47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5227 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5227  cadmium resistance transporter  100 
 
 		 218 aa  412  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.580258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4661  quaternary amine transporter  56.88 
 
 		 198 aa  223  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0897553 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25750  predicted permease, cadmium resistance protein  52.83 
 
 		 198 aa  188  5.999999999999999e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0350  cadmium resistance transporter  50.68 
 
 		 199 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2205  cadmium resistance transporter  50 
 
 		 198 aa  166  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25690  predicted permease, cadmium resistance protein  47.95 
 
 		 200 aa  156  2e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5745  cadmium resistance transporter  50.69 
 
 		 199 aa  156  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3241  cadmium resistance transporter  50.69 
 
 		 199 aa  154  8e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20660  predicted permease, cadmium resistance protein  47.03 
 
 		 200 aa  152  4e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2868  cadmium resistance transporter  50.24 
 
 		 201 aa  152  4e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3642  cadmium resistance transporter  50.23 
 
 		 202 aa  152  5e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3180  cadmium resistance transporter  46.54 
 
 		 197 aa  152  5e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00474254  normal  0.961024 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2659  cadmium resistance transporter  52.36 
 
 		 196 aa  152  5.9999999999999996e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2848  cadmium resistance transporter  40.78 
 
 		 212 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.551645 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3211  permease cadmium resistance protein-like protein  44.09 
 
 		 255 aa  137  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0284266  normal  0.131465 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4479  cadmium resistance transporter  36.5 
 
 		 199 aa  129  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4310  cadmium resistance transporter  36.5 
 
 		 199 aa  129  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0103075  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4210  cadmium resistance transporter  36.5 
 
 		 199 aa  129  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0853  cadmium resistance transporter  39.9 
 
 		 199 aa  124  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0347  cadmium resistance transporter  38.71 
 
 		 211 aa  123  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2866  cadmium resistance transporter  34.15 
 
 		 249 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000609266  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2849  cadmium resistance transporter  35.32 
 
 		 238 aa  112  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4400  cadmium resistance transporter  30.92 
 
 		 214 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5023  cadmium resistance transporter  30.48 
 
 		 250 aa  105  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257452  normal  0.407908 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0184  cadmium resistance transporter, putative  37.67 
 
 		 189 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2457  cadmium resistance transporter  26.03 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000531137  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4473  cadmium resistance transporter  30.88 
 
 		 224 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.879748 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4404  cadmium resistance transporter  33.33 
 
 		 232 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4410  cadmium resistance transporter  30.88 
 
 		 224 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2696  putative transport protein  26.03 
 
 		 208 aa  102  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000223261 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1438  cadmium resistance transporter CadD  32.69 
 
 		 204 aa  102  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.799585  normal  0.500244 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4467  cadmium resistance transporter  32.84 
 
 		 232 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000272706  normal  0.331556 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5025  cadmium resistance transporter  29.38 
 
 		 228 aa  96.7  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0241386  normal  0.862178 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4997  cadmium resistance transporter  28.08 
 
 		 224 aa  92.8  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000622218  normal  0.209664 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0610  cadmium resistance transporter  41.18 
 
 		 139 aa  92.4  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1265  cadmium resistance transporter, putative  27.88 
 
 		 206 aa  90.5  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00419797  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4463  cadmium resistance transporter  29.03 
 
 		 214 aa  88.6  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00350576  normal  0.203926 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2221  cadmium resistance family protein  28.57 
 
 		 205 aa  81.3  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.242988  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2497  quaternary ammonium compound-resistance protein, C-terminal  23.26 
 
 		 151 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000463679  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1370  cadmium resistance family protein  26.32 
 
 		 205 aa  79.3  0.00000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.128389  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2796  cadmium resistance transporter CadD  27.18 
 
 		 205 aa  77.8  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2753  cadmium resistance transporter CadD  27.18 
 
 		 205 aa  77.8  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0956067  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4909  cadmium resistance transporter  34.65 
 
 		 220 aa  78.2  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0607  hypothetical protein  64.81 
 
 		 79 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0699  cadmium resistance transporter, CadD family  25.48 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000313403  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1136  permease, cadmium resistance protein  31.4 
 
 		 204 aa  45.1  0.0009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000632381  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4068  cadmium transporter  27.57 
 
 		 202 aa  43.9  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0446991  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>