226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2566 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_2566  TrkA-N domain protein  100 
 
 		 336 aa  667    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0808  TrkA domain-containing protein  54.08 
 
 		 334 aa  393  1e-108  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.168839  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  27.97 
 
 		 335 aa  89.7  6e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  24.8 
 
 		 351 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2355  TrkA domain-containing protein  28.94 
 
 		 366 aa  75.5  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  23.32 
 
 		 332 aa  74.3  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  24.03 
 
 		 336 aa  73.2  0.000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  28.16 
 
 		 335 aa  72  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  26.12 
 
 		 341 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  23.89 
 
 		 330 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  22.87 
 
 		 332 aa  70.1  0.00000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  28.16 
 
 		 335 aa  69.7  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  24.18 
 
 		 325 aa  69.7  0.00000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3347  TrkA-N  26.59 
 
 		 352 aa  68.9  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220422  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2999  TrkA-N domain protein  26.57 
 
 		 388 aa  68.6  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  23.89 
 
 		 330 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  26.34 
 
 		 333 aa  68.2  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  27.35 
 
 		 335 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  23.89 
 
 		 334 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0556  TrkA domain-containing protein  22.87 
 
 		 346 aa  67.8  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3909  TrkA domain-containing protein  22.69 
 
 		 355 aa  67.4  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0877338 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  23.89 
 
 		 330 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  23.89 
 
 		 334 aa  67  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  24.6 
 
 		 350 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  23.01 
 
 		 337 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0968  TrkA-N domain protein  29.23 
 
 		 544 aa  67  0.0000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.153037 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4967  TrkA-N domain protein  29.57 
 
 		 398 aa  66.2  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  22.57 
 
 		 330 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  24.08 
 
 		 351 aa  65.1  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  24.79 
 
 		 350 aa  64.7  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  22.12 
 
 		 330 aa  64.7  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  22.87 
 
 		 332 aa  64.3  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0419  TrkA-N domain protein  20.92 
 
 		 313 aa  64.3  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3603  TrkA-N domain protein  30.91 
 
 		 335 aa  63.9  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.497588 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  23.67 
 
 		 350 aa  63.5  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0800  TrkA-N domain protein  27.31 
 
 		 331 aa  63.2  0.000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.632091 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0055  TrkA-N domain protein  23.62 
 
 		 336 aa  62  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  23.99 
 
 		 346 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1906  potassium efflux system protein  32.48 
 
 		 660 aa  61.2  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  21.18 
 
 		 371 aa  61.6  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  22.94 
 
 		 355 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000053583 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4663  TrkA domain-containing protein  25.89 
 
 		 359 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  23.08 
 
 		 350 aa  60.5  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3127  K+ transport systems, NAD-binding component  21.97 
 
 		 337 aa  60.1  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1162  TrkA-like protein  28.77 
 
 		 386 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.30388 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3499  TrkA-N domain protein  23.32 
 
 		 356 aa  59.7  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0133106  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10941  hypothetical protein  32.84 
 
 		 346 aa  59.3  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275534 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1611  sodium/hydrogen exchanger  30.77 
 
 		 660 aa  58.9  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4906  TrkA-N domain protein  24.88 
 
 		 368 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0415092 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0403  VIC family potassium channel protein  32.84 
 
 		 346 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.133961  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  25.94 
 
 		 346 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4403  TrkA domain-containing protein  30.52 
 
 		 341 aa  58.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.602366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5641  TrkA domain-containing protein  27.44 
 
 		 364 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.289182 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4504  TrkA domain-containing protein  27.44 
 
 		 364 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4046  TrkA domain-containing protein  27.91 
 
 		 364 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.809582 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13223  transmembrane cation transporter  25.33 
 
 		 355 aa  57  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14401  K+ transport system, NAD-binding component  24.89 
 
 		 352 aa  57.4  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000716154 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3710  TrkA-N  27.44 
 
 		 364 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360814  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4658  TrkA domain-containing protein  27.44 
 
 		 364 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.677832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1804  TrkA domain-containing protein  23.79 
 
 		 359 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.008758  normal  0.0737173 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4030  TrkA domain-containing protein  26.73 
 
 		 364 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.702941  normal  0.742816 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0360  TrkA-N:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  34.78 
 
 		 659 aa  56.2  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852363  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0720  TrkA-N  24.41 
 
 		 355 aa  56.2  0.0000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1364  TrkA domain-containing protein  25.23 
 
 		 369 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0669  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  27.27 
 
 		 663 aa  55.8  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.842993 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0361  TrkA-N domain protein  23.76 
 
 		 356 aa  55.8  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2540  TrkA domain-containing protein  25.23 
 
 		 369 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0305515  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1256  TrkA-N domain protein  28.23 
 
 		 350 aa  55.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.430368  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1406  TrkA-N  23.53 
 
 		 359 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.23449  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0418  TrkA-N domain protein  28.98 
 
 		 206 aa  55.5  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1424  TrkA domain-containing protein  23.53 
 
 		 359 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.753948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  22.96 
 
 		 350 aa  55.8  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1460  TrkA domain-containing protein  23.53 
 
 		 359 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0703342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1286  putative potassium channel protein  25.23 
 
 		 369 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1293  TrkA domain-containing protein  28.17 
 
 		 326 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0368  TrkA-N domain protein  23.76 
 
 		 356 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1460  TrkA domain-containing protein  27.4 
 
 		 413 aa  55.1  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2691  voltage-gated potassium channel  20.1 
 
 		 420 aa  54.7  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0127487 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0270  putative potassium channel protein  28.17 
 
 		 326 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.435171  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3093  voltage-gated potassium channel  20.1 
 
 		 420 aa  54.7  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0542  TrkA domain-containing protein  28.17 
 
 		 326 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1025  putative potassium channel protein  28.17 
 
 		 326 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1634  TrkA domain-containing protein  22.9 
 
 		 339 aa  53.9  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.853014  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1858  sodium/hydrogen exchanger  30.53 
 
 		 613 aa  54.3  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0587  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  32.48 
 
 		 669 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1138  TrkA-N domain protein  25.29 
 
 		 366 aa  53.9  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.576747  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0847  TrkA-N domain protein  27.27 
 
 		 359 aa  53.5  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0205361  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3731  hypothetical protein  22.75 
 
 		 338 aa  53.5  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000159336  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0492  potassium efflux system protein  32.48 
 
 		 663 aa  53.5  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491444  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1529  TrkA-N domain protein  25.31 
 
 		 395 aa  53.5  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1651  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  29.51 
 
 		 671 aa  53.1  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.899858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3503  TrkA domain-containing protein  26.47 
 
 		 261 aa  53.1  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0727  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  29.55 
 
 		 670 aa  53.1  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000025266  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0353  TrkA-N domain protein  26.72 
 
 		 542 aa  53.1  0.000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2703  sodium/hydrogen exchanger  30.77 
 
 		 670 aa  53.1  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.135864 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2171  sodium/hydrogen exchanger  30.77 
 
 		 668 aa  53.1  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2845  sodium/hydrogen exchanger  30.77 
 
 		 670 aa  52.8  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0613147  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2785  sodium/hydrogen exchanger  30.77 
 
 		 668 aa  53.1  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0657605  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0530  sodium/hydrogen exchanger  30.77 
 
 		 678 aa  52.8  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.191923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0308  sodium/hydrogen exchanger  25.82 
 
 		 674 aa  52.8  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.512225  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>