.616074 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3088  50S ribosomal protein L27  62.2 
 
 		 84 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0195  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 86 aa  107  5e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000826463  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3651  50S ribosomal protein L27  62.2 
 
 		 84 aa  107  5e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2772  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 87 aa  107  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.436114  normal  0.118024 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0980  50S ribosomal protein L27  62.2 
 
 		 84 aa  107  5e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000110997  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1526  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 		 85 aa  107  5e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3218  50S ribosomal protein L27  62.2 
 
 		 84 aa  107  5e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3345  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 87 aa  107  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>