49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4661 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4661  quaternary amine transporter  100 
 
 		 198 aa  382  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0897553 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0350  cadmium resistance transporter  58.33 
 
 		 199 aa  204  7e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25750  predicted permease, cadmium resistance protein  59.38 
 
 		 198 aa  202  3e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2205  cadmium resistance transporter  61.66 
 
 		 198 aa  194  7e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5227  cadmium resistance transporter  56.88 
 
 		 218 aa  193  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.580258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25690  predicted permease, cadmium resistance protein  59 
 
 		 200 aa  186  2e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3180  cadmium resistance transporter  55.33 
 
 		 197 aa  186  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00474254  normal  0.961024 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20660  predicted permease, cadmium resistance protein  58 
 
 		 200 aa  182  4.0000000000000006e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2659  cadmium resistance transporter  57.81 
 
 		 196 aa  177  9e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5745  cadmium resistance transporter  54.82 
 
 		 199 aa  177  9e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3241  cadmium resistance transporter  56.35 
 
 		 199 aa  176  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2868  cadmium resistance transporter  55.28 
 
 		 201 aa  171  5e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3211  permease cadmium resistance protein-like protein  54.76 
 
 		 255 aa  171  6.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0284266  normal  0.131465 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3642  cadmium resistance transporter  56 
 
 		 202 aa  170  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2848  cadmium resistance transporter  46.43 
 
 		 212 aa  159  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.551645 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4310  cadmium resistance transporter  42.19 
 
 		 199 aa  139  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0103075  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4479  cadmium resistance transporter  42.19 
 
 		 199 aa  139  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4210  cadmium resistance transporter  42.19 
 
 		 199 aa  139  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2849  cadmium resistance transporter  40.11 
 
 		 238 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0347  cadmium resistance transporter  38.89 
 
 		 211 aa  124  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2866  cadmium resistance transporter  38.5 
 
 		 249 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000609266  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2457  cadmium resistance transporter  36.18 
 
 		 208 aa  122  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000531137  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0853  cadmium resistance transporter  38.76 
 
 		 199 aa  121  7e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2696  putative transport protein  36.18 
 
 		 208 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000223261 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0610  cadmium resistance transporter  53.03 
 
 		 139 aa  119  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5023  cadmium resistance transporter  37.37 
 
 		 250 aa  118  6e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257452  normal  0.407908 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4400  cadmium resistance transporter  35.68 
 
 		 214 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4404  cadmium resistance transporter  36.02 
 
 		 232 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0184  cadmium resistance transporter, putative  38.83 
 
 		 189 aa  107  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4467  cadmium resistance transporter  37.23 
 
 		 232 aa  104  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000272706  normal  0.331556 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5025  cadmium resistance transporter  34.08 
 
 		 228 aa  100  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0241386  normal  0.862178 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2497  quaternary ammonium compound-resistance protein, C-terminal  32.89 
 
 		 151 aa  100  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000463679  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1265  cadmium resistance transporter, putative  31.44 
 
 		 206 aa  96.7  2e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00419797  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1438  cadmium resistance transporter CadD  29.84 
 
 		 204 aa  94  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.799585  normal  0.500244 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4473  cadmium resistance transporter  31.16 
 
 		 224 aa  92.8  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.879748 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4410  cadmium resistance transporter  31.16 
 
 		 224 aa  92.8  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1370  cadmium resistance family protein  31.61 
 
 		 205 aa  90.9  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.128389  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2221  cadmium resistance family protein  32.99 
 
 		 205 aa  89.7  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.242988  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4463  cadmium resistance transporter  33.71 
 
 		 214 aa  89.4  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00350576  normal  0.203926 
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2796  cadmium resistance transporter CadD  33.85 
 
 		 205 aa  89  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2753  cadmium resistance transporter CadD  33.85 
 
 		 205 aa  89  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0956067  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4997  cadmium resistance transporter  26.6 
 
 		 224 aa  86.7  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000622218  normal  0.209664 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4909  cadmium resistance transporter  34.83 
 
 		 220 aa  76.6  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0699  cadmium resistance transporter, CadD family  28.42 
 
 		 201 aa  72  0.000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000313403  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0607  hypothetical protein  68.18 
 
 		 79 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4068  cadmium transporter  30.3 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0446991  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4076  cadmium transporter  30.77 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.999785  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1820  permease cadmium resistance protein-like protein  21.62 
 
 		 187 aa  45.4  0.0006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135691  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1136  permease, cadmium resistance protein  24.86 
 
 		 204 aa  45.1  0.0007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000632381  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>