34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_4076 on replicon NC_013924
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013924  Nmag_4076  cadmium transporter  100 
 
 
198 aa  378  1e-104  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.999785  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4068  cadmium transporter  70.98 
 
 
202 aa  259  2e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0446991  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4210  cadmium resistance transporter  29.57 
 
 
199 aa  70.9  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4310  cadmium resistance transporter  29.57 
 
 
199 aa  70.9  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0103075  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4479  cadmium resistance transporter  29.57 
 
 
199 aa  70.9  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0184  cadmium resistance transporter, putative  27.32 
 
 
189 aa  65.1  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0350  cadmium resistance transporter  29.9 
 
 
199 aa  61.6  0.000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20660  predicted permease, cadmium resistance protein  31.38 
 
 
200 aa  56.6  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2868  cadmium resistance transporter  29.9 
 
 
201 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25690  predicted permease, cadmium resistance protein  31.38 
 
 
200 aa  57  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3642  cadmium resistance transporter  31.75 
 
 
202 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3241  cadmium resistance transporter  31.12 
 
 
199 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2848  cadmium resistance transporter  24.05 
 
 
212 aa  52  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.551645 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4661  quaternary amine transporter  30.57 
 
 
198 aa  51.6  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0897553 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5745  cadmium resistance transporter  29.9 
 
 
199 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2457  cadmium resistance transporter  24.44 
 
 
208 aa  50.1  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000531137  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2221  cadmium resistance family protein  22.75 
 
 
205 aa  49.3  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.242988  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5023  cadmium resistance transporter  25.26 
 
 
250 aa  49.3  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257452  normal  0.407908 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2696  putative transport protein  24.44 
 
 
208 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000223261 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0853  cadmium resistance transporter  25.95 
 
 
199 aa  48.1  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0347  cadmium resistance transporter  24.47 
 
 
211 aa  47.8  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4400  cadmium resistance transporter  24.29 
 
 
214 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2796  cadmium resistance transporter CadD  23.44 
 
 
205 aa  47  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2753  cadmium resistance transporter CadD  23.44 
 
 
205 aa  47  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0956067  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25750  predicted permease, cadmium resistance protein  29.74 
 
 
198 aa  45.8  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4404  cadmium resistance transporter  25.91 
 
 
232 aa  45.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1370  cadmium resistance family protein  21.69 
 
 
205 aa  45.4  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.128389  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4410  cadmium resistance transporter  23.75 
 
 
224 aa  45.1  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4473  cadmium resistance transporter  23.75 
 
 
224 aa  45.1  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.879748 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5025  cadmium resistance transporter  25.93 
 
 
228 aa  44.3  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0241386  normal  0.862178 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2849  cadmium resistance transporter  24.5 
 
 
238 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3180  cadmium resistance transporter  27.32 
 
 
197 aa  42.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00474254  normal  0.961024 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1438  cadmium resistance transporter CadD  25.13 
 
 
204 aa  42  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.799585  normal  0.500244 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2497  quaternary ammonium compound-resistance protein, C-terminal  26.14 
 
 
151 aa  41.6  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000463679  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>