48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5745 on replicon NC_008703
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008703  Mkms_5745  cadmium resistance transporter  100 
 
 
199 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0350  cadmium resistance transporter  85.28 
 
 
199 aa  314  4e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3241  cadmium resistance transporter  91.96 
 
 
199 aa  315  4e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2868  cadmium resistance transporter  89.05 
 
 
201 aa  313  9.999999999999999e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3642  cadmium resistance transporter  89.6 
 
 
202 aa  309  1e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3180  cadmium resistance transporter  84.26 
 
 
197 aa  308  4e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00474254  normal  0.961024 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25690  predicted permease, cadmium resistance protein  82.32 
 
 
200 aa  277  9e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20660  predicted permease, cadmium resistance protein  81.82 
 
 
200 aa  275  3e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25750  predicted permease, cadmium resistance protein  74.36 
 
 
198 aa  267  8e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2205  cadmium resistance transporter  73.98 
 
 
198 aa  249  2e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2659  cadmium resistance transporter  70.92 
 
 
196 aa  233  2.0000000000000002e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0610  cadmium resistance transporter  79.14 
 
 
139 aa  203  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4661  quaternary amine transporter  54.82 
 
 
198 aa  189  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0897553 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5227  cadmium resistance transporter  51.61 
 
 
218 aa  142  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.580258  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4479  cadmium resistance transporter  40.45 
 
 
199 aa  129  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4210  cadmium resistance transporter  40.45 
 
 
199 aa  129  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4310  cadmium resistance transporter  40.45 
 
 
199 aa  129  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0103075  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3211  permease cadmium resistance protein-like protein  44.52 
 
 
255 aa  124  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0284266  normal  0.131465 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2848  cadmium resistance transporter  39.51 
 
 
212 aa  117  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.551645 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0853  cadmium resistance transporter  41.99 
 
 
199 aa  111  7.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0347  cadmium resistance transporter  38.14 
 
 
211 aa  105  7e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2457  cadmium resistance transporter  30.88 
 
 
208 aa  99.4  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000531137  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0607  hypothetical protein  94.23 
 
 
79 aa  99  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2696  putative transport protein  30.88 
 
 
208 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000223261 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0184  cadmium resistance transporter, putative  35.32 
 
 
189 aa  92.8  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2866  cadmium resistance transporter  37.24 
 
 
249 aa  92.4  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000609266  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2849  cadmium resistance transporter  32.35 
 
 
238 aa  92  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4400  cadmium resistance transporter  29.73 
 
 
214 aa  84.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4404  cadmium resistance transporter  34.21 
 
 
232 aa  84.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2796  cadmium resistance transporter CadD  34.17 
 
 
205 aa  83.2  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2753  cadmium resistance transporter CadD  34.17 
 
 
205 aa  83.2  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0956067  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5025  cadmium resistance transporter  32.09 
 
 
228 aa  82.4  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0241386  normal  0.862178 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0699  cadmium resistance transporter, CadD family  31.44 
 
 
201 aa  80.9  0.00000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000313403  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2221  cadmium resistance family protein  31.66 
 
 
205 aa  80.5  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.242988  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1370  cadmium resistance family protein  30.73 
 
 
205 aa  80.5  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.128389  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1265  cadmium resistance transporter, putative  30.73 
 
 
206 aa  80.5  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00419797  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1438  cadmium resistance transporter CadD  28.64 
 
 
204 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.799585  normal  0.500244 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4467  cadmium resistance transporter  34.04 
 
 
232 aa  77.4  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000272706  normal  0.331556 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5023  cadmium resistance transporter  30.05 
 
 
250 aa  77.8  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257452  normal  0.407908 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2497  quaternary ammonium compound-resistance protein, C-terminal  31.51 
 
 
151 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000463679  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4473  cadmium resistance transporter  29.63 
 
 
224 aa  75.1  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.879748 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4410  cadmium resistance transporter  29.63 
 
 
224 aa  75.1  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4463  cadmium resistance transporter  30.27 
 
 
214 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00350576  normal  0.203926 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4997  cadmium resistance transporter  27.27 
 
 
224 aa  60.5  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000622218  normal  0.209664 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4076  cadmium transporter  28.74 
 
 
198 aa  59.7  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.999785  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4068  cadmium transporter  29.84 
 
 
202 aa  58.9  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0446991  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4909  cadmium resistance transporter  40.24 
 
 
220 aa  58.5  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1729  hypothetical protein  28.57 
 
 
185 aa  49.7  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>